More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0848 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 298 aa  608  1e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1870  dihydrodipicolinate synthase  72.73 
 
 		 297 aa  441  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.345659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  67.47 
 
 		 300 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  64.31 
 
 		 300 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  65.74 
 
 		 296 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  65.05 
 
 		 296 aa  401  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  63.05 
 
 		 296 aa  398  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  64.71 
 
 		 296 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  63.32 
 
 		 299 aa  396  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2961  dihydrodipicolinate synthase  66.1 
 
 		 296 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  67.12 
 
 		 296 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2629  dihydrodipicolinate synthase  66.21 
 
 		 319 aa  387  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.121971 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2640  dihydrodipicolinate synthase  65.76 
 
 		 296 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4694  dihydrodipicolinate synthase  63.73 
 
 		 296 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  61.59 
 
 		 291 aa  375  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  59.79 
 
 		 293 aa  368  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2262  dihydrodipicolinate synthase  62.03 
 
 		 296 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1890  dihydrodipicolinate synthase  62.54 
 
 		 299 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  59.79 
 
 		 293 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  59.73 
 
 		 293 aa  365  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  61.17 
 
 		 293 aa  364  1e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  59.17 
 
 		 297 aa  360  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  58.98 
 
 		 295 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  59.86 
 
 		 290 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  59.52 
 
 		 291 aa  356  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  58.13 
 
 		 290 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  58.22 
 
 		 294 aa  342  5e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  54.98 
 
 		 294 aa  341  1e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  56.7 
 
 		 293 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  57.53 
 
 		 294 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  55.82 
 
 		 294 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  58.28 
 
 		 292 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  57.88 
 
 		 294 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  56.9 
 
 		 291 aa  328  8e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0150  dihydrodipicolinate synthase  58.08 
 
 		 299 aa  325  7e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.613999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  53.98 
 
 		 291 aa  322  4e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  54.24 
 
 		 326 aa  318  7.999999999999999e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  54.64 
 
 		 293 aa  314  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  53.29 
 
 		 293 aa  314  9.999999999999999e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  51.72 
 
 		 292 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2923  dihydrodipicolinate synthase  53.57 
 
 		 290 aa  307  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  49.31 
 
 		 292 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  50.69 
 
 		 292 aa  295  5e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  52.41 
 
 		 291 aa  294  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1443  dihydrodipicolinate synthase  48.63 
 
 		 296 aa  288  8e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 		 300 aa  287  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 		 300 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 		 300 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 		 300 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 		 300 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 		 300 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 		 300 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 		 300 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  47.24 
 
 		 292 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  52.55 
 
 		 292 aa  286  4e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 		 302 aa  285  5e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 		 298 aa  285  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  48.61 
 
 		 294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  48.61 
 
 		 294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  47.37 
 
 		 292 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  50.35 
 
 		 293 aa  282  4.0000000000000003e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 		 301 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 		 292 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  49.13 
 
 		 292 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0517  dihydrodipicolinate synthase  52.42 
 
 		 292 aa  281  9e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  47.57 
 
 		 294 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  51.4 
 
 		 296 aa  279  3e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 		 300 aa  278  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 		 300 aa  278  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  48.26 
 
 		 292 aa  278  6e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 		 301 aa  278  8e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  50.35 
 
 		 293 aa  278  9e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 		 301 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  46.94 
 
 		 307 aa  278  1e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 		 301 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  48.62 
 
 		 300 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0158  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 		 301 aa  276  3e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0298297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 294 aa  275  9e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  51.04 
 
 		 294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  48.44 
 
 		 296 aa  274  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0148  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000206082  hitchhiker  0.0000319288 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 293 aa  272  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  48.45 
 
 		 292 aa  272  6e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 292 aa  272  6e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 302 aa  271  7e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  48.61 
 
 		 294 aa  271  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 		 292 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 		 292 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 		 292 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 		 298 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 		 292 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 		 292 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 		 298 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  48.62 
 
 		 291 aa  269  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 		 292 aa  269  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0991  dihydrodipicolinate synthase  47.22 
 
 		 290 aa  268  5.9999999999999995e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  47.99 
 
 		 298 aa  268  5.9999999999999995e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  48.26 
 
 		 292 aa  268  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 		 292 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 		 292 aa  268  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>