More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3111 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  100 
 
 		 313 aa  647    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  75 
 
 		 308 aa  480  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  63.55 
 
 		 301 aa  397  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7523  dihydrodipicolinate synthase  48.66 
 
 		 304 aa  294  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 		 319 aa  291  9e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2308  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  46.78 
 
 		 313 aa  283  3.0000000000000004e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 292 aa  278  6e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 		 292 aa  277  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  44.71 
 
 		 297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  44.18 
 
 		 292 aa  271  7e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1335  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  44.19 
 
 		 313 aa  270  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.106036 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  43 
 
 		 294 aa  268  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  43.3 
 
 		 290 aa  265  5e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  43.69 
 
 		 301 aa  264  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 		 300 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 		 300 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 		 300 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 		 300 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 		 300 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  44.18 
 
 		 300 aa  264  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 		 300 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2614  dihydrodipicolinate synthase  48.77 
 
 		 316 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 		 300 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2658  dihydrodipicolinate synthase  48.77 
 
 		 316 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  44.37 
 
 		 301 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2643  dihydrodipicolinate synthase  48.77 
 
 		 316 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.445991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 300 aa  261  8e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  43.3 
 
 		 292 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 300 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 300 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  41.1 
 
 		 319 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  44.37 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  41.98 
 
 		 294 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  44.37 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  41.78 
 
 		 292 aa  260  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  44.18 
 
 		 291 aa  259  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  41.3 
 
 		 294 aa  258  8e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 294 aa  258  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  41.92 
 
 		 290 aa  258  1e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 		 290 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 		 290 aa  257  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  41.58 
 
 		 290 aa  255  6e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 292 aa  254  9e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  40.96 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  44.71 
 
 		 298 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  40.8 
 
 		 307 aa  252  6e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  42.71 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0991  dihydrodipicolinate synthase  41.67 
 
 		 290 aa  250  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  43.7 
 
 		 292 aa  250  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  42.71 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  41.92 
 
 		 290 aa  249  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  41.24 
 
 		 292 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  41.72 
 
 		 293 aa  249  6e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  43 
 
 		 293 aa  248  7e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  41.58 
 
 		 292 aa  248  9e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  41.1 
 
 		 292 aa  248  9e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 		 290 aa  248  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 		 290 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  43.05 
 
 		 296 aa  246  3e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  42.56 
 
 		 293 aa  246  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  39.65 
 
 		 304 aa  246  4.9999999999999997e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  42.16 
 
 		 296 aa  245  9e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  41.84 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  41.92 
 
 		 293 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  42.21 
 
 		 293 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  42.12 
 
 		 292 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  41.18 
 
 		 297 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  42.03 
 
 		 295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  39.12 
 
 		 293 aa  243  3.9999999999999997e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  41.82 
 
 		 290 aa  242  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 		 295 aa  242  6e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  43.3 
 
 		 293 aa  242  6e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  40.07 
 
 		 298 aa  242  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  41.14 
 
 		 321 aa  242  7e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  40.83 
 
 		 293 aa  241  7.999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  41.03 
 
 		 292 aa  241  9e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  41.33 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  41.92 
 
 		 291 aa  240  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 291 aa  240  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  41.44 
 
 		 302 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  40.61 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 		 292 aa  240  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  42.59 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  40.75 
 
 		 298 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  40.75 
 
 		 298 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  39.6 
 
 		 302 aa  239  4e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  39.18 
 
 		 288 aa  239  4e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  39.53 
 
 		 297 aa  239  5e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  41.1 
 
 		 292 aa  239  5e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  42.07 
 
 		 292 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  42.07 
 
 		 292 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  42.22 
 
 		 293 aa  238  8e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  41.1 
 
 		 292 aa  238  8e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  40.74 
 
 		 291 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  40.27 
 
 		 292 aa  238  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  42.31 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  42.07 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  40.69 
 
 		 297 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  41.75 
 
 		 300 aa  236  5.0000000000000005e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  40.37 
 
 		 291 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>