More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1134 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
295 aa  595  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  61.77 
 
 
297 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  60 
 
 
292 aa  359  3e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  57.59 
 
 
293 aa  344  8e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  58.97 
 
 
291 aa  340  1e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  58.97 
 
 
291 aa  340  2e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3342  dihydrodipicolinate synthase  55.33 
 
 
292 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3482  dihydrodipicolinate synthase  55.63 
 
 
294 aa  338  7e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000010244  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1762  dihydrodipicolinate synthase  51.55 
 
 
293 aa  324  9e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  50.69 
 
 
290 aa  296  3e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  52.08 
 
 
290 aa  296  4e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  52.08 
 
 
290 aa  294  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  50.35 
 
 
290 aa  290  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 
290 aa  289  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  50.35 
 
 
290 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  50.35 
 
 
290 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 
296 aa  276  3e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  47.04 
 
 
292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 
297 aa  270  2e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  46.21 
 
 
292 aa  269  5e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 
292 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  47.72 
 
 
292 aa  267  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  49.12 
 
 
289 aa  268  1e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 
292 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  46.21 
 
 
292 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  47.92 
 
 
298 aa  265  5.999999999999999e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  43.2 
 
 
300 aa  265  5.999999999999999e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  47.35 
 
 
287 aa  263  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 
292 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  47 
 
 
286 aa  262  4.999999999999999e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  48.06 
 
 
289 aa  262  4.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  44.18 
 
 
293 aa  261  8e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  44.48 
 
 
292 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  47.7 
 
 
289 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  48.41 
 
 
289 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  45.24 
 
 
294 aa  259  3e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  45.17 
 
 
292 aa  259  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  46.21 
 
 
292 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  46.21 
 
 
292 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  46.9 
 
 
292 aa  259  4e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  43.15 
 
 
294 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  46.9 
 
 
294 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  44.76 
 
 
292 aa  258  6e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  45.24 
 
 
294 aa  258  8e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  45.17 
 
 
291 aa  258  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  46.21 
 
 
293 aa  257  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 
319 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  42.7 
 
 
292 aa  256  3e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  44.29 
 
 
291 aa  255  7e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 
291 aa  254  8e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  43.79 
 
 
291 aa  254  9e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  47.02 
 
 
292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 
294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  45.61 
 
 
290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  43.25 
 
 
301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  42.18 
 
 
294 aa  253  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  44.37 
 
 
294 aa  253  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  43.25 
 
 
301 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 
293 aa  251  1e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  42.47 
 
 
294 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  43.25 
 
 
301 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  45.85 
 
 
296 aa  251  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  43.25 
 
 
301 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  44.28 
 
 
290 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  42.81 
 
 
293 aa  250  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  44.17 
 
 
288 aa  250  2e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  42.34 
 
 
291 aa  249  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  43.34 
 
 
296 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  42.56 
 
 
300 aa  248  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  42.56 
 
 
300 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  42.56 
 
 
300 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 
292 aa  247  1e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1848  dihydrodipicolinate synthase  43.54 
 
 
294 aa  247  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  41.1 
 
 
294 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 
297 aa  248  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 
314 aa  248  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  42.09 
 
 
291 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  43.45 
 
 
296 aa  246  3e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  41.44 
 
 
294 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  42.07 
 
 
290 aa  245  4.9999999999999997e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  44.48 
 
 
297 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  40.49 
 
 
295 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  41.7 
 
 
297 aa  245  6e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 
292 aa  245  6e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  41.87 
 
 
300 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  41.7 
 
 
292 aa  245  8e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 
292 aa  245  8e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 
291 aa  244  9e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  45.42 
 
 
295 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 
292 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  45.76 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  45.76 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  41.87 
 
 
300 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  45.05 
 
 
291 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  41.87 
 
 
300 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  41.87 
 
 
300 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  43.51 
 
 
291 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4361  dihydrodipicolinate synthase  44.44 
 
 
294 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  41.87 
 
 
300 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  41.78 
 
 
298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>