More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1583 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
293 aa  592  1e-168  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  60.14 
 
 
291 aa  358  4e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  57.59 
 
 
299 aa  351  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  57.44 
 
 
296 aa  340  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  58.82 
 
 
326 aa  338  5.9999999999999996e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  56.75 
 
 
296 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  57.09 
 
 
296 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  55.86 
 
 
300 aa  335  7e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  57.59 
 
 
290 aa  332  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  57.59 
 
 
295 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  57.59 
 
 
291 aa  331  7.000000000000001e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  56.9 
 
 
290 aa  331  8e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  57.29 
 
 
300 aa  330  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1443  dihydrodipicolinate synthase  57.09 
 
 
296 aa  328  5.0000000000000004e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  55.14 
 
 
297 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  55.17 
 
 
291 aa  318  7e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  55.48 
 
 
293 aa  317  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  53.45 
 
 
296 aa  315  5e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  56.8 
 
 
294 aa  315  5e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  54.95 
 
 
293 aa  315  8e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  53.29 
 
 
298 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4694  dihydrodipicolinate synthase  56.55 
 
 
296 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  52.9 
 
 
293 aa  312  4.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  52.05 
 
 
294 aa  310  2e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  51.88 
 
 
293 aa  309  2.9999999999999997e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0150  dihydrodipicolinate synthase  55.86 
 
 
299 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.613999  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  55.44 
 
 
294 aa  309  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  54.64 
 
 
291 aa  308  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  54.48 
 
 
296 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  51.54 
 
 
293 aa  306  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2640  dihydrodipicolinate synthase  55.52 
 
 
296 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2961  dihydrodipicolinate synthase  53.45 
 
 
296 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0517  dihydrodipicolinate synthase  56.32 
 
 
292 aa  302  3.0000000000000004e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  54.76 
 
 
294 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  55.44 
 
 
294 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1890  dihydrodipicolinate synthase  55.36 
 
 
299 aa  298  6e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  54.64 
 
 
291 aa  298  6e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1870  dihydrodipicolinate synthase  54.67 
 
 
297 aa  298  8e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.345659  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  51.89 
 
 
292 aa  295  4e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  51.19 
 
 
293 aa  287  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 
292 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2629  dihydrodipicolinate synthase  51.38 
 
 
319 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.121971 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  53.43 
 
 
297 aa  286  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 
292 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2262  dihydrodipicolinate synthase  51.38 
 
 
296 aa  285  5.999999999999999e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  48.45 
 
 
291 aa  283  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 
290 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 
290 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 
290 aa  281  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 
290 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  49.31 
 
 
292 aa  279  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 
292 aa  278  8e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 
295 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 
297 aa  277  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 
295 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  48.98 
 
 
292 aa  277  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 
291 aa  276  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 
293 aa  276  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  50.18 
 
 
292 aa  276  4e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0257  dihydrodipicolinate synthase  45.67 
 
 
296 aa  275  5e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.457936  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 
302 aa  275  6e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 
292 aa  275  9e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 
290 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  48.64 
 
 
295 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  47.93 
 
 
292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  48.47 
 
 
292 aa  272  6e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2923  dihydrodipicolinate synthase  48.04 
 
 
290 aa  271  8.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  48.28 
 
 
290 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  47.93 
 
 
292 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 
296 aa  268  7e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  48.49 
 
 
300 aa  268  8.999999999999999e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  48.14 
 
 
292 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 
292 aa  266  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  48.6 
 
 
286 aa  265  7e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0158  dihydrodipicolinate synthase  50.69 
 
 
301 aa  265  8.999999999999999e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0298297  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  48.25 
 
 
290 aa  263  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 
292 aa  263  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 
292 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  47.95 
 
 
292 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 
292 aa  263  3e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 
292 aa  263  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0828  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 
297 aa  263  3e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 
292 aa  263  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 
292 aa  263  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 
292 aa  263  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 
292 aa  262  4e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 
292 aa  262  4e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  46.78 
 
 
292 aa  262  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0148  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 
301 aa  261  8e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000206082  hitchhiker  0.0000319288 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  47.26 
 
 
292 aa  261  8.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 
291 aa  260  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  47.1 
 
 
294 aa  260  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  46.92 
 
 
292 aa  259  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 
293 aa  259  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 
291 aa  259  4e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1992  dihydrodipicolinate synthase  50.53 
 
 
291 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.122144  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  50.53 
 
 
291 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 
300 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 
292 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 
300 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>