More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0615 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0615  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
307 aa  635    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0774  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 
292 aa  301  1e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.392848  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1273  dihydrodipicolinate synthase  49.29 
 
 
311 aa  296  3e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0670  dihydrodipicolinate synthase  48.06 
 
 
288 aa  278  8e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  45.49 
 
 
291 aa  275  6e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  45.45 
 
 
292 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  45.8 
 
 
292 aa  269  4e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  45.8 
 
 
292 aa  269  4e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  45.8 
 
 
292 aa  269  4e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  45.8 
 
 
292 aa  269  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  45.8 
 
 
292 aa  269  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  45.8 
 
 
292 aa  269  4e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  45.8 
 
 
292 aa  269  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  45.8 
 
 
292 aa  269  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  45.07 
 
 
290 aa  264  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1729  dihydrodipicolinate synthase  42.14 
 
 
297 aa  256  2e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0274763  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  46.15 
 
 
292 aa  247  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  43.01 
 
 
295 aa  238  9e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  41.11 
 
 
292 aa  229  5e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  40.43 
 
 
296 aa  229  5e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  39.36 
 
 
297 aa  228  7e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 
291 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_846  dihydrodipicolinate synthase  40.78 
 
 
297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0756  dihydrodipicolinate synthase  42.4 
 
 
296 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.706325 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  39.72 
 
 
294 aa  218  7.999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 
299 aa  218  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  41.39 
 
 
297 aa  217  2e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  41.34 
 
 
296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  41.34 
 
 
296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  38.46 
 
 
296 aa  215  9e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  38.65 
 
 
292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  40.85 
 
 
296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  39.08 
 
 
294 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0864  dihydrodipicolinate synthase  40.29 
 
 
297 aa  211  1e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  39.22 
 
 
294 aa  207  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4361  dihydrodipicolinate synthase  41.34 
 
 
294 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  39.08 
 
 
294 aa  207  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  39.35 
 
 
300 aa  206  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3342  dihydrodipicolinate synthase  38.85 
 
 
292 aa  205  6e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  36.84 
 
 
298 aa  204  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 
302 aa  204  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 
297 aa  203  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  39.3 
 
 
291 aa  202  5e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1626  dihydrodipicolinate synthase  38.16 
 
 
296 aa  202  5e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0389231  hitchhiker  0.0000523491 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  40.58 
 
 
298 aa  202  6e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1251  dihydrodipicolinate synthase  42.25 
 
 
302 aa  201  9e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  38.46 
 
 
291 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21211  dihydrodipicolinate synthase  42.25 
 
 
315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  40.07 
 
 
292 aa  200  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  38.3 
 
 
290 aa  200  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  39.01 
 
 
292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  39.3 
 
 
291 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  42.25 
 
 
293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  39.71 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07550  dihydrodipicolinate synthase  39.78 
 
 
300 aa  197  3e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.02513  normal  0.756847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  38.08 
 
 
292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  38.7 
 
 
314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  38.79 
 
 
290 aa  195  9e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  40.43 
 
 
290 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  38.43 
 
 
292 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  38.95 
 
 
292 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  38.65 
 
 
292 aa  195  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  38.38 
 
 
294 aa  194  1e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  39.15 
 
 
296 aa  194  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  36.18 
 
 
295 aa  194  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  38.16 
 
 
291 aa  194  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  38.6 
 
 
297 aa  193  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  38.63 
 
 
290 aa  193  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  38.57 
 
 
288 aa  193  4e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  40.79 
 
 
290 aa  192  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  40.79 
 
 
290 aa  192  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  36.81 
 
 
294 aa  192  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3836  dihydrodipicolinate synthase, putative  45.59 
 
 
206 aa  192  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  36.4 
 
 
293 aa  192  7e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  38.04 
 
 
294 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  38.77 
 
 
294 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  40.43 
 
 
290 aa  192  7e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1611  dihydrodipicolinate synthase  39.5 
 
 
292 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  36.88 
 
 
319 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1848  dihydrodipicolinate synthase  40.29 
 
 
294 aa  190  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  37.01 
 
 
290 aa  190  2e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  36.84 
 
 
299 aa  191  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  36.84 
 
 
299 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  36.84 
 
 
293 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  37.86 
 
 
293 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  40.85 
 
 
293 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  38.38 
 
 
292 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  39.64 
 
 
309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  36.2 
 
 
292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  38.79 
 
 
297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  39.1 
 
 
292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  37.41 
 
 
293 aa  189  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  37.54 
 
 
293 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  37.94 
 
 
292 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  37.94 
 
 
292 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  37.94 
 
 
292 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1745  dihydrodipicolinate synthase  40.49 
 
 
300 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  40.07 
 
 
293 aa  189  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  37.94 
 
 
292 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  38.6 
 
 
307 aa  189  7e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>