More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0149 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 291 aa  585  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  74.48 
 
 		 295 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  74.48 
 
 		 290 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  73.1 
 
 		 290 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  70.69 
 
 		 291 aa  428  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0150  dihydrodipicolinate synthase  75.17 
 
 		 299 aa  427  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.613999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  72.16 
 
 		 291 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  70.07 
 
 		 294 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  69.39 
 
 		 294 aa  403  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  69.28 
 
 		 294 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  68.6 
 
 		 294 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  63.45 
 
 		 299 aa  387  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  62.8 
 
 		 293 aa  377  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  62.8 
 
 		 293 aa  376  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  62.46 
 
 		 293 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  64.16 
 
 		 293 aa  375  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  62.89 
 
 		 291 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  64.01 
 
 		 296 aa  369  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  62.63 
 
 		 296 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  60.34 
 
 		 297 aa  361  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  62.28 
 
 		 296 aa  361  8e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  62.28 
 
 		 296 aa  361  9e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  61.64 
 
 		 293 aa  358  8e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  60.9 
 
 		 300 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  59.52 
 
 		 298 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  62.54 
 
 		 292 aa  354  1e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  57.88 
 
 		 294 aa  353  2e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  60.76 
 
 		 300 aa  351  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  62.98 
 
 		 296 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2262  dihydrodipicolinate synthase  64.01 
 
 		 296 aa  348  9e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2961  dihydrodipicolinate synthase  61.59 
 
 		 296 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1890  dihydrodipicolinate synthase  61.59 
 
 		 299 aa  341  7e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2640  dihydrodipicolinate synthase  61.94 
 
 		 296 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4694  dihydrodipicolinate synthase  60.34 
 
 		 296 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2629  dihydrodipicolinate synthase  60 
 
 		 319 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.121971 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1870  dihydrodipicolinate synthase  61.25 
 
 		 297 aa  335  7e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.345659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  57.59 
 
 		 293 aa  331  7.000000000000001e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  55.14 
 
 		 293 aa  319  3e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  54.67 
 
 		 326 aa  317  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1443  dihydrodipicolinate synthase  52.56 
 
 		 296 aa  306  3e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  54.64 
 
 		 291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0517  dihydrodipicolinate synthase  55.86 
 
 		 292 aa  298  5e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2923  dihydrodipicolinate synthase  49.3 
 
 		 290 aa  287  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  53.96 
 
 		 292 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 297 aa  282  6.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2379  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 293 aa  279  4e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 291 aa  278  5e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 292 aa  276  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  47.59 
 
 		 292 aa  276  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  48.28 
 
 		 297 aa  275  6e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 		 292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  46.21 
 
 		 292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  50.54 
 
 		 290 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  47.93 
 
 		 300 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  47.93 
 
 		 300 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  47.93 
 
 		 300 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 		 291 aa  272  5.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  47.46 
 
 		 300 aa  271  9e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  47.26 
 
 		 292 aa  270  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 		 293 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  48.45 
 
 		 292 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  47.24 
 
 		 301 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  46.9 
 
 		 301 aa  269  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  46.9 
 
 		 301 aa  268  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  46.9 
 
 		 301 aa  268  8e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 		 292 aa  267  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  48.46 
 
 		 293 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  49.64 
 
 		 302 aa  267  2e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 		 293 aa  267  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 292 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  45.52 
 
 		 292 aa  266  4e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  46.76 
 
 		 299 aa  265  8e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  46.76 
 
 		 299 aa  265  8e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  46.76 
 
 		 293 aa  265  8.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1738  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 		 292 aa  265  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  46.92 
 
 		 292 aa  264  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 292 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  45.86 
 
 		 292 aa  263  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 292 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 292 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 292 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 292 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  47.25 
 
 		 292 aa  263  3e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  47.59 
 
 		 290 aa  263  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  46.21 
 
 		 300 aa  263  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0158  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 		 301 aa  263  3e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0298297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 292 aa  262  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  47.93 
 
 		 292 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  45.92 
 
 		 307 aa  261  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  45.86 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  45.86 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  45.86 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  46.94 
 
 		 295 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  45.86 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  45.86 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  49.44 
 
 		 290 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>