More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2923 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2923  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
290 aa  597  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  53.98 
 
 
299 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  53.68 
 
 
297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  52.23 
 
 
292 aa  311  9e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  51.38 
 
 
291 aa  308  6.999999999999999e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  52.76 
 
 
290 aa  308  9e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  53.57 
 
 
298 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  51.71 
 
 
294 aa  306  3e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 
293 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 
295 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 
290 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  51.9 
 
 
296 aa  301  7.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 
293 aa  301  8.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 
293 aa  301  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 
293 aa  300  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0150  dihydrodipicolinate synthase  54.48 
 
 
299 aa  299  4e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.613999  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 
293 aa  299  5e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 
300 aa  298  8e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  51.26 
 
 
300 aa  294  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4694  dihydrodipicolinate synthase  53.29 
 
 
296 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  51.37 
 
 
293 aa  293  3e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1870  dihydrodipicolinate synthase  53.29 
 
 
297 aa  292  4e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.345659  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  50.87 
 
 
296 aa  291  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 
296 aa  290  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 
296 aa  290  3e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  49.3 
 
 
291 aa  287  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2629  dihydrodipicolinate synthase  52.94 
 
 
319 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.121971 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  48.62 
 
 
291 aa  285  5.999999999999999e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  52.6 
 
 
296 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1890  dihydrodipicolinate synthase  52.26 
 
 
299 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2640  dihydrodipicolinate synthase  52.3 
 
 
296 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  51.55 
 
 
291 aa  282  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2961  dihydrodipicolinate synthase  52.3 
 
 
296 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  47.78 
 
 
294 aa  276  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  49.65 
 
 
297 aa  276  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2262  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 
296 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  47.44 
 
 
294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  48.04 
 
 
293 aa  271  8.000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  46.02 
 
 
326 aa  268  8e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  48.94 
 
 
292 aa  267  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  46.76 
 
 
294 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  45.52 
 
 
290 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  45.52 
 
 
290 aa  260  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  44.48 
 
 
290 aa  260  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 
292 aa  259  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  45.86 
 
 
292 aa  257  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  45.73 
 
 
294 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  45.52 
 
 
290 aa  256  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  45.42 
 
 
292 aa  255  5e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  45.52 
 
 
292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1443  dihydrodipicolinate synthase  44.88 
 
 
296 aa  253  4.0000000000000004e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0257  dihydrodipicolinate synthase  44.64 
 
 
296 aa  251  7e-66  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.457936  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 
293 aa  250  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  43.3 
 
 
291 aa  249  3e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  41.44 
 
 
293 aa  248  6e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  43.66 
 
 
292 aa  246  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  42.41 
 
 
290 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  42.07 
 
 
290 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0828  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 
297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  41.32 
 
 
297 aa  238  5.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  40.97 
 
 
294 aa  238  9e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  40.97 
 
 
294 aa  236  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  41.67 
 
 
292 aa  236  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  42.07 
 
 
293 aa  236  4e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  40.97 
 
 
294 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  41.61 
 
 
293 aa  236  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  42.81 
 
 
296 aa  235  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  42.36 
 
 
300 aa  235  6e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  42.36 
 
 
300 aa  235  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  42.36 
 
 
300 aa  235  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  42.36 
 
 
300 aa  235  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  42.36 
 
 
300 aa  235  6e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  42.36 
 
 
300 aa  235  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  42.36 
 
 
300 aa  235  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  41.32 
 
 
300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  40.89 
 
 
291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  42.36 
 
 
296 aa  233  3e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  39.04 
 
 
292 aa  233  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  42.86 
 
 
291 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  39.38 
 
 
292 aa  232  7.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0517  dihydrodipicolinate synthase  46.48 
 
 
292 aa  231  7.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  42.51 
 
 
293 aa  231  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  42.56 
 
 
321 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  41.03 
 
 
290 aa  231  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  39.73 
 
 
292 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  39.73 
 
 
292 aa  230  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 
298 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  39.73 
 
 
292 aa  230  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  39.73 
 
 
292 aa  230  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  39.73 
 
 
292 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  41.87 
 
 
323 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  39.73 
 
 
292 aa  230  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  39.73 
 
 
292 aa  230  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  39.04 
 
 
292 aa  230  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  40.69 
 
 
292 aa  230  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  39.73 
 
 
292 aa  230  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  39.73 
 
 
292 aa  230  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  38.7 
 
 
292 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  38.7 
 
 
292 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  38.7 
 
 
292 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>