More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0068 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0068  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
302 aa  605  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0065  dihydrodipicolinate synthase  82.45 
 
 
302 aa  489  1e-137  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00721  dihydrodipicolinate synthase  76.49 
 
 
302 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28982 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21211  dihydrodipicolinate synthase  71.33 
 
 
315 aa  427  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1251  dihydrodipicolinate synthase  71.33 
 
 
302 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17791  dihydrodipicolinate synthetase  70.1 
 
 
302 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  64.38 
 
 
299 aa  384  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18431  dihydrodipicolinate synthase  63.54 
 
 
302 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1745  dihydrodipicolinate synthase  63.19 
 
 
300 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18431  dihydrodipicolinate synthase  62.15 
 
 
300 aa  360  2e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18621  dihydrodipicolinate synthase  62.15 
 
 
300 aa  359  3e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.696996  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0756  dihydrodipicolinate synthase  57.99 
 
 
296 aa  353  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.706325 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  54.95 
 
 
296 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  54.95 
 
 
296 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4361  dihydrodipicolinate synthase  59.73 
 
 
294 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  54.33 
 
 
294 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  53.12 
 
 
294 aa  318  6e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  51.74 
 
 
296 aa  316  3e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  55.24 
 
 
295 aa  310  2e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  52.54 
 
 
296 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  51.24 
 
 
292 aa  300  2e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  53.02 
 
 
294 aa  299  4e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  49.82 
 
 
297 aa  298  9e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  51.56 
 
 
294 aa  297  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  51.2 
 
 
292 aa  291  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  49.82 
 
 
291 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  48.96 
 
 
291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  48.26 
 
 
290 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  50.18 
 
 
297 aa  280  3e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  52.9 
 
 
308 aa  278  9e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_846  dihydrodipicolinate synthase  50.18 
 
 
297 aa  278  1e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  47.87 
 
 
298 aa  275  9e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0864  dihydrodipicolinate synthase  49.82 
 
 
297 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  44.44 
 
 
292 aa  259  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  44.44 
 
 
292 aa  259  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  44.44 
 
 
292 aa  259  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  44.44 
 
 
292 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  44.44 
 
 
292 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  44.44 
 
 
292 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  44.44 
 
 
292 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  44.44 
 
 
292 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  47.59 
 
 
296 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  44.44 
 
 
292 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1199  dihydrodipicolinate synthase  48.99 
 
 
321 aa  259  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  45.83 
 
 
292 aa  250  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25250  dihydrodipicolinate synthase  47.9 
 
 
341 aa  249  5e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1459  dihydrodipicolinate synthase  43.46 
 
 
295 aa  249  5e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.503779 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3544  dihydrodipicolinate synthase  50.35 
 
 
352 aa  246  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.136616  normal  0.330927 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3310  dihydrodipicolinate synthase  52.33 
 
 
306 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  43.21 
 
 
290 aa  242  5e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  43.86 
 
 
290 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1389  dihydrodipicolinate synthase  49.64 
 
 
308 aa  238  5.999999999999999e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  45.61 
 
 
297 aa  239  5.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2168  dihydrodipicolinate synthase  49.15 
 
 
308 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  42.81 
 
 
290 aa  237  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7859  dihydrodipicolinate synthase  48.08 
 
 
308 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1080  dihydrodipicolinate synthase  48.58 
 
 
305 aa  236  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  hitchhiker  0.00385638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  42.76 
 
 
290 aa  235  9e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  42.76 
 
 
290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1626  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 
296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0389231  hitchhiker  0.0000523491 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  44.64 
 
 
300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1347  dihydrodipicolinate synthase  48.44 
 
 
308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0665282  decreased coverage  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  40.71 
 
 
295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12766  dihydrodipicolinate synthase  45.64 
 
 
300 aa  232  5e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  45.83 
 
 
292 aa  232  6e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 
290 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  42.38 
 
 
309 aa  231  1e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  41.75 
 
 
290 aa  229  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0791  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 
325 aa  227  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0269832  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  44.07 
 
 
290 aa  227  2e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0646  dihydrodipicolinate synthase  44.98 
 
 
323 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.31968 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  43.94 
 
 
314 aa  226  3e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  44.1 
 
 
332 aa  226  4e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1479  dihydrodipicolinate synthase  52.55 
 
 
308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205213  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3944  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 
298 aa  225  7e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  43.9 
 
 
292 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2241  dihydrodipicolinate synthase  48.91 
 
 
307 aa  224  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.289873  normal  0.369345 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  43.1 
 
 
292 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  44.36 
 
 
291 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  43.1 
 
 
291 aa  224  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1454  dihydrodipicolinate synthase  49.59 
 
 
302 aa  223  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000582626 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  43.96 
 
 
293 aa  223  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  43.55 
 
 
292 aa  223  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  44.29 
 
 
295 aa  223  3e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2387  dihydrodipicolinate synthase  45.12 
 
 
303 aa  223  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0117065 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  44.48 
 
 
293 aa  223  4e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  42.71 
 
 
292 aa  222  6e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  44.06 
 
 
298 aa  222  7e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2116  dihydrodipicolinate synthase  46.85 
 
 
303 aa  222  8e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2162  dihydrodipicolinate synthase  46.85 
 
 
303 aa  222  8e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.3452  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  42.86 
 
 
294 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3482  dihydrodipicolinate synthase  40.99 
 
 
294 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000010244  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  41.58 
 
 
291 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2103  dihydrodipicolinate synthase  46.85 
 
 
303 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  0.145144 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 
294 aa  221  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  41.67 
 
 
291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  41.28 
 
 
297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  42.11 
 
 
292 aa  217  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  41.72 
 
 
291 aa  217  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4000  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 
302 aa  217  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.104008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>