More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1611 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1611  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 292 aa  584  1e-166  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  45.05 
 
 		 292 aa  264  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  45.52 
 
 		 290 aa  258  8e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  45.17 
 
 		 290 aa  258  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  45.99 
 
 		 292 aa  256  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  45.17 
 
 		 290 aa  257  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  44.03 
 
 		 292 aa  256  3e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  43 
 
 		 292 aa  255  7e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  48.28 
 
 		 293 aa  254  8e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  45.52 
 
 		 290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  43.34 
 
 		 292 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  44.48 
 
 		 290 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 292 aa  252  6e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 291 aa  248  9e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  41.03 
 
 		 291 aa  248  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  43.9 
 
 		 293 aa  248  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  43.79 
 
 		 290 aa  247  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  44.75 
 
 		 292 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 		 297 aa  245  6e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  45.1 
 
 		 287 aa  245  6.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 		 290 aa  244  9e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  40.41 
 
 		 294 aa  242  5e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 		 292 aa  241  7.999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  40.27 
 
 		 294 aa  241  9e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  40.27 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  39.86 
 
 		 298 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  39.86 
 
 		 298 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 		 323 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 301 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  39.86 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  38.91 
 
 		 300 aa  240  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  42.66 
 
 		 292 aa  240  2e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 		 292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  40.61 
 
 		 301 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  42.76 
 
 		 292 aa  239  4e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 		 292 aa  239  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  44.63 
 
 		 295 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  44.63 
 
 		 295 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  39.25 
 
 		 300 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  39.25 
 
 		 300 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  39.25 
 
 		 300 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  39.25 
 
 		 300 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  39.25 
 
 		 300 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  39.25 
 
 		 300 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  39.25 
 
 		 300 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  41.52 
 
 		 293 aa  238  9e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  39.18 
 
 		 321 aa  238  9e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  41.92 
 
 		 292 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  41.38 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 		 291 aa  237  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  40.27 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 301 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  40.55 
 
 		 292 aa  236  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  40.34 
 
 		 290 aa  236  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  38.83 
 
 		 298 aa  236  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  39.59 
 
 		 300 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  39.59 
 
 		 300 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  44.3 
 
 		 295 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  38.97 
 
 		 300 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  40.89 
 
 		 292 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  39.59 
 
 		 300 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1691  dihydrodipicolinate synthase  44.76 
 
 		 292 aa  235  6e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.719895  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2379  dihydrodipicolinate synthase  41.61 
 
 		 293 aa  235  8e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 		 293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  41.58 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  39.86 
 
 		 319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  41.11 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  42.07 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0756  dihydrodipicolinate synthase  41.67 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.706325 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  41.36 
 
 		 307 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  40.83 
 
 		 293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0991  dihydrodipicolinate synthase  42.21 
 
 		 290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339523  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  40.41 
 
 		 296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  40.34 
 
 		 292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  39.86 
 
 		 296 aa  233  3e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  42.76 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  38.49 
 
 		 296 aa  233  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  38.49 
 
 		 299 aa  232  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 		 292 aa  232  6e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  42.52 
 
 		 294 aa  232  6e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 		 292 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  38.91 
 
 		 320 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  39.38 
 
 		 296 aa  231  9e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  38.41 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0583  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  41.78 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  39.79 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  38.49 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  38.49 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  38.75 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  42.07 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  40.68 
 
 		 300 aa  231  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1738  dihydrodipicolinate synthase  41.24 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  37.8 
 
 		 300 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 		 291 aa  231  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  41.75 
 
 		 290 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  42.18 
 
 		 294 aa  229  3e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  44.37 
 
 		 297 aa  229  4e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  36.9 
 
 		 326 aa  229  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>