More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1335 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1335  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  100 
 
 		 313 aa  637    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.106036 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2308  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  84.66 
 
 		 313 aa  550  1e-155  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  48.29 
 
 		 301 aa  293  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  44.19 
 
 		 313 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  45.52 
 
 		 308 aa  270  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  44.98 
 
 		 290 aa  268  8e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 		 290 aa  261  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 290 aa  255  7e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 		 293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 		 290 aa  248  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 		 290 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 		 290 aa  247  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  41.64 
 
 		 292 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7523  dihydrodipicolinate synthase  44.25 
 
 		 304 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  41.78 
 
 		 291 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  42.32 
 
 		 292 aa  240  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  43.34 
 
 		 292 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  42.66 
 
 		 297 aa  236  4e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 		 290 aa  236  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 		 290 aa  234  9e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  41.64 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2643  dihydrodipicolinate synthase  43.54 
 
 		 316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.445991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  44.13 
 
 		 292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2614  dihydrodipicolinate synthase  43.54 
 
 		 316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2658  dihydrodipicolinate synthase  43.54 
 
 		 316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  43 
 
 		 292 aa  232  6e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  42.47 
 
 		 293 aa  230  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  42.01 
 
 		 319 aa  230  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  39.04 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 		 291 aa  226  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  38.78 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  38.78 
 
 		 294 aa  224  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  42.21 
 
 		 298 aa  223  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 292 aa  212  5.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  39.38 
 
 		 294 aa  211  2e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0583  dihydrodipicolinate synthase  38.01 
 
 		 298 aa  211  2e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  36.77 
 
 		 292 aa  209  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  36.08 
 
 		 288 aa  209  5e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  38.78 
 
 		 296 aa  209  6e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 		 293 aa  208  9e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1204  dihydrodipicolinate synthase  37.24 
 
 		 298 aa  207  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.247588  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  36.43 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  36.43 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  36.43 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  36.43 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  36.43 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  36.43 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  36.43 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  36.43 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  36.99 
 
 		 293 aa  206  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  37.63 
 
 		 293 aa  205  7e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0897  dihydrodipicolinate synthase  37.24 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0827  dihydrodipicolinate synthase  37.24 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.179848  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  37.79 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  38.73 
 
 		 289 aa  203  3e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  38.03 
 
 		 289 aa  203  3e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  39.48 
 
 		 292 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  35.71 
 
 		 298 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  37.2 
 
 		 291 aa  202  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  36.97 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  39.38 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2262  dihydrodipicolinate synthase  37.46 
 
 		 290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1691  dihydrodipicolinate synthase  36.99 
 
 		 292 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.719895  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1226  dihydrodipicolinate synthase  37.15 
 
 		 297 aa  200  3e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  38.49 
 
 		 299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  36.64 
 
 		 293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  34.35 
 
 		 320 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  37.68 
 
 		 289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  37.2 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2234  dihydrodipicolinate synthase  37.11 
 
 		 290 aa  199  6e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  36.64 
 
 		 292 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  36.08 
 
 		 297 aa  199  7e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  39.05 
 
 		 296 aa  198  7.999999999999999e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  37.54 
 
 		 292 aa  198  9e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  40.36 
 
 		 292 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  37.2 
 
 		 292 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  37.2 
 
 		 292 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  36.43 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  36.27 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  41.33 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  36.27 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  36.99 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  36.99 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0120  dihydrodipicolinate synthase  36.21 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.380726  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  39.79 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  35.96 
 
 		 292 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  35.84 
 
 		 292 aa  197  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  37.24 
 
 		 296 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  39.04 
 
 		 293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  35.69 
 
 		 296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  40.44 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  36.64 
 
 		 296 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  34.46 
 
 		 294 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0575  dihydrodipicolinate synthase  38.28 
 
 		 296 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0784  dihydrodipicolinate synthase  37.28 
 
 		 297 aa  196  6e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1992  dihydrodipicolinate synthase  42.16 
 
 		 291 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.122144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  42.16 
 
 		 291 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  36.61 
 
 		 294 aa  195  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  34.12 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  35.96 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>