More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2643 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2614  dihydrodipicolinate synthase  99.68 
 
 
316 aa  637    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2643  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
316 aa  638    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.445991  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2658  dihydrodipicolinate synthase  99.68 
 
 
316 aa  637    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28394  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  76.7 
 
 
319 aa  485  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7523  dihydrodipicolinate synthase  65.78 
 
 
304 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  49.82 
 
 
308 aa  288  7e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  51.23 
 
 
301 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  48.77 
 
 
313 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1335  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  43.54 
 
 
313 aa  243  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.106036 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2308  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  43.54 
 
 
313 aa  243  3.9999999999999997e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  40.99 
 
 
291 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  41.2 
 
 
292 aa  223  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  40.96 
 
 
290 aa  216  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  43.54 
 
 
290 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  43.54 
 
 
290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  43.7 
 
 
292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  41.91 
 
 
292 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  42.28 
 
 
292 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  39.08 
 
 
292 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0492  dihydrodipicolinate synthase  40.48 
 
 
298 aa  212  5.999999999999999e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  40.83 
 
 
292 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  40.83 
 
 
292 aa  212  7.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  40.83 
 
 
292 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  40.83 
 
 
292 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  40.83 
 
 
292 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  40.83 
 
 
292 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  40.83 
 
 
292 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  40.83 
 
 
292 aa  211  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  40.83 
 
 
292 aa  211  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  38.68 
 
 
293 aa  210  3e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  43.38 
 
 
292 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  41.7 
 
 
290 aa  209  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  43.33 
 
 
292 aa  209  4e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  42.15 
 
 
292 aa  209  4e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  42.59 
 
 
292 aa  209  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  41.91 
 
 
292 aa  209  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  42.59 
 
 
292 aa  207  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  42.59 
 
 
292 aa  207  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  42.59 
 
 
297 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  42.65 
 
 
291 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  39.86 
 
 
292 aa  207  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  41.7 
 
 
290 aa  206  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  40.91 
 
 
292 aa  206  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  40.48 
 
 
292 aa  206  6e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.484069 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  41.24 
 
 
292 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  40.79 
 
 
297 aa  205  9e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 
297 aa  204  1e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 
293 aa  205  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  41.24 
 
 
298 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  38.68 
 
 
290 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 
292 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 
292 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  43.06 
 
 
291 aa  204  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  38.91 
 
 
292 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 
292 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1992  dihydrodipicolinate synthase  43.06 
 
 
291 aa  204  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.122144  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 
292 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 
292 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2379  dihydrodipicolinate synthase  41.11 
 
 
293 aa  203  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2430  dihydrodipicolinate synthase  40.07 
 
 
294 aa  203  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104748  hitchhiker  0.0000338239 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  39.42 
 
 
302 aa  203  4e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  41.24 
 
 
299 aa  202  5e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  37.93 
 
 
290 aa  202  5e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  41.24 
 
 
299 aa  202  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2667  dihydrodipicolinate synthase  40.81 
 
 
294 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000190321  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2552  dihydrodipicolinate synthase  40.81 
 
 
294 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000411762  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  41.24 
 
 
293 aa  202  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1792  dihydrodipicolinate synthase  40.81 
 
 
294 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000368333  hitchhiker  0.00000000144356 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2590  dihydrodipicolinate synthase  40.81 
 
 
294 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000266276  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2412  dihydrodipicolinate synthase  41.54 
 
 
294 aa  202  7e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0470285  hitchhiker  0.00564144 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  37.76 
 
 
294 aa  202  7e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1656  dihydrodipicolinate synthase  41.54 
 
 
294 aa  202  7e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00451745  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1879  dihydrodipicolinate synthase  41.54 
 
 
294 aa  202  9e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  38.51 
 
 
320 aa  202  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2340  dihydrodipicolinate synthase  41.54 
 
 
294 aa  201  9e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00299163  hitchhiker  0.000000559319 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1738  dihydrodipicolinate synthase  39.63 
 
 
292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  37.41 
 
 
294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  40.59 
 
 
289 aa  201  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  39.52 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  41.44 
 
 
293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2234  dihydrodipicolinate synthase  41.11 
 
 
290 aa  200  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  38.75 
 
 
293 aa  199  5e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1848  dihydrodipicolinate synthase  40.44 
 
 
294 aa  199  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2262  dihydrodipicolinate synthase  40.74 
 
 
290 aa  198  7.999999999999999e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1702  dihydrodipicolinate synthase  40.44 
 
 
294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000467042  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  37.28 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  41.02 
 
 
294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  41.28 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  38.87 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  38.49 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1864  dihydrodipicolinate synthase  40.81 
 
 
294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000003415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  40.55 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1908  dihydrodipicolinate synthase  40.81 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0114932  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  40.44 
 
 
288 aa  197  3e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 
299 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 
295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 
295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  36.43 
 
 
294 aa  195  7e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1860  dihydrodipicolinate synthase  37.73 
 
 
293 aa  195  7e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151494  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1691  dihydrodipicolinate synthase  40.07 
 
 
292 aa  195  7e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.719895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>