More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0626 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0626  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 298 aa  610  1e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0897  dihydrodipicolinate synthase  84.56 
 
 		 298 aa  528  1e-149  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0827  dihydrodipicolinate synthase  84.56 
 
 		 298 aa  528  1e-149  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.179848  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1204  dihydrodipicolinate synthase  84.23 
 
 		 298 aa  525  1e-148  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.247588  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0784  dihydrodipicolinate synthase  80.55 
 
 		 297 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1138  dihydrodipicolinate synthase  77.97 
 
 		 297 aa  484  1e-136  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.635374  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0120  dihydrodipicolinate synthase  76.95 
 
 		 297 aa  476  1e-133  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.380726  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0583  dihydrodipicolinate synthase  71.81 
 
 		 298 aa  463  1e-129  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1058  dihydrodipicolinate synthase  76.63 
 
 		 297 aa  462  1e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1226  dihydrodipicolinate synthase  62.5 
 
 		 297 aa  380  1e-104  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  47.4 
 
 		 293 aa  288  9e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  48.6 
 
 		 292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  48.24 
 
 		 292 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 		 292 aa  268  7e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  50.19 
 
 		 292 aa  268  7e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  46.02 
 
 		 292 aa  264  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  46.71 
 
 		 290 aa  264  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  46.71 
 
 		 290 aa  264  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 		 290 aa  263  3e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  46.18 
 
 		 288 aa  262  4e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  47.55 
 
 		 292 aa  258  9e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 		 290 aa  257  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  46.02 
 
 		 291 aa  257  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  46.71 
 
 		 290 aa  255  6e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  44.98 
 
 		 290 aa  252  7e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  44.03 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  42.21 
 
 		 290 aa  250  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3191  dihydrodipicolinate synthase  45.1 
 
 		 297 aa  246  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0102406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  43.86 
 
 		 289 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  44.22 
 
 		 297 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  45.36 
 
 		 289 aa  243  3e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  43.51 
 
 		 289 aa  242  5e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  43.25 
 
 		 290 aa  242  7e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  45.13 
 
 		 297 aa  241  2e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  44.64 
 
 		 289 aa  240  2e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  45.45 
 
 		 308 aa  239  5.999999999999999e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 		 292 aa  238  6.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  44.26 
 
 		 297 aa  238  9e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  41.52 
 
 		 293 aa  238  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  43.71 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  43.25 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  44.01 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  43.51 
 
 		 296 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  44.68 
 
 		 291 aa  235  6e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1738  dihydrodipicolinate synthase  45.88 
 
 		 292 aa  235  8e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  45.65 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  45.05 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  44.01 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  43.36 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  43.9 
 
 		 291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  43.36 
 
 		 296 aa  233  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  43.01 
 
 		 296 aa  233  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  42.34 
 
 		 291 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 		 296 aa  232  5e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  42.46 
 
 		 294 aa  232  6e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  44.41 
 
 		 295 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  44.41 
 
 		 295 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  41.87 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  44.41 
 
 		 295 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  42.41 
 
 		 292 aa  229  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 		 292 aa  229  5e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  43.2 
 
 		 298 aa  229  5e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  42.66 
 
 		 293 aa  229  5e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  42.34 
 
 		 298 aa  228  7e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  41.47 
 
 		 326 aa  228  8e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  45.88 
 
 		 292 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  44.44 
 
 		 292 aa  228  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  38.57 
 
 		 304 aa  228  1e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  39.18 
 
 		 293 aa  228  1e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0492  dihydrodipicolinate synthase  46.18 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  43.17 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  41.96 
 
 		 300 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  46.52 
 
 		 292 aa  226  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  40.91 
 
 		 300 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  46.89 
 
 		 292 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  44.21 
 
 		 300 aa  226  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  46.89 
 
 		 292 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 		 292 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 		 292 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  45.16 
 
 		 292 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  42.86 
 
 		 292 aa  224  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  46.52 
 
 		 292 aa  223  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  43.49 
 
 		 296 aa  223  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  41.92 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  39.86 
 
 		 300 aa  223  3e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  41.92 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  41.92 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  40.28 
 
 		 294 aa  223  4e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  39.52 
 
 		 301 aa  223  4e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  40.28 
 
 		 294 aa  223  4e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  44.36 
 
 		 294 aa  222  6e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  41.24 
 
 		 295 aa  222  7e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  41.24 
 
 		 295 aa  221  8e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  42.12 
 
 		 292 aa  221  9e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  42.12 
 
 		 292 aa  221  9e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  41.72 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  41.24 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>