More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1729 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1729  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
297 aa  598  1e-170  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0274763  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1273  dihydrodipicolinate synthase  67.59 
 
 
311 aa  413  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  48.55 
 
 
291 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0774  dihydrodipicolinate synthase  43.9 
 
 
292 aa  273  3e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.392848  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  46.38 
 
 
290 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0670  dihydrodipicolinate synthase  46.81 
 
 
288 aa  263  2e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  44.8 
 
 
292 aa  259  4e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  44.91 
 
 
297 aa  256  2e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0615  dihydrodipicolinate synthase  42.14 
 
 
307 aa  256  2e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  44.1 
 
 
296 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  44.1 
 
 
296 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  43.8 
 
 
292 aa  251  7e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0864  dihydrodipicolinate synthase  43.86 
 
 
297 aa  252  7e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_846  dihydrodipicolinate synthase  43.51 
 
 
297 aa  250  2e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  43.43 
 
 
292 aa  249  5e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  43.43 
 
 
292 aa  249  5e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  43.43 
 
 
292 aa  249  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  43.43 
 
 
292 aa  249  5e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  43.43 
 
 
292 aa  249  5e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  43.43 
 
 
292 aa  249  5e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  43.07 
 
 
292 aa  247  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  43.07 
 
 
292 aa  247  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  43.11 
 
 
292 aa  245  6.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  41.99 
 
 
295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  43.31 
 
 
292 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0756  dihydrodipicolinate synthase  42.35 
 
 
296 aa  242  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.706325 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  42.03 
 
 
294 aa  241  9e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  42.16 
 
 
296 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  41.79 
 
 
297 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  40.73 
 
 
291 aa  237  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  42.07 
 
 
296 aa  232  5e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  44.03 
 
 
298 aa  231  8.000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  40.29 
 
 
294 aa  229  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  41.04 
 
 
294 aa  229  4e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4361  dihydrodipicolinate synthase  44.49 
 
 
294 aa  228  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  40.37 
 
 
299 aa  226  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  41.85 
 
 
296 aa  223  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  39.64 
 
 
294 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  39.64 
 
 
294 aa  221  9e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  41.64 
 
 
292 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  40.6 
 
 
293 aa  220  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1626  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 
296 aa  219  6e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0389231  hitchhiker  0.0000523491 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  42.11 
 
 
294 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  40.98 
 
 
319 aa  215  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  36.04 
 
 
294 aa  214  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  40.82 
 
 
293 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  40.98 
 
 
292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  38.16 
 
 
294 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  43.23 
 
 
300 aa  211  9e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  40.6 
 
 
292 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  39.57 
 
 
297 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  40.28 
 
 
300 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  41.73 
 
 
292 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 
292 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 
292 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  40.28 
 
 
300 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 
292 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 
292 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  40.28 
 
 
300 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  39.57 
 
 
292 aa  208  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  37.28 
 
 
293 aa  208  9e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  37.1 
 
 
294 aa  208  9e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  38.93 
 
 
292 aa  207  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  37.46 
 
 
294 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  40.45 
 
 
298 aa  207  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  40.81 
 
 
291 aa  207  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  37.28 
 
 
299 aa  208  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  37.28 
 
 
299 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  40.82 
 
 
296 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  40.44 
 
 
301 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  38.38 
 
 
292 aa  206  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  42.65 
 
 
308 aa  206  5e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  39.56 
 
 
292 aa  205  7e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  39.56 
 
 
292 aa  205  7e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  39.56 
 
 
292 aa  205  7e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  39.56 
 
 
292 aa  205  7e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  40.37 
 
 
297 aa  205  7e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  39.56 
 
 
292 aa  205  7e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  39.56 
 
 
292 aa  205  7e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  39.56 
 
 
292 aa  205  7e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  39.56 
 
 
292 aa  204  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  37.18 
 
 
296 aa  204  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  39.22 
 
 
301 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  38.03 
 
 
292 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  42.11 
 
 
292 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  42.11 
 
 
292 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  39.56 
 
 
292 aa  204  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  39.7 
 
 
298 aa  203  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  39.7 
 
 
298 aa  203  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  39.22 
 
 
301 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  38.49 
 
 
292 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.484069 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  40.45 
 
 
296 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  38.87 
 
 
301 aa  202  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  38.43 
 
 
292 aa  202  6e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  44.48 
 
 
291 aa  202  8e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  40.23 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3482  dihydrodipicolinate synthase  40.99 
 
 
294 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000010244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  40.6 
 
 
300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  40.6 
 
 
300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  40.6 
 
 
300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>