More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1226 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1226  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
297 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1058  dihydrodipicolinate synthase  65.99 
 
 
297 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1138  dihydrodipicolinate synthase  67.23 
 
 
297 aa  395  1e-109  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.635374  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1204  dihydrodipicolinate synthase  63.51 
 
 
298 aa  390  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.247588  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0784  dihydrodipicolinate synthase  64.97 
 
 
297 aa  388  1e-107  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0897  dihydrodipicolinate synthase  62.84 
 
 
298 aa  387  1e-106  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0120  dihydrodipicolinate synthase  65.65 
 
 
297 aa  387  1e-106  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.380726  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0583  dihydrodipicolinate synthase  64.07 
 
 
298 aa  386  1e-106  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0827  dihydrodipicolinate synthase  62.84 
 
 
298 aa  387  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.179848  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0626  dihydrodipicolinate synthase  62.5 
 
 
298 aa  380  1e-104  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  47.59 
 
 
292 aa  260  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  46.42 
 
 
293 aa  255  5e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  46.5 
 
 
292 aa  254  9e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  44.29 
 
 
293 aa  253  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  45.8 
 
 
292 aa  249  4e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  44.83 
 
 
297 aa  248  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  44.56 
 
 
292 aa  247  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  44.71 
 
 
292 aa  247  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  43.15 
 
 
290 aa  246  3e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 
290 aa  245  8e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 
290 aa  244  9e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  45.64 
 
 
299 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  45.3 
 
 
291 aa  242  6e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  45.83 
 
 
290 aa  237  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  44.25 
 
 
296 aa  236  4e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  41.52 
 
 
300 aa  236  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  46.02 
 
 
298 aa  235  6e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  43.34 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  43.79 
 
 
297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 
291 aa  233  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  45.61 
 
 
292 aa  233  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  45.3 
 
 
293 aa  232  5e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  44.29 
 
 
296 aa  232  6e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  45.64 
 
 
300 aa  232  6e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  43.49 
 
 
297 aa  232  6e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  44.1 
 
 
290 aa  231  9e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  43.3 
 
 
293 aa  231  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  43.93 
 
 
296 aa  231  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 
293 aa  231  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  44.44 
 
 
326 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  43.93 
 
 
296 aa  230  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  42.21 
 
 
300 aa  229  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 
293 aa  229  5e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  45.1 
 
 
294 aa  228  7e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  43.45 
 
 
290 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  41.92 
 
 
293 aa  227  2e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  42.66 
 
 
298 aa  227  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  43.79 
 
 
290 aa  227  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  42.21 
 
 
294 aa  226  3e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 
296 aa  226  3e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  43.15 
 
 
293 aa  226  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 
293 aa  225  7e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 
304 aa  225  8e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  47.46 
 
 
302 aa  224  1e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  43.06 
 
 
294 aa  224  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  42.76 
 
 
290 aa  224  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 
296 aa  224  1e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  41.52 
 
 
294 aa  224  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1691  dihydrodipicolinate synthase  44.14 
 
 
292 aa  223  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.719895  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 
292 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  46.52 
 
 
298 aa  222  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 
296 aa  221  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  44.01 
 
 
295 aa  221  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  43.88 
 
 
292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  43.45 
 
 
298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  47.94 
 
 
287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  42.25 
 
 
297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4694  dihydrodipicolinate synthase  46.49 
 
 
296 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  41.18 
 
 
288 aa  219  5e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 
292 aa  218  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  43.6 
 
 
298 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  43.6 
 
 
298 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 
292 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  44.64 
 
 
296 aa  218  1e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  42.46 
 
 
296 aa  217  2e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  42.71 
 
 
289 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  42.01 
 
 
296 aa  217  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 
291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  41.67 
 
 
294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  45.36 
 
 
292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3191  dihydrodipicolinate synthase  43.57 
 
 
297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0102406  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1611  dihydrodipicolinate synthase  41.03 
 
 
292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  43.49 
 
 
293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 
292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  45.36 
 
 
292 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  43.69 
 
 
295 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  43.69 
 
 
295 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  42.71 
 
 
289 aa  216  5e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  43.6 
 
 
296 aa  216  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  40.89 
 
 
292 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  42.32 
 
 
321 aa  215  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  44 
 
 
300 aa  215  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  41.7 
 
 
291 aa  215  9e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  44 
 
 
300 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  42.23 
 
 
292 aa  214  9e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  44 
 
 
300 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  42.14 
 
 
319 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1870  dihydrodipicolinate synthase  43.21 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.345659  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  44.69 
 
 
300 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  41.78 
 
 
323 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>