More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0476 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
291 aa  589  1e-167  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  72.07 
 
 
291 aa  441  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  68.75 
 
 
313 aa  435  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  67.35 
 
 
291 aa  426  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0530  dihydrodipicolinate synthase  53.54 
 
 
297 aa  334  1e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.4261 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  56.6 
 
 
291 aa  332  5e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  56.25 
 
 
291 aa  330  2e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  57.09 
 
 
295 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  52.26 
 
 
309 aa  305  5.0000000000000004e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  51.89 
 
 
332 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  52.4 
 
 
307 aa  301  6.000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  51.39 
 
 
314 aa  300  3e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  49.13 
 
 
292 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  52.23 
 
 
293 aa  285  7e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 
292 aa  285  8e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3171  dihydrodipicolinate synthase  52.1 
 
 
308 aa  284  9e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.288667 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 
292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  48.26 
 
 
297 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 
290 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 
292 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 
289 aa  280  2e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 
290 aa  278  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 
290 aa  277  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 
288 aa  277  1e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  47.75 
 
 
289 aa  277  2e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  47.06 
 
 
289 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  47.26 
 
 
290 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  46.21 
 
 
289 aa  272  6e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  45.89 
 
 
290 aa  271  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  46.92 
 
 
291 aa  271  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 
290 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  47.06 
 
 
292 aa  268  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  48.1 
 
 
292 aa  263  2e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 
296 aa  263  2e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 
297 aa  263  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  46.39 
 
 
290 aa  262  6e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  47.96 
 
 
292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  42.32 
 
 
290 aa  254  2.0000000000000002e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  44.44 
 
 
295 aa  246  3e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  43.6 
 
 
290 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  41.87 
 
 
293 aa  245  4.9999999999999997e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  43.79 
 
 
294 aa  244  9.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  43.25 
 
 
296 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  43.66 
 
 
292 aa  244  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  43.55 
 
 
291 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  43 
 
 
293 aa  243  3e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  44.44 
 
 
294 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 
292 aa  242  5e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  45.68 
 
 
292 aa  241  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  44.29 
 
 
299 aa  240  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  46.01 
 
 
292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  44.93 
 
 
291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  44.8 
 
 
291 aa  239  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 
300 aa  239  4e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  42.21 
 
 
291 aa  239  5e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4361  dihydrodipicolinate synthase  45.95 
 
 
294 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  42.16 
 
 
291 aa  239  5.999999999999999e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  45.42 
 
 
296 aa  238  8e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3482  dihydrodipicolinate synthase  44.96 
 
 
294 aa  238  9e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000010244  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  45.29 
 
 
292 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  46.21 
 
 
292 aa  237  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  44.32 
 
 
291 aa  237  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  41.87 
 
 
291 aa  237  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  41.32 
 
 
292 aa  236  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  44.57 
 
 
301 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  42.07 
 
 
294 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  45.85 
 
 
292 aa  235  6e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  44.22 
 
 
293 aa  235  7e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 
292 aa  234  9e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  40.55 
 
 
295 aa  234  9e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  44.22 
 
 
299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  44.22 
 
 
299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  41.52 
 
 
294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  45.22 
 
 
296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  43.75 
 
 
291 aa  233  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  44.77 
 
 
293 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  44.13 
 
 
297 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  43.21 
 
 
297 aa  233  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  42.12 
 
 
298 aa  233  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 
300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  43.11 
 
 
292 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 
300 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 
300 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  42.39 
 
 
294 aa  232  5e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  45.99 
 
 
292 aa  232  6e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  45.99 
 
 
292 aa  232  6e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  45.99 
 
 
292 aa  232  6e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  45.99 
 
 
292 aa  232  6e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  45.99 
 
 
292 aa  232  6e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  43.48 
 
 
301 aa  232  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  45.99 
 
 
292 aa  232  6e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  45.99 
 
 
292 aa  232  6e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  44.73 
 
 
293 aa  232  6e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  43.94 
 
 
292 aa  232  6e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  42.86 
 
 
292 aa  232  7.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  44.93 
 
 
292 aa  232  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  43.48 
 
 
301 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  42.51 
 
 
301 aa  231  9e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  44.64 
 
 
297 aa  231  1e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  45.13 
 
 
292 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>