More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_846 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_846  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
297 aa  608  1e-173  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  97.31 
 
 
297 aa  595  1e-169  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0864  dihydrodipicolinate synthase  96.97 
 
 
297 aa  591  1e-168  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  55.71 
 
 
295 aa  331  7.000000000000001e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  58.39 
 
 
296 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  58.39 
 
 
296 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  54.04 
 
 
296 aa  321  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  54.2 
 
 
292 aa  318  5e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  55.04 
 
 
291 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  53.63 
 
 
294 aa  316  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  54.86 
 
 
294 aa  316  4e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  53.24 
 
 
290 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  51.75 
 
 
297 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  52.05 
 
 
299 aa  309  2.9999999999999997e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4361  dihydrodipicolinate synthase  53.24 
 
 
294 aa  308  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  54.39 
 
 
292 aa  308  8e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  52.3 
 
 
296 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  52.43 
 
 
294 aa  305  5.0000000000000004e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0756  dihydrodipicolinate synthase  53.08 
 
 
296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.706325 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 
294 aa  299  4e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  50.86 
 
 
298 aa  293  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  49.29 
 
 
291 aa  292  5e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  48.62 
 
 
292 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  48.62 
 
 
292 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  48.62 
 
 
292 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  48.28 
 
 
292 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  48.28 
 
 
292 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  48.28 
 
 
292 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  48.28 
 
 
292 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  48.28 
 
 
292 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  48.28 
 
 
292 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17791  dihydrodipicolinate synthetase  52.38 
 
 
302 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  47.93 
 
 
296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18431  dihydrodipicolinate synthase  53.87 
 
 
302 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1745  dihydrodipicolinate synthase  53.51 
 
 
300 aa  271  7e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  48.26 
 
 
292 aa  271  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18431  dihydrodipicolinate synthase  51.74 
 
 
300 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18621  dihydrodipicolinate synthase  53.14 
 
 
300 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.696996  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1459  dihydrodipicolinate synthase  46.71 
 
 
295 aa  266  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.503779 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00721  dihydrodipicolinate synthase  52.65 
 
 
302 aa  265  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28982 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1251  dihydrodipicolinate synthase  51.11 
 
 
302 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21211  dihydrodipicolinate synthase  51.11 
 
 
315 aa  261  8e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0065  dihydrodipicolinate synthase  49.46 
 
 
302 aa  260  2e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1626  dihydrodipicolinate synthase  46.34 
 
 
296 aa  256  3e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0389231  hitchhiker  0.0000523491 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  43.77 
 
 
294 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  42.71 
 
 
294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  44.29 
 
 
319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  43.42 
 
 
294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  47.69 
 
 
292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  47.69 
 
 
292 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  44.29 
 
 
294 aa  251  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1729  dihydrodipicolinate synthase  43.51 
 
 
297 aa  250  2e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0274763  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  45.42 
 
 
294 aa  248  8e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  45.61 
 
 
300 aa  248  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  47.54 
 
 
295 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  43.93 
 
 
301 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  43.93 
 
 
301 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  47.54 
 
 
295 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  42.36 
 
 
293 aa  247  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  43.45 
 
 
308 aa  246  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  44.84 
 
 
292 aa  246  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  44.84 
 
 
292 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  43.21 
 
 
300 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  45.07 
 
 
294 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  43.21 
 
 
300 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  43.21 
 
 
300 aa  245  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 
292 aa  245  8e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  43.21 
 
 
301 aa  245  8e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  45.2 
 
 
297 aa  244  9e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  45.2 
 
 
287 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  45.2 
 
 
289 aa  244  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  43.21 
 
 
301 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  46.83 
 
 
295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  45.61 
 
 
292 aa  243  3e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  43.46 
 
 
300 aa  243  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  43.86 
 
 
291 aa  243  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1273  dihydrodipicolinate synthase  43.73 
 
 
311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  45.3 
 
 
293 aa  242  6e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  43.46 
 
 
300 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  43.46 
 
 
300 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  43.46 
 
 
300 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  43.46 
 
 
300 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  43.46 
 
 
300 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  43.46 
 
 
300 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  43.46 
 
 
300 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  44.25 
 
 
292 aa  240  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  43.25 
 
 
296 aa  240  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  44.6 
 
 
290 aa  240  2.9999999999999997e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  44.48 
 
 
292 aa  239  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  43.06 
 
 
292 aa  238  5.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 
292 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 
292 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7859  dihydrodipicolinate synthase  45.07 
 
 
308 aa  238  8e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  43.06 
 
 
296 aa  238  1e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  44.72 
 
 
320 aa  237  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  43.9 
 
 
294 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  43.42 
 
 
291 aa  237  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  41.49 
 
 
297 aa  236  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  43.62 
 
 
298 aa  236  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  43.62 
 
 
298 aa  236  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>