More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0358 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
290 aa  593  1e-168  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  56.16 
 
 
293 aa  340  2e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  52.78 
 
 
297 aa  322  5e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  52.92 
 
 
290 aa  315  6e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  52.58 
 
 
290 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  49.65 
 
 
292 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  50.87 
 
 
289 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  52.23 
 
 
290 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  50.86 
 
 
290 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  50.86 
 
 
290 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 
289 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  52.05 
 
 
291 aa  306  3e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  48.79 
 
 
289 aa  305  6e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  48.1 
 
 
288 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  49.13 
 
 
289 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  51.89 
 
 
290 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 
292 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  47.59 
 
 
292 aa  300  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  46.88 
 
 
292 aa  298  7e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  48.8 
 
 
292 aa  296  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  48.45 
 
 
290 aa  296  3e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 
294 aa  291  9e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0897  dihydrodipicolinate synthase  47.08 
 
 
298 aa  290  2e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0827  dihydrodipicolinate synthase  47.08 
 
 
298 aa  290  2e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.179848  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 
294 aa  289  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0583  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 
298 aa  290  3e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 
293 aa  288  6e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  48.45 
 
 
319 aa  287  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 
294 aa  285  7e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1204  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 
298 aa  285  9e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.247588  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 
297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1138  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 
297 aa  278  5e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.635374  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1058  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 
297 aa  278  7e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  46.53 
 
 
292 aa  278  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0784  dihydrodipicolinate synthase  45.83 
 
 
297 aa  276  2e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  46.53 
 
 
296 aa  276  3e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  47.08 
 
 
300 aa  276  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 
300 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 
300 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 
300 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 
300 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 
300 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 
300 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 
300 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  48.07 
 
 
301 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  44.98 
 
 
296 aa  272  5.000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  46.53 
 
 
297 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 
304 aa  271  8.000000000000001e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  45.36 
 
 
294 aa  271  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2308  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  46.71 
 
 
313 aa  271  8.000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 
292 aa  270  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3191  dihydrodipicolinate synthase  44.83 
 
 
297 aa  271  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0102406  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  47.08 
 
 
300 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  47.08 
 
 
300 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 
292 aa  271  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  42.86 
 
 
294 aa  270  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  48.07 
 
 
301 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  48.07 
 
 
300 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  48.25 
 
 
301 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  45.36 
 
 
292 aa  269  4e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1335  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  44.98 
 
 
313 aa  268  7e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.106036 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 
320 aa  268  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0120  dihydrodipicolinate synthase  44.14 
 
 
297 aa  267  1e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.380726  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  42.86 
 
 
294 aa  268  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  47.9 
 
 
301 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  45.39 
 
 
291 aa  266  4e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  44.25 
 
 
297 aa  265  7e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 
292 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  44.18 
 
 
292 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  46.39 
 
 
302 aa  264  1e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  43.15 
 
 
296 aa  264  1e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  43.3 
 
 
308 aa  263  2e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  45.89 
 
 
292 aa  263  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 
297 aa  263  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 
296 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0626  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 
298 aa  263  3e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3342  dihydrodipicolinate synthase  44.25 
 
 
292 aa  262  6e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 
298 aa  261  6.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  44.18 
 
 
292 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  44.48 
 
 
299 aa  261  8.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  44.64 
 
 
293 aa  261  1e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  45.76 
 
 
307 aa  261  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  43.1 
 
 
291 aa  261  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 
296 aa  260  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 
298 aa  260  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 
323 aa  260  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 
298 aa  260  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 
296 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 
296 aa  259  4e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 
293 aa  258  8e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  44.18 
 
 
291 aa  258  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  41.92 
 
 
313 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  43.34 
 
 
291 aa  257  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  45.08 
 
 
295 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  45.08 
 
 
295 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  44.03 
 
 
291 aa  257  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 
293 aa  257  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  45.77 
 
 
298 aa  256  3e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  45.08 
 
 
295 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  44.25 
 
 
290 aa  256  4e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>