More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0583 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0583  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
298 aa  603  1.0000000000000001e-171  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0897  dihydrodipicolinate synthase  72.82 
 
 
298 aa  471  1e-132  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0827  dihydrodipicolinate synthase  72.82 
 
 
298 aa  471  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.179848  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0784  dihydrodipicolinate synthase  76.11 
 
 
297 aa  470  1.0000000000000001e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1204  dihydrodipicolinate synthase  72.15 
 
 
298 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.247588  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0626  dihydrodipicolinate synthase  71.81 
 
 
298 aa  463  1e-129  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0120  dihydrodipicolinate synthase  73.04 
 
 
297 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.380726  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1138  dihydrodipicolinate synthase  72.79 
 
 
297 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.635374  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1058  dihydrodipicolinate synthase  70.31 
 
 
297 aa  448  1e-125  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1226  dihydrodipicolinate synthase  64.07 
 
 
297 aa  386  1e-106  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 
293 aa  296  3e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 
290 aa  290  3e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 
292 aa  280  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  47.06 
 
 
292 aa  275  5e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  47.7 
 
 
292 aa  273  3e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  48.26 
 
 
288 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  46.02 
 
 
292 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  47.44 
 
 
297 aa  267  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 
291 aa  265  8.999999999999999e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  47.26 
 
 
290 aa  262  6e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 
296 aa  259  3e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  46.9 
 
 
290 aa  259  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 
292 aa  259  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  45.24 
 
 
296 aa  259  4e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  47.84 
 
 
292 aa  259  4e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  46.18 
 
 
297 aa  258  9e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  45.39 
 
 
296 aa  258  9e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 
290 aa  257  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 
290 aa  257  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  45.96 
 
 
289 aa  256  4e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 
292 aa  256  4e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 
290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  45.89 
 
 
291 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  47.8 
 
 
292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1992  dihydrodipicolinate synthase  45.89 
 
 
291 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.122144  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  44.56 
 
 
289 aa  252  7e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  47.54 
 
 
291 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  46.78 
 
 
292 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  44.56 
 
 
289 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  46.8 
 
 
295 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  45.39 
 
 
293 aa  250  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  46.8 
 
 
295 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  45.26 
 
 
289 aa  250  3e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 
319 aa  247  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 
290 aa  248  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  46.94 
 
 
295 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  43.33 
 
 
296 aa  247  2e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  43.45 
 
 
297 aa  246  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3191  dihydrodipicolinate synthase  45.07 
 
 
297 aa  246  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0102406  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  45.33 
 
 
293 aa  246  4.9999999999999997e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  45.33 
 
 
291 aa  245  6e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 
296 aa  245  6.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  42.55 
 
 
308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  45.05 
 
 
292 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  43.3 
 
 
292 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  45.58 
 
 
296 aa  243  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  42.81 
 
 
290 aa  243  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  45.05 
 
 
294 aa  242  5e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  45.23 
 
 
296 aa  242  6e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  45.49 
 
 
294 aa  242  6e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  45.23 
 
 
296 aa  242  6e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  43.2 
 
 
291 aa  241  7.999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  46.88 
 
 
293 aa  241  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  44.37 
 
 
292 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  41.78 
 
 
297 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 
292 aa  241  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  44.56 
 
 
320 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  44.79 
 
 
294 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  45.52 
 
 
292 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  43.34 
 
 
326 aa  240  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  44.83 
 
 
292 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  46.6 
 
 
292 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  43.39 
 
 
294 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  47.25 
 
 
301 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  43.75 
 
 
299 aa  239  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  47.25 
 
 
301 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  46.52 
 
 
300 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  44.95 
 
 
301 aa  238  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  46.52 
 
 
300 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  46.52 
 
 
300 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  46.15 
 
 
301 aa  238  9e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 
292 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 
292 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  44.6 
 
 
296 aa  237  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  39.86 
 
 
291 aa  237  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0575  dihydrodipicolinate synthase  46.48 
 
 
296 aa  237  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2262  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 
290 aa  236  3e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 
293 aa  236  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  44.29 
 
 
300 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  44.29 
 
 
300 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  44.29 
 
 
300 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  43.88 
 
 
292 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  43.58 
 
 
296 aa  236  4e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  44.29 
 
 
300 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  44.29 
 
 
300 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  43.58 
 
 
294 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  44.29 
 
 
300 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  44.29 
 
 
300 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  44.1 
 
 
298 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  43.6 
 
 
300 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>