More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0946 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
294 aa  598  1e-170  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  69.15 
 
 
295 aa  438  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  65.99 
 
 
297 aa  425  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  65.99 
 
 
296 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  59.86 
 
 
294 aa  369  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  60.96 
 
 
292 aa  364  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  60.42 
 
 
292 aa  358  6e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  59.25 
 
 
296 aa  358  8e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  59.25 
 
 
296 aa  358  8e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  57.84 
 
 
299 aa  353  2e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  59.09 
 
 
291 aa  351  7e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  57.29 
 
 
291 aa  351  7e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4361  dihydrodipicolinate synthase  60.96 
 
 
294 aa  349  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0756  dihydrodipicolinate synthase  59.59 
 
 
296 aa  349  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.706325 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  56.16 
 
 
294 aa  346  3e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  58.19 
 
 
290 aa  342  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  56.66 
 
 
296 aa  339  2.9999999999999998e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  54.79 
 
 
294 aa  336  2.9999999999999997e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  52.94 
 
 
298 aa  325  7e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  53.31 
 
 
292 aa  314  9e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  52.61 
 
 
292 aa  314  9e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  53.31 
 
 
292 aa  314  9e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  53.85 
 
 
296 aa  314  9.999999999999999e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  53.31 
 
 
292 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  53.31 
 
 
292 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  53.31 
 
 
292 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  53.31 
 
 
292 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  53.31 
 
 
292 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  53.31 
 
 
292 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_846  dihydrodipicolinate synthase  52.43 
 
 
297 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0864  dihydrodipicolinate synthase  51.74 
 
 
297 aa  302  5.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  51.39 
 
 
297 aa  301  7.000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  53.31 
 
 
292 aa  298  5e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1459  dihydrodipicolinate synthase  48.4 
 
 
295 aa  288  8e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.503779 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18431  dihydrodipicolinate synthase  50.35 
 
 
300 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1626  dihydrodipicolinate synthase  47.08 
 
 
296 aa  280  3e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0389231  hitchhiker  0.0000523491 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1251  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 
302 aa  278  9e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18621  dihydrodipicolinate synthase  49.65 
 
 
300 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.696996  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1745  dihydrodipicolinate synthase  50.18 
 
 
300 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21211  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 
315 aa  275  6e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18431  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 
302 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17791  dihydrodipicolinate synthetase  50.89 
 
 
302 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0065  dihydrodipicolinate synthase  51.25 
 
 
302 aa  271  1e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1199  dihydrodipicolinate synthase  48.44 
 
 
321 aa  267  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  45.17 
 
 
290 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  45.17 
 
 
290 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00721  dihydrodipicolinate synthase  53.79 
 
 
302 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28982 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  49.47 
 
 
308 aa  264  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  43.79 
 
 
290 aa  263  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0068  dihydrodipicolinate synthase  53.02 
 
 
302 aa  262  4.999999999999999e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  42.76 
 
 
290 aa  262  4.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 
292 aa  261  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  44.14 
 
 
290 aa  260  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  41.98 
 
 
294 aa  259  4e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  45.45 
 
 
297 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  42.07 
 
 
290 aa  258  7e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7859  dihydrodipicolinate synthase  46.85 
 
 
308 aa  258  8e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2168  dihydrodipicolinate synthase  47.35 
 
 
308 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  42.07 
 
 
290 aa  256  4e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  43.66 
 
 
292 aa  255  5e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  41.05 
 
 
297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25250  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 
341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  44.79 
 
 
296 aa  253  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  42.18 
 
 
295 aa  253  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  44.76 
 
 
319 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07550  dihydrodipicolinate synthase  42.41 
 
 
300 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.02513  normal  0.756847 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  47.37 
 
 
295 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  43.2 
 
 
294 aa  252  6e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1389  dihydrodipicolinate synthase  49.12 
 
 
308 aa  251  7e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  43.2 
 
 
294 aa  252  7e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1080  dihydrodipicolinate synthase  46.5 
 
 
305 aa  250  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  hitchhiker  0.00385638 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  44.03 
 
 
292 aa  250  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  43.71 
 
 
294 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  44.12 
 
 
296 aa  249  5e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  43.66 
 
 
300 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  43.36 
 
 
294 aa  247  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  43.36 
 
 
300 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  43.36 
 
 
300 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  41.98 
 
 
292 aa  246  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  43.71 
 
 
320 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  42.25 
 
 
293 aa  245  6e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  40.96 
 
 
292 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  43.01 
 
 
294 aa  244  9e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  42.14 
 
 
297 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  43.15 
 
 
293 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12766  dihydrodipicolinate synthase  43.45 
 
 
300 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  42.31 
 
 
294 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  43.48 
 
 
297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  43.55 
 
 
291 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  42.66 
 
 
301 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1347  dihydrodipicolinate synthase  47.87 
 
 
308 aa  243  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0665282  decreased coverage  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  43.01 
 
 
291 aa  243  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  42.66 
 
 
301 aa  243  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  42.66 
 
 
293 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  41.64 
 
 
292 aa  243  3e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  42.07 
 
 
292 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3544  dihydrodipicolinate synthase  47.4 
 
 
352 aa  242  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.136616  normal  0.330927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0646  dihydrodipicolinate synthase  46.34 
 
 
323 aa  242  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.31968 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  41.96 
 
 
291 aa  242  6e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1729  dihydrodipicolinate synthase  42.03 
 
 
297 aa  241  9e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0274763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>