More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0258 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 293 aa  598  1e-170  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  44.37 
 
 		 292 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  47.06 
 
 		 308 aa  267  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  45.39 
 
 		 292 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 293 aa  265  8.999999999999999e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  46.92 
 
 		 296 aa  264  1e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 		 290 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  43.21 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  44.64 
 
 		 290 aa  261  1e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 		 290 aa  261  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  42.51 
 
 		 292 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  45.3 
 
 		 292 aa  258  9e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 		 290 aa  258  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  45.52 
 
 		 291 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  41.72 
 
 		 292 aa  257  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 		 290 aa  256  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  45.89 
 
 		 290 aa  256  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  45.39 
 
 		 291 aa  255  7e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  46.95 
 
 		 301 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  46.95 
 
 		 301 aa  252  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  46.07 
 
 		 299 aa  252  6e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  45.52 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  46.1 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  46.21 
 
 		 301 aa  249  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  43.05 
 
 		 295 aa  249  3e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3191  dihydrodipicolinate synthase  46.83 
 
 		 297 aa  250  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0102406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  44.56 
 
 		 320 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  46.21 
 
 		 301 aa  249  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  45.1 
 
 		 297 aa  249  5e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  45.86 
 
 		 300 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  45.86 
 
 		 300 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  45.86 
 
 		 300 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  44.56 
 
 		 300 aa  248  8e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  41.24 
 
 		 294 aa  247  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 		 291 aa  247  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1611  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 		 292 aa  247  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  42.32 
 
 		 290 aa  246  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  43.88 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  43.88 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  43.88 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  43.88 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  43.88 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  43.88 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  43.88 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  42.32 
 
 		 290 aa  246  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 		 302 aa  244  9e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  44.03 
 
 		 298 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  44.71 
 
 		 297 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  44.79 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  45.05 
 
 		 319 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  45.49 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  43.49 
 
 		 296 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 		 291 aa  242  5e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  41.5 
 
 		 296 aa  242  5e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  43.1 
 
 		 289 aa  242  5e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  47.1 
 
 		 300 aa  242  6e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  42.76 
 
 		 290 aa  242  6e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  42.52 
 
 		 294 aa  242  6e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  46.57 
 
 		 294 aa  242  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0897  dihydrodipicolinate synthase  40.34 
 
 		 298 aa  241  9e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0827  dihydrodipicolinate synthase  40.34 
 
 		 298 aa  241  9e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.179848  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1204  dihydrodipicolinate synthase  40.34 
 
 		 298 aa  241  1e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.247588  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  43 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  42.18 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  42.66 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  43.15 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  43.15 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  43.88 
 
 		 308 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0575  dihydrodipicolinate synthase  44.21 
 
 		 296 aa  239  4e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  39.18 
 
 		 292 aa  239  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  43.49 
 
 		 293 aa  239  5.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  44.73 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  45.62 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  42.65 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  41.78 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  45.29 
 
 		 296 aa  236  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  39.86 
 
 		 304 aa  236  3e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  42.56 
 
 		 298 aa  236  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  42.07 
 
 		 289 aa  236  3e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0991  dihydrodipicolinate synthase  43.1 
 
 		 290 aa  236  3e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  42.66 
 
 		 293 aa  236  4e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  41.1 
 
 		 296 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  42.07 
 
 		 289 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  45.29 
 
 		 296 aa  235  8e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  41.72 
 
 		 289 aa  234  9e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  43.49 
 
 		 296 aa  234  9e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  43.69 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  43.69 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  44.41 
 
 		 292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  40.61 
 
 		 297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  43.45 
 
 		 292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 		 298 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  41.44 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  44.18 
 
 		 293 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  42.81 
 
 		 292 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1890  dihydrodipicolinate synthase  45.65 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  44.44 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  43.1 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  44.41 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>