More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0784 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0784  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
297 aa  606  9.999999999999999e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0120  dihydrodipicolinate synthase  79.8 
 
 
297 aa  496  1e-139  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.380726  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1138  dihydrodipicolinate synthase  79.8 
 
 
297 aa  496  1e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.635374  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0897  dihydrodipicolinate synthase  78.72 
 
 
298 aa  492  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0626  dihydrodipicolinate synthase  80.55 
 
 
298 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0827  dihydrodipicolinate synthase  78.72 
 
 
298 aa  492  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.179848  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1204  dihydrodipicolinate synthase  78.72 
 
 
298 aa  492  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.247588  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1058  dihydrodipicolinate synthase  76.09 
 
 
297 aa  482  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0583  dihydrodipicolinate synthase  76.11 
 
 
298 aa  470  1.0000000000000001e-131  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1226  dihydrodipicolinate synthase  64.97 
 
 
297 aa  388  1e-107  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  47.24 
 
 
293 aa  295  9e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  51.22 
 
 
292 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  49.13 
 
 
292 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  45.83 
 
 
290 aa  276  2e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  48.1 
 
 
290 aa  268  8e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  48.1 
 
 
290 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  48.1 
 
 
292 aa  267  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 
290 aa  265  8e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  49.44 
 
 
292 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  46.02 
 
 
292 aa  263  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  46.53 
 
 
288 aa  260  2e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  47.4 
 
 
290 aa  258  7e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  45.89 
 
 
297 aa  257  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  46.71 
 
 
290 aa  256  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  45.86 
 
 
293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  47.06 
 
 
291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  48.55 
 
 
292 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  46.29 
 
 
294 aa  250  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  46.37 
 
 
290 aa  249  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  43.94 
 
 
290 aa  248  6e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  46.5 
 
 
292 aa  248  8e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3191  dihydrodipicolinate synthase  44.59 
 
 
297 aa  247  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0102406  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  45.96 
 
 
289 aa  246  2e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  46.69 
 
 
291 aa  245  4.9999999999999997e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  45.23 
 
 
289 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  44.91 
 
 
289 aa  244  9e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  44.88 
 
 
289 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  43.94 
 
 
297 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  43.9 
 
 
293 aa  242  6e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  43.37 
 
 
291 aa  241  7e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 
296 aa  240  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  46.98 
 
 
296 aa  240  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  43.71 
 
 
297 aa  241  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  41.52 
 
 
304 aa  240  2e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  44.91 
 
 
326 aa  239  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  45.77 
 
 
296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  46.26 
 
 
295 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  44.69 
 
 
297 aa  236  2e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  45.96 
 
 
308 aa  237  2e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  44.41 
 
 
293 aa  236  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  44.76 
 
 
293 aa  236  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  44.6 
 
 
296 aa  236  4e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  45.88 
 
 
296 aa  236  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  44.95 
 
 
296 aa  236  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  45.92 
 
 
295 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 
298 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  45.92 
 
 
295 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 
292 aa  235  6e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  43.06 
 
 
298 aa  235  6e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  42.36 
 
 
294 aa  235  8e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  42.81 
 
 
296 aa  235  8e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  44.06 
 
 
293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  42.36 
 
 
294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 
293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 
296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  43.75 
 
 
292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  44.48 
 
 
291 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  44.1 
 
 
292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  45.42 
 
 
300 aa  232  6e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  46.89 
 
 
297 aa  232  7.000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  43.71 
 
 
293 aa  232  7.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 
291 aa  231  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1738  dihydrodipicolinate synthase  47.08 
 
 
292 aa  231  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1870  dihydrodipicolinate synthase  45.86 
 
 
297 aa  231  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.345659  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  44.93 
 
 
292 aa  231  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  42.41 
 
 
300 aa  231  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  46.02 
 
 
292 aa  230  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  45.58 
 
 
292 aa  230  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  44.68 
 
 
292 aa  229  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  45.89 
 
 
292 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  45.89 
 
 
292 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 
292 aa  229  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  44.68 
 
 
292 aa  228  8e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 
292 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  43.27 
 
 
300 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  44.76 
 
 
290 aa  228  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  41.38 
 
 
292 aa  228  1e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 
292 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  43.21 
 
 
293 aa  227  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  44 
 
 
300 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  47.79 
 
 
292 aa  226  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  45.05 
 
 
301 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  43.36 
 
 
291 aa  226  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 
293 aa  226  4e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1992  dihydrodipicolinate synthase  43.36 
 
 
291 aa  226  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.122144  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 
293 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 
299 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 
299 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 
295 aa  225  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  43.27 
 
 
296 aa  225  7e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.390661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>