More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1269 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
292 aa  595  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  59.86 
 
 
296 aa  360  1e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  60.42 
 
 
294 aa  358  6e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  60.42 
 
 
295 aa  355  6.999999999999999e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  58.6 
 
 
291 aa  353  1e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  57.29 
 
 
297 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  55.14 
 
 
292 aa  337  9.999999999999999e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0756  dihydrodipicolinate synthase  57.44 
 
 
296 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.706325 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  56.6 
 
 
294 aa  330  1e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  55.16 
 
 
291 aa  325  5e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  55.02 
 
 
296 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  55.02 
 
 
296 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  53.55 
 
 
290 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4361  dihydrodipicolinate synthase  57.09 
 
 
294 aa  315  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  54.36 
 
 
297 aa  314  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0864  dihydrodipicolinate synthase  54.39 
 
 
297 aa  311  6.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  52.78 
 
 
299 aa  311  1e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  51.93 
 
 
298 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_846  dihydrodipicolinate synthase  54.39 
 
 
297 aa  308  8e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  53.47 
 
 
294 aa  305  6e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  52.08 
 
 
294 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  54.31 
 
 
296 aa  299  4e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18431  dihydrodipicolinate synthase  55.48 
 
 
300 aa  299  4e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1745  dihydrodipicolinate synthase  55.12 
 
 
300 aa  296  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18621  dihydrodipicolinate synthase  55.12 
 
 
300 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.696996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  50.53 
 
 
292 aa  295  4e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  50.53 
 
 
292 aa  295  4e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  50.18 
 
 
292 aa  295  5e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  50.53 
 
 
292 aa  295  6e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  50.53 
 
 
292 aa  295  6e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  50.53 
 
 
292 aa  295  6e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  50.53 
 
 
292 aa  295  6e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  50.53 
 
 
292 aa  295  6e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  50.53 
 
 
292 aa  295  6e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  51.25 
 
 
296 aa  295  6e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  52.31 
 
 
292 aa  286  4e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18431  dihydrodipicolinate synthase  54.06 
 
 
302 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  46.15 
 
 
290 aa  275  6e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1251  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 
302 aa  272  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  46.15 
 
 
290 aa  272  6e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  46.5 
 
 
290 aa  271  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21211  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 
315 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17791  dihydrodipicolinate synthetase  50.88 
 
 
302 aa  269  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0065  dihydrodipicolinate synthase  50.18 
 
 
302 aa  269  5e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1459  dihydrodipicolinate synthase  47.16 
 
 
295 aa  267  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.503779 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  46.15 
 
 
290 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  46.15 
 
 
290 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00721  dihydrodipicolinate synthase  53.05 
 
 
302 aa  265  7e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  45.45 
 
 
290 aa  263  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  45.45 
 
 
290 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1626  dihydrodipicolinate synthase  44.59 
 
 
296 aa  261  1e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0389231  hitchhiker  0.0000523491 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1729  dihydrodipicolinate synthase  44.8 
 
 
297 aa  259  3e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0274763  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  44.25 
 
 
297 aa  259  4e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0068  dihydrodipicolinate synthase  51.24 
 
 
302 aa  257  1e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  44.37 
 
 
292 aa  257  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  43.31 
 
 
293 aa  256  3e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  42.7 
 
 
295 aa  256  3e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3482  dihydrodipicolinate synthase  44.77 
 
 
294 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000010244  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  41.75 
 
 
297 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  46.32 
 
 
289 aa  251  9.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  41.61 
 
 
292 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  43.75 
 
 
293 aa  249  4e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  45.61 
 
 
289 aa  249  4e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  43.9 
 
 
292 aa  249  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  42.56 
 
 
294 aa  249  5e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  44.95 
 
 
292 aa  248  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  44.95 
 
 
292 aa  248  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  44.95 
 
 
292 aa  248  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  44.95 
 
 
292 aa  248  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  45.2 
 
 
292 aa  248  9e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  44.95 
 
 
292 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  44.48 
 
 
295 aa  248  1e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  41.96 
 
 
292 aa  247  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  43.77 
 
 
292 aa  246  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  43.1 
 
 
294 aa  246  3e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  45.61 
 
 
289 aa  246  4e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  40.91 
 
 
292 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  43.9 
 
 
292 aa  244  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.484069 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  43.93 
 
 
308 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  44.1 
 
 
293 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  41.61 
 
 
292 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  44.1 
 
 
299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  44.1 
 
 
299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  44.14 
 
 
296 aa  243  3e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  44.06 
 
 
293 aa  243  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7859  dihydrodipicolinate synthase  44.37 
 
 
308 aa  243  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  42.16 
 
 
291 aa  243  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  43.55 
 
 
292 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  43.55 
 
 
292 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  41.96 
 
 
292 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  43.55 
 
 
292 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  43.55 
 
 
292 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  43.55 
 
 
292 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  43.55 
 
 
292 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  41.96 
 
 
292 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  43.1 
 
 
300 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  43.55 
 
 
292 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  43.68 
 
 
291 aa  242  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  43.9 
 
 
292 aa  242  5e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  43.86 
 
 
289 aa  241  7e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>