More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0515 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 297 aa  612  9.999999999999999e-175  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  62.16 
 
 		 296 aa  392  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  45.86 
 
 		 292 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  46.18 
 
 		 290 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  44.64 
 
 		 292 aa  271  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  45.52 
 
 		 292 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  47.24 
 
 		 292 aa  270  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  45.86 
 
 		 292 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  45.39 
 
 		 295 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  44.48 
 
 		 292 aa  262  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  45.39 
 
 		 295 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  44.44 
 
 		 290 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 		 292 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 		 292 aa  262  6e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  42.86 
 
 		 297 aa  261  8.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  44.71 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  44.83 
 
 		 297 aa  259  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  44.44 
 
 		 290 aa  259  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3482  dihydrodipicolinate synthase  43.54 
 
 		 294 aa  259  4e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000010244  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  42.12 
 
 		 293 aa  258  8e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  44.79 
 
 		 290 aa  258  9e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  42.21 
 
 		 293 aa  255  6e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  43.71 
 
 		 287 aa  255  7e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  43.15 
 
 		 292 aa  254  9e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  43.49 
 
 		 294 aa  253  3e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  43.49 
 
 		 294 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  42.71 
 
 		 291 aa  252  6e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1848  dihydrodipicolinate synthase  44.14 
 
 		 294 aa  251  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  41.38 
 
 		 292 aa  250  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  42.36 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  42.41 
 
 		 291 aa  249  5e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  43.25 
 
 		 292 aa  249  5e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  42.66 
 
 		 292 aa  249  5e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  40.96 
 
 		 294 aa  248  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  41.78 
 
 		 292 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  42.12 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  42.07 
 
 		 293 aa  246  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  40.82 
 
 		 294 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  43.75 
 
 		 290 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  40.96 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  44.98 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  38.85 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1762  dihydrodipicolinate synthase  40.62 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 		 290 aa  244  9.999999999999999e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  41.52 
 
 		 292 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  40.42 
 
 		 295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1702  dihydrodipicolinate synthase  43.4 
 
 		 294 aa  243  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000467042  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  43.06 
 
 		 290 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  43.06 
 
 		 290 aa  243  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  41.33 
 
 		 290 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2430  dihydrodipicolinate synthase  43.4 
 
 		 294 aa  242  5e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104748  hitchhiker  0.0000338239 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 		 294 aa  242  5e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  41.98 
 
 		 293 aa  242  6e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 		 292 aa  242  6e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 292 aa  241  1e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  41.87 
 
 		 292 aa  240  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1879  dihydrodipicolinate synthase  42.71 
 
 		 294 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1980  dihydrodipicolinate synthase  42.36 
 
 		 294 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  41.5 
 
 		 296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1656  dihydrodipicolinate synthase  42.71 
 
 		 294 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00451745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0843  dihydrodipicolinate synthase  43.15 
 
 		 290 aa  239  4e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0686751  normal  0.56042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0987  dihydrodipicolinate synthase  43.15 
 
 		 290 aa  239  4e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.193638  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 293 aa  239  5e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 		 292 aa  239  5e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  42.07 
 
 		 304 aa  238  5.999999999999999e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  40.48 
 
 		 296 aa  238  6.999999999999999e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  38.85 
 
 		 296 aa  238  6.999999999999999e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2340  dihydrodipicolinate synthase  42.36 
 
 		 294 aa  238  8e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00299163  hitchhiker  0.000000559319 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2412  dihydrodipicolinate synthase  42.36 
 
 		 294 aa  238  8e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0470285  hitchhiker  0.00564144 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  41.69 
 
 		 323 aa  238  9e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2177  dihydrodipicolinate synthase  42.36 
 
 		 294 aa  238  9e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000474227  normal  0.485402 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2552  dihydrodipicolinate synthase  42.71 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000411762  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2590  dihydrodipicolinate synthase  42.71 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000266276  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1792  dihydrodipicolinate synthase  42.71 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000368333  hitchhiker  0.00000000144356 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2667  dihydrodipicolinate synthase  42.71 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000190321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3342  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 		 292 aa  237  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  42.32 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  40.69 
 
 		 291 aa  237  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  38.78 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1908  dihydrodipicolinate synthase  43.49 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  42.18 
 
 		 300 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  40.88 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  42.71 
 
 		 290 aa  236  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  41.1 
 
 		 298 aa  236  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  41.02 
 
 		 321 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 		 301 aa  235  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 		 300 aa  235  7e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 		 292 aa  235  7e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  39.19 
 
 		 296 aa  235  8e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  40.69 
 
 		 302 aa  234  9e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 		 301 aa  234  9e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 		 301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  39.38 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  40.89 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  39.38 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  39.38 
 
 		 293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  39.66 
 
 		 293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>