More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0056 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
291 aa  597  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  59.79 
 
 
290 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  59.11 
 
 
290 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  59.11 
 
 
290 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  59.45 
 
 
290 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  58.76 
 
 
290 aa  363  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  58.42 
 
 
290 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  57.88 
 
 
292 aa  350  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  58.08 
 
 
292 aa  346  3e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  56.01 
 
 
292 aa  346  3e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  57.04 
 
 
290 aa  345  5e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  57.39 
 
 
292 aa  343  1e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  57.04 
 
 
292 aa  342  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  56.16 
 
 
293 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  56.7 
 
 
292 aa  323  2e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  52.92 
 
 
296 aa  314  9.999999999999999e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  51.56 
 
 
297 aa  310  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  54.61 
 
 
291 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  52.05 
 
 
290 aa  306  3e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 
293 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 
294 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 
292 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 
291 aa  300  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 
289 aa  298  8e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 
289 aa  296  3e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  53.66 
 
 
295 aa  294  1e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  51.88 
 
 
291 aa  293  2e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  50.86 
 
 
289 aa  293  2e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  49.32 
 
 
292 aa  292  4e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 
289 aa  291  8e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 
288 aa  290  2e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  50.86 
 
 
294 aa  286  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 
292 aa  286  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  47.97 
 
 
300 aa  285  5e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 
292 aa  285  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  51.55 
 
 
302 aa  285  7e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1992  dihydrodipicolinate synthase  50.87 
 
 
291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.122144  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  50.87 
 
 
291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  47.26 
 
 
292 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  47.26 
 
 
292 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  48.45 
 
 
293 aa  283  3.0000000000000004e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  47.24 
 
 
299 aa  281  6.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 
292 aa  280  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 
291 aa  281  1e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  48.63 
 
 
292 aa  281  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  48.29 
 
 
292 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  48.63 
 
 
292 aa  280  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 
297 aa  280  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 
292 aa  280  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 
293 aa  279  3e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 
292 aa  279  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 
292 aa  279  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  46.78 
 
 
294 aa  278  5e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 
291 aa  278  5e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 
291 aa  279  5e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 
292 aa  278  6e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  46.78 
 
 
294 aa  278  7e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  47.08 
 
 
292 aa  277  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 
292 aa  276  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.484069 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  47.44 
 
 
293 aa  276  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  48.14 
 
 
295 aa  275  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  45.89 
 
 
292 aa  275  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  48.14 
 
 
295 aa  275  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  49.47 
 
 
287 aa  275  7e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  52.36 
 
 
292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  50.7 
 
 
300 aa  274  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  47.26 
 
 
301 aa  274  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 
292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  48.62 
 
 
295 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  45.86 
 
 
296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 
292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  48.62 
 
 
295 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  47.26 
 
 
291 aa  274  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  47.46 
 
 
291 aa  273  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 
292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 
292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  47.8 
 
 
295 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 
295 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 
292 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  45.21 
 
 
292 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 
292 aa  272  5.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 
292 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 
292 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 
292 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 
291 aa  272  5.000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 
292 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  48.63 
 
 
291 aa  272  6e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  48.8 
 
 
313 aa  271  6e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 
292 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  46.92 
 
 
291 aa  271  1e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  45.36 
 
 
294 aa  271  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  46.76 
 
 
294 aa  271  1e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0354  dihydrodipicolinate synthase  52.76 
 
 
295 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.572016  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  46.6 
 
 
293 aa  270  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 
292 aa  271  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  46.21 
 
 
296 aa  271  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  46.6 
 
 
299 aa  270  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  46.6 
 
 
299 aa  270  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  45.33 
 
 
300 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  48.62 
 
 
298 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>