More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0673 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 294 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  81.63 
 
 		 294 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  81.29 
 
 		 294 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  79.59 
 
 		 294 aa  503  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  69.39 
 
 		 293 aa  444  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  69.05 
 
 		 293 aa  437  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  69.05 
 
 		 293 aa  436  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  70.75 
 
 		 293 aa  429  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  70.31 
 
 		 295 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  70.31 
 
 		 290 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  69.62 
 
 		 290 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  70.07 
 
 		 291 aa  410  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  69.97 
 
 		 291 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  64.51 
 
 		 294 aa  399  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  65.99 
 
 		 291 aa  391  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0150  dihydrodipicolinate synthase  67.92 
 
 		 299 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.613999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  64.73 
 
 		 296 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  64.38 
 
 		 296 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  61.3 
 
 		 297 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  63.14 
 
 		 299 aa  371  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  64.04 
 
 		 296 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  62.46 
 
 		 300 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  61.56 
 
 		 291 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  64.16 
 
 		 296 aa  367  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  61.77 
 
 		 300 aa  362  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1890  dihydrodipicolinate synthase  63.7 
 
 		 299 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  59.86 
 
 		 293 aa  344  1e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  61.77 
 
 		 296 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2640  dihydrodipicolinate synthase  62.46 
 
 		 296 aa  342  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2961  dihydrodipicolinate synthase  60.07 
 
 		 296 aa  337  9e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2262  dihydrodipicolinate synthase  62.12 
 
 		 296 aa  338  9e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  55.82 
 
 		 298 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  58.36 
 
 		 292 aa  335  7e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2629  dihydrodipicolinate synthase  60.07 
 
 		 319 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.121971 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4694  dihydrodipicolinate synthase  60.41 
 
 		 296 aa  328  6e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1870  dihydrodipicolinate synthase  60.27 
 
 		 297 aa  328  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.345659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1443  dihydrodipicolinate synthase  55.25 
 
 		 296 aa  311  5.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  55.44 
 
 		 293 aa  309  4e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  54.79 
 
 		 326 aa  307  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  53.56 
 
 		 293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  52.38 
 
 		 291 aa  288  5.0000000000000004e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0517  dihydrodipicolinate synthase  56.25 
 
 		 292 aa  281  9e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2923  dihydrodipicolinate synthase  47.78 
 
 		 290 aa  276  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  48.29 
 
 		 300 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  48.29 
 
 		 300 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  48.29 
 
 		 300 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  48.29 
 
 		 300 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  48.29 
 
 		 300 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  48.29 
 
 		 300 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 		 320 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  48.29 
 
 		 300 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  48.29 
 
 		 300 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 		 301 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 		 302 aa  269  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  48.29 
 
 		 300 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  48.29 
 
 		 292 aa  266  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 292 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  48.29 
 
 		 300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  48.29 
 
 		 300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 		 292 aa  265  7e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  47.26 
 
 		 301 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  47.78 
 
 		 298 aa  263  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 		 292 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  46.42 
 
 		 302 aa  262  6e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  48.71 
 
 		 292 aa  260  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  45.05 
 
 		 294 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  47.78 
 
 		 298 aa  259  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 		 301 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  47.78 
 
 		 298 aa  259  4e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  48.63 
 
 		 308 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  45.95 
 
 		 307 aa  258  6e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  45.05 
 
 		 294 aa  258  8e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 297 aa  256  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  44.75 
 
 		 293 aa  256  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  44.71 
 
 		 294 aa  256  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  47.1 
 
 		 292 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  46.76 
 
 		 292 aa  256  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  45.73 
 
 		 291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  46.42 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  43.49 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  46.9 
 
 		 293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  46.76 
 
 		 321 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  46.08 
 
 		 292 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  47.1 
 
 		 298 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  46.08 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  46.9 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  45.39 
 
 		 292 aa  249  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  45.39 
 
 		 319 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 		 323 aa  249  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  46.28 
 
 		 295 aa  248  6e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  46.28 
 
 		 295 aa  248  6e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  45.36 
 
 		 296 aa  249  6e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  44.71 
 
 		 292 aa  248  7e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0991  dihydrodipicolinate synthase  44.18 
 
 		 290 aa  248  7e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  45.73 
 
 		 297 aa  248  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 		 296 aa  247  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  45.39 
 
 		 292 aa  246  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  44.71 
 
 		 292 aa  246  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  46.26 
 
 		 296 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>