More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0072 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 304 aa  620  1e-176  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  61.56 
 
 		 294 aa  373  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  60.88 
 
 		 294 aa  369  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1875  dihydrodipicolinate synthase  52.92 
 
 		 288 aa  322  4e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  43.79 
 
 		 292 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  47.4 
 
 		 292 aa  281  1e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  44.48 
 
 		 292 aa  277  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  44.37 
 
 		 292 aa  275  5e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  48.26 
 
 		 293 aa  272  6e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 		 290 aa  271  8.000000000000001e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  45.36 
 
 		 297 aa  267  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 		 291 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 		 297 aa  266  4e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 		 292 aa  265  5.999999999999999e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  46.39 
 
 		 290 aa  265  7e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  47.74 
 
 		 290 aa  264  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 		 291 aa  264  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  47.74 
 
 		 290 aa  263  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  42.76 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  46.69 
 
 		 290 aa  261  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  44.1 
 
 		 288 aa  261  1e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  45.14 
 
 		 289 aa  256  2e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 		 290 aa  256  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  44.18 
 
 		 292 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  43.75 
 
 		 289 aa  253  3e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  41.96 
 
 		 292 aa  253  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  44.6 
 
 		 290 aa  252  7e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  44.6 
 
 		 290 aa  252  7e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  43.49 
 
 		 292 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  42.71 
 
 		 289 aa  250  2e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  43.75 
 
 		 289 aa  249  4e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  46.98 
 
 		 291 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  43.3 
 
 		 296 aa  248  7e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  44.96 
 
 		 298 aa  248  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 		 293 aa  246  4e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  42.81 
 
 		 291 aa  246  4e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  39.65 
 
 		 313 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  43.69 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  42.66 
 
 		 292 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  40.49 
 
 		 301 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  44.71 
 
 		 292 aa  243  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  44.71 
 
 		 292 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  41.58 
 
 		 297 aa  242  5e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  43.69 
 
 		 292 aa  242  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  43.69 
 
 		 292 aa  242  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  41.58 
 
 		 320 aa  241  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 		 319 aa  241  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  44.37 
 
 		 292 aa  241  9e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  43.34 
 
 		 292 aa  241  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  40.34 
 
 		 292 aa  240  2e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  42.01 
 
 		 291 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  39.86 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  40.92 
 
 		 300 aa  240  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0784  dihydrodipicolinate synthase  41.52 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3482  dihydrodipicolinate synthase  43.15 
 
 		 294 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000010244  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  40.92 
 
 		 300 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  40.92 
 
 		 300 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  40.92 
 
 		 300 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  40.92 
 
 		 300 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  40.92 
 
 		 300 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  40.92 
 
 		 300 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  42.41 
 
 		 300 aa  239  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  41.44 
 
 		 294 aa  239  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  40.92 
 
 		 300 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  42.07 
 
 		 297 aa  238  5.999999999999999e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  43.97 
 
 		 290 aa  238  8e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1204  dihydrodipicolinate synthase  40.69 
 
 		 298 aa  238  9e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.247588  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  43.15 
 
 		 292 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  42.66 
 
 		 292 aa  237  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3319  dihydrodipicolinate synthase  43.91 
 
 		 293 aa  236  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.343226 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  39.86 
 
 		 293 aa  236  3e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  41.96 
 
 		 287 aa  236  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  40.13 
 
 		 301 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  39.73 
 
 		 297 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  45.91 
 
 		 297 aa  235  6e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0583  dihydrodipicolinate synthase  41.38 
 
 		 298 aa  235  6e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  40.13 
 
 		 301 aa  235  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  40.89 
 
 		 296 aa  235  7e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  42.76 
 
 		 297 aa  235  8e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  41.1 
 
 		 294 aa  235  9e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2262  dihydrodipicolinate synthase  43.79 
 
 		 290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3342  dihydrodipicolinate synthase  41.03 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  40.89 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  39.38 
 
 		 297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  41.98 
 
 		 293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  41.78 
 
 		 302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  44.64 
 
 		 296 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 		 296 aa  233  3e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  41.58 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  40.86 
 
 		 308 aa  233  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  40.4 
 
 		 296 aa  233  3e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  44.64 
 
 		 296 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  40.13 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  43.05 
 
 		 295 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0897  dihydrodipicolinate synthase  40.34 
 
 		 298 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0827  dihydrodipicolinate synthase  40.34 
 
 		 298 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.179848  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  41.58 
 
 		 299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  43.05 
 
 		 295 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>