More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1942 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 292 aa  597  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  64.04 
 
 		 292 aa  392  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  62.94 
 
 		 292 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  62.24 
 
 		 292 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  63.64 
 
 		 292 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  60.96 
 
 		 292 aa  359  3e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  57.88 
 
 		 291 aa  350  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  55.33 
 
 		 290 aa  349  4e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  55.33 
 
 		 290 aa  348  4e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  56.01 
 
 		 290 aa  347  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  56.36 
 
 		 290 aa  343  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  55.67 
 
 		 290 aa  339  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  53.95 
 
 		 290 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  54.3 
 
 		 290 aa  333  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  54.45 
 
 		 293 aa  322  4e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 293 aa  311  5.999999999999999e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  51.71 
 
 		 293 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  51.19 
 
 		 291 aa  304  1.0000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  52.13 
 
 		 291 aa  304  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  55.23 
 
 		 299 aa  301  6.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 		 293 aa  296  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  48.8 
 
 		 290 aa  296  3e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  51.23 
 
 		 297 aa  296  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  51.93 
 
 		 300 aa  295  5e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  50.89 
 
 		 294 aa  295  9e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  51.9 
 
 		 291 aa  294  1e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 		 319 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  51.71 
 
 		 292 aa  293  3e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 292 aa  291  6e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 		 326 aa  291  6e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 		 293 aa  291  8e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 292 aa  291  9e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  51.22 
 
 		 292 aa  291  9e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  48.96 
 
 		 288 aa  291  1e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  50.87 
 
 		 291 aa  290  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 293 aa  290  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2262  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 		 290 aa  290  2e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2234  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 		 290 aa  290  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  52.38 
 
 		 296 aa  290  2e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 		 294 aa  289  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 		 294 aa  289  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  47.59 
 
 		 289 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4694  dihydrodipicolinate synthase  54.58 
 
 		 296 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 		 296 aa  288  6e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 		 292 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  51.22 
 
 		 295 aa  287  1e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1870  dihydrodipicolinate synthase  53.79 
 
 		 297 aa  286  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.345659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  48.79 
 
 		 289 aa  287  2e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  48.29 
 
 		 292 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  52.55 
 
 		 298 aa  286  4e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  48.95 
 
 		 297 aa  285  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  51.21 
 
 		 291 aa  285  5e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 292 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  49.3 
 
 		 300 aa  285  7e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  47.59 
 
 		 289 aa  285  7e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  50.35 
 
 		 300 aa  285  7e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  47.04 
 
 		 300 aa  285  8e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 294 aa  285  8e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  46.88 
 
 		 289 aa  285  8e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  46.02 
 
 		 294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 		 291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 292 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  53.96 
 
 		 291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 		 291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 		 291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  49.13 
 
 		 293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 302 aa  283  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 292 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  48.95 
 
 		 300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  48.95 
 
 		 300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 287 aa  283  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  48.95 
 
 		 300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  48.95 
 
 		 300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  49.31 
 
 		 296 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  48.95 
 
 		 300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 		 297 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  48.95 
 
 		 300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  48.95 
 
 		 300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  45.67 
 
 		 294 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 		 291 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 296 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 		 296 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 		 296 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  50.34 
 
 		 292 aa  281  8.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 		 294 aa  281  9e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  49.64 
 
 		 301 aa  281  9e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  47.57 
 
 		 292 aa  281  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 296 aa  280  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  49.64 
 
 		 301 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  49.64 
 
 		 301 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  51.71 
 
 		 291 aa  280  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  50.55 
 
 		 293 aa  280  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 		 297 aa  279  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1992  dihydrodipicolinate synthase  51.71 
 
 		 291 aa  280  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.122144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0583  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 		 298 aa  280  3e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 		 296 aa  279  4e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  47.08 
 
 		 292 aa  279  4e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  48.79 
 
 		 293 aa  279  4e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 313 aa  278  6e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  47.2 
 
 		 320 aa  278  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>