More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0941 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
293 aa  599  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  75.43 
 
 
293 aa  472  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  74.74 
 
 
293 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  74.74 
 
 
293 aa  468  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  74.15 
 
 
294 aa  451  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  72.45 
 
 
294 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  72.11 
 
 
294 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  70.75 
 
 
294 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  62.33 
 
 
294 aa  407  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  67.47 
 
 
299 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  68.15 
 
 
290 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  68.49 
 
 
295 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  68.49 
 
 
290 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  65.07 
 
 
296 aa  381  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0150  dihydrodipicolinate synthase  68.49 
 
 
299 aa  381  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.613999  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  64.26 
 
 
296 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  62.2 
 
 
297 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  64.6 
 
 
296 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  63.92 
 
 
296 aa  378  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  64.16 
 
 
291 aa  375  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  65.07 
 
 
291 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  63.48 
 
 
291 aa  372  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  62.12 
 
 
291 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  62.67 
 
 
300 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  62.67 
 
 
300 aa  368  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1890  dihydrodipicolinate synthase  66.67 
 
 
299 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  65.07 
 
 
296 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  61.17 
 
 
298 aa  364  1e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4694  dihydrodipicolinate synthase  64.73 
 
 
296 aa  362  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  61.43 
 
 
293 aa  362  4e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2262  dihydrodipicolinate synthase  64.38 
 
 
296 aa  358  5e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  62.33 
 
 
292 aa  358  6e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2640  dihydrodipicolinate synthase  65.41 
 
 
296 aa  358  7e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2961  dihydrodipicolinate synthase  62.33 
 
 
296 aa  353  1e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1870  dihydrodipicolinate synthase  64.04 
 
 
297 aa  352  5e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.345659  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2629  dihydrodipicolinate synthase  62.33 
 
 
319 aa  348  7e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.121971 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  56.8 
 
 
293 aa  321  9.999999999999999e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  55.33 
 
 
326 aa  315  7e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  54.95 
 
 
293 aa  315  8e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0517  dihydrodipicolinate synthase  60.69 
 
 
292 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1443  dihydrodipicolinate synthase  53.74 
 
 
296 aa  308  9e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2923  dihydrodipicolinate synthase  51.37 
 
 
290 aa  293  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 
292 aa  291  7e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 
292 aa  286  2e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 
292 aa  286  4e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  52.22 
 
 
291 aa  285  5.999999999999999e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  49.13 
 
 
292 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 
294 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  48.81 
 
 
292 aa  280  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  48.46 
 
 
292 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 
294 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  48.46 
 
 
292 aa  280  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  48.46 
 
 
292 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  48.46 
 
 
292 aa  280  3e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  48.46 
 
 
292 aa  280  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  48.46 
 
 
292 aa  280  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  48.46 
 
 
292 aa  280  3e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  48.46 
 
 
292 aa  279  4e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  49.15 
 
 
292 aa  279  4e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 
319 aa  278  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  48.12 
 
 
292 aa  278  6e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  48.12 
 
 
292 aa  278  6e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 
291 aa  278  7e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 
294 aa  278  9e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 
292 aa  277  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  48.46 
 
 
292 aa  278  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  46.76 
 
 
293 aa  277  2e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  48.79 
 
 
293 aa  277  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  47.78 
 
 
292 aa  275  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  47.78 
 
 
292 aa  275  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  47.78 
 
 
292 aa  275  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  47.78 
 
 
292 aa  275  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  47.78 
 
 
292 aa  275  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 
300 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 
292 aa  275  7e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  46.94 
 
 
293 aa  275  8e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 
302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  50.86 
 
 
302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  48.8 
 
 
300 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  49.13 
 
 
293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 
300 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 
300 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 
301 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 
301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  48.45 
 
 
300 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  48.45 
 
 
300 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  48.45 
 
 
300 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  48.45 
 
 
300 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  48.45 
 
 
300 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  48.45 
 
 
300 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  48.45 
 
 
300 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  48.64 
 
 
299 aa  272  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  47.8 
 
 
307 aa  272  4.0000000000000004e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  48.64 
 
 
293 aa  272  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  48.64 
 
 
299 aa  272  4.0000000000000004e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  48.63 
 
 
291 aa  272  5.000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  48.8 
 
 
301 aa  271  7e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2379  dihydrodipicolinate synthase  48.3 
 
 
293 aa  271  8.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  46.92 
 
 
292 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  47.44 
 
 
292 aa  271  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.484069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>