More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2308 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2308  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  100 
 
 		 313 aa  638    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1335  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  84.66 
 
 		 313 aa  550  1e-155  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.106036 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  48.98 
 
 		 301 aa  296  3e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  46.78 
 
 		 313 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  46.1 
 
 		 308 aa  275  5e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  46.71 
 
 		 290 aa  271  9e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  42.81 
 
 		 292 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 		 290 aa  256  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  43.49 
 
 		 292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  42.81 
 
 		 291 aa  251  9.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  42.47 
 
 		 292 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  43.15 
 
 		 292 aa  248  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  43.3 
 
 		 290 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  43.58 
 
 		 297 aa  245  8e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7523  dihydrodipicolinate synthase  44.79 
 
 		 304 aa  245  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  43.49 
 
 		 292 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  43.77 
 
 		 292 aa  239  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  41.24 
 
 		 290 aa  237  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  41.92 
 
 		 290 aa  235  6e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  41.92 
 
 		 290 aa  235  7e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2643  dihydrodipicolinate synthase  43.54 
 
 		 316 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.445991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2614  dihydrodipicolinate synthase  43.54 
 
 		 316 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2658  dihydrodipicolinate synthase  43.54 
 
 		 316 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  41.67 
 
 		 319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  41.78 
 
 		 293 aa  229  5e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  40.55 
 
 		 290 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 		 290 aa  226  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  37.41 
 
 		 294 aa  223  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  37.07 
 
 		 294 aa  223  4e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  40.48 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  36.77 
 
 		 304 aa  218  8.999999999999998e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0583  dihydrodipicolinate synthase  38.7 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  40.61 
 
 		 293 aa  215  7e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1204  dihydrodipicolinate synthase  38.28 
 
 		 298 aa  215  9e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.247588  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  40.28 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  36.43 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0897  dihydrodipicolinate synthase  38.28 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0827  dihydrodipicolinate synthase  38.28 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.179848  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  36.61 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  38.1 
 
 		 293 aa  211  2e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  38.83 
 
 		 293 aa  209  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  38.31 
 
 		 294 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  41.64 
 
 		 294 aa  209  7e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  36.27 
 
 		 294 aa  209  7e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  38.18 
 
 		 296 aa  206  5e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  37.54 
 
 		 296 aa  206  5e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  41.2 
 
 		 295 aa  205  9e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  36.61 
 
 		 319 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  36.3 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0626  dihydrodipicolinate synthase  37.59 
 
 		 298 aa  205  1e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 		 297 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  39.25 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  36.3 
 
 		 291 aa  203  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0120  dihydrodipicolinate synthase  36.99 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.380726  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  37.68 
 
 		 289 aa  203  3e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  37.8 
 
 		 298 aa  203  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  37.41 
 
 		 297 aa  202  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  41.58 
 
 		 290 aa  202  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1058  dihydrodipicolinate synthase  38.28 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  36.64 
 
 		 292 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  36.86 
 
 		 326 aa  202  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  38.38 
 
 		 289 aa  201  9e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  37.33 
 
 		 298 aa  202  9e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  37.33 
 
 		 298 aa  202  9e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  33.9 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  36.62 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  41.24 
 
 		 295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  35.37 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 		 292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  38.36 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  41.24 
 
 		 290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  37.29 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0784  dihydrodipicolinate synthase  36.9 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  35.15 
 
 		 320 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  36.82 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  38.7 
 
 		 292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  36.73 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  36.08 
 
 		 292 aa  199  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  38.77 
 
 		 296 aa  199  7e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  36.97 
 
 		 289 aa  199  7e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  37.93 
 
 		 296 aa  199  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  36.46 
 
 		 292 aa  198  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1226  dihydrodipicolinate synthase  36.18 
 
 		 297 aa  198  9e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  39.59 
 
 		 296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  36.73 
 
 		 296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  36.3 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1138  dihydrodipicolinate synthase  36.55 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.635374  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  35.84 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  35.84 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  35.84 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  41.81 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  35.96 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  35.84 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  35.74 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  35.84 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  37.87 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  35.84 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1691  dihydrodipicolinate synthase  35.96 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.719895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>