More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0526 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 293 aa  593  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  72.26 
 
 		 292 aa  449  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3342  dihydrodipicolinate synthase  56.01 
 
 		 292 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  60.27 
 
 		 297 aa  363  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  58.28 
 
 		 291 aa  347  1e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  58.28 
 
 		 291 aa  347  2e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  57.59 
 
 		 295 aa  344  8e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3482  dihydrodipicolinate synthase  57.88 
 
 		 294 aa  332  6e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000010244  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  51.38 
 
 		 290 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 		 290 aa  299  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 		 290 aa  295  5e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 		 290 aa  295  6e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  49.31 
 
 		 290 aa  294  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 		 290 aa  290  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  45.52 
 
 		 290 aa  281  8.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 		 291 aa  279  3e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1762  dihydrodipicolinate synthase  47.08 
 
 		 293 aa  276  2e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 		 293 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  44.48 
 
 		 292 aa  267  1e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  45.17 
 
 		 319 aa  265  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  44.83 
 
 		 294 aa  264  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  43.42 
 
 		 292 aa  264  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  49.3 
 
 		 288 aa  264  2e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  44.14 
 
 		 294 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  44.48 
 
 		 294 aa  263  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  45.17 
 
 		 292 aa  261  6.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  41.03 
 
 		 292 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 		 293 aa  258  7e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 		 292 aa  256  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 		 290 aa  257  2e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  43.3 
 
 		 292 aa  256  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 		 294 aa  256  3e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  43.31 
 
 		 292 aa  256  3e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  47.54 
 
 		 289 aa  256  4e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  43.3 
 
 		 292 aa  256  5e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  42.21 
 
 		 297 aa  255  6e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  48.24 
 
 		 289 aa  255  7e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  44.37 
 
 		 293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  40.34 
 
 		 300 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  43.45 
 
 		 294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  44.48 
 
 		 290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  42.41 
 
 		 296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  44.14 
 
 		 292 aa  253  3e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 		 292 aa  253  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  41.38 
 
 		 292 aa  253  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  44.98 
 
 		 291 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  41.81 
 
 		 291 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  42.81 
 
 		 292 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  43.49 
 
 		 292 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  47.54 
 
 		 289 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 		 292 aa  252  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 		 292 aa  251  7e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  41.92 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  43.06 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  45.26 
 
 		 286 aa  250  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  43.06 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  46.83 
 
 		 289 aa  249  3e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  42.18 
 
 		 294 aa  248  7e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  42.18 
 
 		 294 aa  248  9e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  42.71 
 
 		 301 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  42.36 
 
 		 301 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  42.11 
 
 		 295 aa  247  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  43.45 
 
 		 292 aa  246  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  43.86 
 
 		 287 aa  246  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  41.67 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  41.67 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  41.67 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 		 304 aa  246  4e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 		 292 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1848  dihydrodipicolinate synthase  45.49 
 
 		 294 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  44.44 
 
 		 295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  43.15 
 
 		 292 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  41.58 
 
 		 295 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  43.15 
 
 		 294 aa  242  5e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  41.24 
 
 		 295 aa  242  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1980  dihydrodipicolinate synthase  47.06 
 
 		 294 aa  242  6e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  41.55 
 
 		 296 aa  242  6e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 		 292 aa  241  7.999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  41.67 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  41.18 
 
 		 295 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 		 291 aa  241  1e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  43.39 
 
 		 295 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  43.69 
 
 		 302 aa  241  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  43.39 
 
 		 295 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  45.29 
 
 		 294 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 		 292 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0991  dihydrodipicolinate synthase  42.36 
 
 		 290 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  41.67 
 
 		 297 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  41.67 
 
 		 289 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  42.01 
 
 		 290 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  43.39 
 
 		 295 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  41.32 
 
 		 300 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  41.32 
 
 		 300 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  41.32 
 
 		 300 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  41.32 
 
 		 300 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  41.32 
 
 		 300 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  41.32 
 
 		 300 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  41.32 
 
 		 300 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 		 292 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>