More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7523 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7523  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 304 aa  615  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  68.44 
 
 		 319 aa  409  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2643  dihydrodipicolinate synthase  65.78 
 
 		 316 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.445991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2614  dihydrodipicolinate synthase  65.45 
 
 		 316 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2658  dihydrodipicolinate synthase  65.45 
 
 		 316 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  49.83 
 
 		 308 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  48.66 
 
 		 313 aa  294  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  49.83 
 
 		 301 aa  282  6.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2308  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  44.79 
 
 		 313 aa  245  8e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1335  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  44.25 
 
 		 313 aa  243  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.106036 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  41.18 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  38.89 
 
 		 292 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  41.38 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  39.86 
 
 		 292 aa  219  6e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  40.69 
 
 		 292 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  38.49 
 
 		 292 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  38.97 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  40.28 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  38.46 
 
 		 294 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  44.72 
 
 		 290 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  41.82 
 
 		 291 aa  212  7e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  40.22 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  39.58 
 
 		 290 aa  208  8e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  39.58 
 
 		 290 aa  208  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  37.93 
 
 		 290 aa  207  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  40.49 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  40.44 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  39.58 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 		 290 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  37.54 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  38.28 
 
 		 290 aa  206  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  40.81 
 
 		 292 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  40.86 
 
 		 294 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  35.07 
 
 		 297 aa  205  7e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  39.24 
 
 		 319 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  38.75 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  37.2 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  40.65 
 
 		 291 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  38.65 
 
 		 292 aa  204  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  41.18 
 
 		 292 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  41.32 
 
 		 292 aa  203  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  38.95 
 
 		 292 aa  203  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2262  dihydrodipicolinate synthase  38.75 
 
 		 290 aa  203  4e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  41.18 
 
 		 292 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  35.96 
 
 		 290 aa  202  5e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  41.82 
 
 		 294 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  38.28 
 
 		 293 aa  202  6e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  38.27 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2234  dihydrodipicolinate synthase  38.41 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  37.93 
 
 		 293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  38.27 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  39.21 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  36.88 
 
 		 320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  40.65 
 
 		 294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1980  dihydrodipicolinate synthase  39.71 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  40.79 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  38.63 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  38.63 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  38.63 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  35.19 
 
 		 293 aa  199  6e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  41.52 
 
 		 294 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  37.76 
 
 		 291 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  37.94 
 
 		 301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  40.81 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  36.04 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  38.1 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1848  dihydrodipicolinate synthase  38.99 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  40.38 
 
 		 287 aa  196  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  37.94 
 
 		 301 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  40.07 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  35.64 
 
 		 294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  36.81 
 
 		 289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  36.81 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  37.91 
 
 		 292 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  38.52 
 
 		 291 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2667  dihydrodipicolinate synthase  38.27 
 
 		 294 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000190321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1792  dihydrodipicolinate synthase  38.27 
 
 		 294 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000368333  hitchhiker  0.00000000144356 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  39.5 
 
 		 296 aa  196  6e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2552  dihydrodipicolinate synthase  38.27 
 
 		 294 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000411762  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  38.33 
 
 		 298 aa  196  6e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2590  dihydrodipicolinate synthase  38.27 
 
 		 294 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000266276  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1656  dihydrodipicolinate synthase  37.91 
 
 		 294 aa  195  6e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00451745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  38.62 
 
 		 292 aa  195  9e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  38.01 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  37.81 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1879  dihydrodipicolinate synthase  37.55 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  37.07 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  36.4 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  36.17 
 
 		 300 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  37.63 
 
 		 289 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  37.32 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  38.62 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  36.17 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  36.17 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  40.29 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  36.17 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  36.17 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2340  dihydrodipicolinate synthase  37.55 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00299163  hitchhiker  0.000000559319 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  36.17 
 
 		 304 aa  193  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>