More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1734 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 296 aa  600  1e-170  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  77.03 
 
 		 296 aa  471  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  73.99 
 
 		 296 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  71.28 
 
 		 296 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0575  dihydrodipicolinate synthase  71.62 
 
 		 296 aa  431  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  67.91 
 
 		 297 aa  419  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  67.57 
 
 		 297 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  48.59 
 
 		 300 aa  292  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 		 292 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 		 292 aa  269  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  45.58 
 
 		 308 aa  269  5e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 		 292 aa  267  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 		 292 aa  265  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 		 292 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  45.77 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0583  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 		 298 aa  259  3e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 290 aa  259  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 290 aa  259  4e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 		 293 aa  257  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 		 292 aa  258  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  44.89 
 
 		 292 aa  258  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  44.98 
 
 		 293 aa  257  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  43.51 
 
 		 291 aa  257  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 		 319 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 		 290 aa  256  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 291 aa  255  5e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  46.76 
 
 		 290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  44.56 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  44.17 
 
 		 297 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 		 292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 		 292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 		 292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  45.26 
 
 		 292 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 294 aa  253  3e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 		 294 aa  253  3e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  45.07 
 
 		 287 aa  253  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  47.62 
 
 		 290 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 		 294 aa  252  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  44.29 
 
 		 293 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 		 298 aa  252  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 		 292 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  44.03 
 
 		 297 aa  251  8.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  47.25 
 
 		 290 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  44.89 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  46.52 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  45.99 
 
 		 301 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1875  dihydrodipicolinate synthase  45.26 
 
 		 288 aa  251  1e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  41.55 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  45.99 
 
 		 301 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 		 300 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 		 294 aa  249  4e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 293 aa  249  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 294 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 		 294 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 		 300 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 		 300 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  45.74 
 
 		 290 aa  248  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 		 292 aa  249  6e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 		 297 aa  248  9e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 		 294 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  41.03 
 
 		 292 aa  247  1e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 		 291 aa  248  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  42.86 
 
 		 294 aa  246  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  44.16 
 
 		 292 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  43.3 
 
 		 302 aa  247  2e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 		 301 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  43.49 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6633  dihydrodipicolinate synthase  44.36 
 
 		 292 aa  247  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  47.08 
 
 		 292 aa  246  3e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 		 289 aa  246  3e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  43.49 
 
 		 321 aa  246  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  42.81 
 
 		 298 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  42.55 
 
 		 291 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  43.2 
 
 		 294 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  44.77 
 
 		 295 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  43.3 
 
 		 301 aa  245  6e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 		 290 aa  245  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  44.77 
 
 		 295 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  38.85 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  45.26 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  45.35 
 
 		 286 aa  244  9.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  43.7 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  44.4 
 
 		 295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0843  dihydrodipicolinate synthase  45.65 
 
 		 290 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0686751  normal  0.56042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0987  dihydrodipicolinate synthase  45.65 
 
 		 290 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.193638  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  42.81 
 
 		 323 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  43.1 
 
 		 300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  41.91 
 
 		 290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 298 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  42.41 
 
 		 295 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  41.55 
 
 		 293 aa  242  6e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 		 302 aa  242  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 292 aa  241  9e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  40.94 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  40.94 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  41.58 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  41.08 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  41.58 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  41.58 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>