More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1874 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 292 aa  600  1.0000000000000001e-171  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  70.55 
 
 		 292 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  69.52 
 
 		 292 aa  433  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  68.49 
 
 		 292 aa  430  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  68.15 
 
 		 292 aa  422  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  60.96 
 
 		 292 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  56.7 
 
 		 291 aa  334  9e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  54.64 
 
 		 290 aa  328  6e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  54.64 
 
 		 290 aa  328  9e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  53.1 
 
 		 290 aa  325  4.0000000000000003e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  54.98 
 
 		 293 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  53.79 
 
 		 290 aa  318  7e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  52.58 
 
 		 290 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  51.72 
 
 		 290 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  50.86 
 
 		 299 aa  308  6.999999999999999e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  50.51 
 
 		 297 aa  308  9e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  50.69 
 
 		 300 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  48.98 
 
 		 294 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  50.69 
 
 		 298 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  50.86 
 
 		 290 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  52.07 
 
 		 291 aa  304  1.0000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  50.86 
 
 		 296 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  50.69 
 
 		 297 aa  301  6.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 		 296 aa  300  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  48.8 
 
 		 296 aa  300  2e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  48.8 
 
 		 300 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 		 296 aa  300  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  48.8 
 
 		 293 aa  298  5e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4694  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 		 296 aa  296  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 		 292 aa  295  4e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 		 292 aa  295  5e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  47.93 
 
 		 297 aa  295  5e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  54.01 
 
 		 295 aa  295  7e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 		 294 aa  295  8e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1870  dihydrodipicolinate synthase  51.72 
 
 		 297 aa  289  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.345659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 		 291 aa  289  4e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2961  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 296 aa  288  6e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  48.14 
 
 		 300 aa  287  1e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  46.92 
 
 		 296 aa  285  8e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1890  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 		 296 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  46.53 
 
 		 290 aa  283  2.0000000000000002e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  45.05 
 
 		 294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 		 290 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  49.32 
 
 		 295 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 		 293 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2640  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 296 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  44.37 
 
 		 294 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2629  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 		 319 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.121971 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2262  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 296 aa  282  5.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 		 293 aa  282  5.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  47.93 
 
 		 292 aa  281  6.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 294 aa  281  7.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  51.36 
 
 		 300 aa  280  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  47.06 
 
 		 289 aa  280  1e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  50.18 
 
 		 293 aa  280  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 		 293 aa  280  3e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  46.71 
 
 		 289 aa  279  5e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  46.42 
 
 		 301 aa  278  7e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  48.29 
 
 		 294 aa  278  9e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  45.73 
 
 		 301 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  48.63 
 
 		 291 aa  277  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  47.59 
 
 		 326 aa  277  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  46.42 
 
 		 300 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 		 293 aa  278  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  46.42 
 
 		 300 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  46.42 
 
 		 301 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  46.42 
 
 		 300 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  48.1 
 
 		 291 aa  276  2e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  45.73 
 
 		 301 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  48.42 
 
 		 292 aa  276  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  47.06 
 
 		 289 aa  276  3e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  47.93 
 
 		 291 aa  275  5e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  48.28 
 
 		 290 aa  275  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1204  dihydrodipicolinate synthase  49.3 
 
 		 298 aa  275  6e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.247588  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  47.06 
 
 		 289 aa  275  6e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  47.75 
 
 		 292 aa  275  8e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 		 298 aa  275  8e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  44.18 
 
 		 294 aa  275  9e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  47.75 
 
 		 292 aa  275  9e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 		 297 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0827  dihydrodipicolinate synthase  48.94 
 
 		 298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.179848  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0897  dihydrodipicolinate synthase  48.94 
 
 		 298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  47.26 
 
 		 294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  45.39 
 
 		 300 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  46.92 
 
 		 291 aa  272  5.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  46.9 
 
 		 295 aa  272  6e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  48.44 
 
 		 291 aa  271  7e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  45.05 
 
 		 300 aa  270  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  45.05 
 
 		 300 aa  270  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 		 294 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  45.05 
 
 		 300 aa  270  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  45.05 
 
 		 300 aa  270  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  45.05 
 
 		 300 aa  270  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  45.05 
 
 		 300 aa  270  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  44.98 
 
 		 288 aa  271  1e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  45.05 
 
 		 300 aa  270  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  47.75 
 
 		 292 aa  270  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>