More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3482 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3482  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
294 aa  599  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000010244  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  56.46 
 
 
297 aa  347  2e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  55.63 
 
 
295 aa  338  7e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  57.88 
 
 
293 aa  332  6e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  58.9 
 
 
292 aa  331  7.000000000000001e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  55.82 
 
 
291 aa  330  2e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  55.48 
 
 
291 aa  327  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3342  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 
292 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1762  dihydrodipicolinate synthase  48.98 
 
 
293 aa  296  4e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  51.37 
 
 
290 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 
290 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 
290 aa  277  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 
290 aa  275  7e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 
290 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 
290 aa  270  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 
290 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 
292 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  43.3 
 
 
292 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  45.14 
 
 
292 aa  259  4e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  43.54 
 
 
297 aa  259  4e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  44.18 
 
 
292 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  47.78 
 
 
291 aa  256  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 
296 aa  256  3e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  41.92 
 
 
292 aa  256  4e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  43.49 
 
 
292 aa  255  7e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  45.36 
 
 
292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  44.77 
 
 
292 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 
292 aa  253  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 
290 aa  253  3e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  44.21 
 
 
295 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  45.92 
 
 
293 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  41.89 
 
 
300 aa  251  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  44.9 
 
 
294 aa  248  6e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  44.03 
 
 
293 aa  247  2e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  46.02 
 
 
289 aa  247  2e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  44.64 
 
 
289 aa  246  3e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  43.54 
 
 
294 aa  245  6e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 
290 aa  245  6e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  44.64 
 
 
289 aa  245  6.999999999999999e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  41.36 
 
 
294 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  44.98 
 
 
289 aa  244  9e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  41.69 
 
 
294 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  44.21 
 
 
291 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  43.94 
 
 
288 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  43.54 
 
 
294 aa  242  5e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  43.88 
 
 
319 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 
292 aa  242  7e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  42.35 
 
 
292 aa  241  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  42.47 
 
 
293 aa  241  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  43.15 
 
 
304 aa  239  2.9999999999999997e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  42.32 
 
 
291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2262  dihydrodipicolinate synthase  42.12 
 
 
290 aa  239  5e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  44.03 
 
 
291 aa  239  5e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  45.49 
 
 
296 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  45.39 
 
 
290 aa  238  8e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  44.96 
 
 
291 aa  238  9e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 
287 aa  237  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  42.71 
 
 
296 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  42.47 
 
 
292 aa  238  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2234  dihydrodipicolinate synthase  41.44 
 
 
290 aa  237  2e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  43.1 
 
 
295 aa  237  2e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  43.73 
 
 
292 aa  237  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1848  dihydrodipicolinate synthase  42.47 
 
 
294 aa  236  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  44.22 
 
 
293 aa  236  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  43.62 
 
 
292 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  42.86 
 
 
298 aa  236  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  42.86 
 
 
298 aa  236  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  42.47 
 
 
292 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  42.47 
 
 
292 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  43.39 
 
 
323 aa  235  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  43.1 
 
 
297 aa  235  6e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  42.52 
 
 
293 aa  235  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  43.88 
 
 
294 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  42.52 
 
 
299 aa  235  8e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  42.52 
 
 
299 aa  235  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  42.32 
 
 
292 aa  234  9e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  45.72 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  42.32 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  41.44 
 
 
292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  42.52 
 
 
291 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  45.35 
 
 
301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  45.35 
 
 
301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  41.5 
 
 
298 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  42.32 
 
 
292 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  42.32 
 
 
292 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  42.32 
 
 
292 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  42.32 
 
 
292 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  42.05 
 
 
294 aa  232  5e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  43.49 
 
 
292 aa  232  5e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  44.61 
 
 
300 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  45.35 
 
 
301 aa  232  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  43 
 
 
307 aa  232  6e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  44.61 
 
 
300 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  42.32 
 
 
292 aa  232  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  44.61 
 
 
300 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 
293 aa  232  7.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  41.44 
 
 
294 aa  231  9e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  39.65 
 
 
292 aa  231  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 
297 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  43.51 
 
 
294 aa  231  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>