More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3086 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
326 aa  666    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  58.42 
 
 
299 aa  357  9.999999999999999e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  60.21 
 
 
291 aa  358  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  58.48 
 
 
300 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  58.68 
 
 
300 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  57.09 
 
 
297 aa  342  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  58.82 
 
 
293 aa  338  7e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  53.56 
 
 
296 aa  328  6e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  53.61 
 
 
294 aa  328  6e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  56.01 
 
 
293 aa  325  9e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  55.36 
 
 
295 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4694  dihydrodipicolinate synthase  57 
 
 
296 aa  323  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  54.11 
 
 
296 aa  322  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  55.36 
 
 
290 aa  322  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  53.77 
 
 
296 aa  322  5e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  55.33 
 
 
293 aa  322  8e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  53.42 
 
 
296 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  55.33 
 
 
293 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  54.67 
 
 
290 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  54.24 
 
 
298 aa  318  9e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  54.98 
 
 
293 aa  317  1e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  54.67 
 
 
291 aa  317  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  55.33 
 
 
293 aa  315  8e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  55.29 
 
 
296 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  55.82 
 
 
294 aa  311  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2262  dihydrodipicolinate synthase  52.9 
 
 
296 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  54.79 
 
 
294 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  55.86 
 
 
291 aa  307  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  55.82 
 
 
294 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  55.48 
 
 
294 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2629  dihydrodipicolinate synthase  53.62 
 
 
319 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.121971 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2640  dihydrodipicolinate synthase  55.63 
 
 
296 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1890  dihydrodipicolinate synthase  54.08 
 
 
299 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2961  dihydrodipicolinate synthase  53.24 
 
 
296 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1870  dihydrodipicolinate synthase  53.98 
 
 
297 aa  299  5e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.345659  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  51.9 
 
 
291 aa  298  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  49.13 
 
 
290 aa  295  9e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 
292 aa  291  7e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0150  dihydrodipicolinate synthase  52.6 
 
 
299 aa  290  3e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.613999  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  50.69 
 
 
292 aa  288  8e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  48.62 
 
 
292 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0517  dihydrodipicolinate synthase  56.32 
 
 
292 aa  285  7e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  51.55 
 
 
300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  52.41 
 
 
291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  48.1 
 
 
290 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  51.2 
 
 
300 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  48.1 
 
 
290 aa  281  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  51.2 
 
 
300 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  51.2 
 
 
300 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  51.2 
 
 
300 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  51.2 
 
 
300 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  51.2 
 
 
300 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  51.2 
 
 
300 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  48.79 
 
 
290 aa  281  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  48.42 
 
 
292 aa  280  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  47.93 
 
 
292 aa  280  3e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 
293 aa  277  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  48.45 
 
 
293 aa  276  3e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 
301 aa  276  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  50.35 
 
 
301 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1443  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 
296 aa  273  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  47.24 
 
 
297 aa  273  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  47.71 
 
 
302 aa  273  3e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 
301 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  47.59 
 
 
292 aa  271  9e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 
300 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 
301 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 
300 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 
300 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  47.59 
 
 
292 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2923  dihydrodipicolinate synthase  46.02 
 
 
290 aa  268  8.999999999999999e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0257  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 
296 aa  267  2e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.457936  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  47.06 
 
 
290 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  47.24 
 
 
320 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  48.43 
 
 
297 aa  265  8e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  46.9 
 
 
291 aa  265  8.999999999999999e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  46.37 
 
 
292 aa  265  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  49.32 
 
 
293 aa  263  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  48.58 
 
 
292 aa  264  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0828  dihydrodipicolinate synthase  44.18 
 
 
297 aa  263  3e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  46.88 
 
 
292 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  47.59 
 
 
291 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  47.16 
 
 
286 aa  262  6e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  46.02 
 
 
290 aa  261  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 
302 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  48.7 
 
 
293 aa  261  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  47.06 
 
 
319 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  44.83 
 
 
292 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  45.67 
 
 
291 aa  258  7e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 
294 aa  257  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  46.94 
 
 
300 aa  258  1e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 
293 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  46.76 
 
 
294 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 
292 aa  256  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  47.75 
 
 
294 aa  256  4e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 
298 aa  255  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  45.78 
 
 
308 aa  255  6e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0158  dihydrodipicolinate synthase  48.62 
 
 
301 aa  255  8e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0298297  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 
292 aa  255  9e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 
292 aa  255  9e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>