More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0150 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0150  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 299 aa  615  1e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.613999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  81.72 
 
 		 290 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  81.72 
 
 		 295 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  80.69 
 
 		 290 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  77.66 
 
 		 291 aa  454  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  75.17 
 
 		 291 aa  449  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  74.14 
 
 		 291 aa  445  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  72.01 
 
 		 294 aa  431  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  70.99 
 
 		 294 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  70.65 
 
 		 294 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  67.92 
 
 		 294 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  68.49 
 
 		 293 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  65.07 
 
 		 293 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  63.7 
 
 		 293 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  63.36 
 
 		 293 aa  386  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  64.01 
 
 		 296 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  63.67 
 
 		 296 aa  373  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  63.32 
 
 		 296 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  61.72 
 
 		 291 aa  371  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  59.93 
 
 		 294 aa  370  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  60.07 
 
 		 299 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  57.53 
 
 		 300 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  59.03 
 
 		 300 aa  350  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  58.08 
 
 		 298 aa  350  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  57.59 
 
 		 297 aa  348  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  60.9 
 
 		 296 aa  347  9e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2640  dihydrodipicolinate synthase  64.01 
 
 		 296 aa  345  7e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  60.48 
 
 		 292 aa  344  1e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  63.67 
 
 		 296 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1890  dihydrodipicolinate synthase  60.14 
 
 		 299 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2961  dihydrodipicolinate synthase  61.25 
 
 		 296 aa  335  5e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2629  dihydrodipicolinate synthase  61.59 
 
 		 319 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.121971 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  55.86 
 
 		 293 aa  330  2e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2923  dihydrodipicolinate synthase  54.48 
 
 		 290 aa  323  3e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2262  dihydrodipicolinate synthase  60.55 
 
 		 296 aa  322  7e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4694  dihydrodipicolinate synthase  58.82 
 
 		 296 aa  321  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  55.48 
 
 		 293 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1870  dihydrodipicolinate synthase  59.17 
 
 		 297 aa  318  5e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.345659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  52.6 
 
 		 326 aa  308  8e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1443  dihydrodipicolinate synthase  52.22 
 
 		 296 aa  307  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  52.4 
 
 		 293 aa  296  4e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  52.23 
 
 		 291 aa  294  1e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0517  dihydrodipicolinate synthase  57.59 
 
 		 292 aa  293  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  51.55 
 
 		 291 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 		 298 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  47.62 
 
 		 307 aa  270  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 		 292 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  45.86 
 
 		 297 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 		 293 aa  269  4e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  46.64 
 
 		 300 aa  268  5.9999999999999995e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  47.1 
 
 		 297 aa  268  7e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  47.75 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 298 aa  265  7e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  45.17 
 
 		 292 aa  264  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0991  dihydrodipicolinate synthase  45.52 
 
 		 290 aa  264  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  46.31 
 
 		 298 aa  263  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  47.22 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  46.31 
 
 		 298 aa  263  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  44.56 
 
 		 297 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  46.21 
 
 		 301 aa  262  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  46.21 
 
 		 300 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  46.39 
 
 		 292 aa  261  8e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 292 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  44.63 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 296 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  44.48 
 
 		 292 aa  260  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 		 292 aa  259  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  45.86 
 
 		 320 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  45.86 
 
 		 301 aa  259  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 		 302 aa  259  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 		 292 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 		 292 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  46.18 
 
 		 293 aa  258  7e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2379  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 		 293 aa  258  9e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 		 292 aa  257  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 		 292 aa  258  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  46.21 
 
 		 292 aa  258  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 292 aa  258  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.484069 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 		 292 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 		 292 aa  257  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  46.37 
 
 		 296 aa  256  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 		 292 aa  257  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  45.86 
 
 		 294 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 		 292 aa  257  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  45.55 
 
 		 292 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 		 292 aa  257  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 		 292 aa  257  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  45.89 
 
 		 292 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  45.89 
 
 		 292 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  45.89 
 
 		 292 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>