More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0791 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0791  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 325 aa  648    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0269832  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0646  dihydrodipicolinate synthase  75.55 
 
 		 323 aa  498  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31968 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3310  dihydrodipicolinate synthase  71 
 
 		 306 aa  414  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1080  dihydrodipicolinate synthase  69.83 
 
 		 305 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  hitchhiker  0.00385638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2168  dihydrodipicolinate synthase  67.55 
 
 		 308 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1199  dihydrodipicolinate synthase  63.14 
 
 		 321 aa  381  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  66.44 
 
 		 308 aa  380  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1347  dihydrodipicolinate synthase  63.36 
 
 		 308 aa  372  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0665282  decreased coverage  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1389  dihydrodipicolinate synthase  63.01 
 
 		 308 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3544  dihydrodipicolinate synthase  64.51 
 
 		 352 aa  370  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.136616  normal  0.330927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3944  dihydrodipicolinate synthase  59.66 
 
 		 298 aa  337  9.999999999999999e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1479  dihydrodipicolinate synthase  61.07 
 
 		 308 aa  323  3e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205213  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25250  dihydrodipicolinate synthase  58.48 
 
 		 341 aa  320  3e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7859  dihydrodipicolinate synthase  55.67 
 
 		 308 aa  305  9.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2241  dihydrodipicolinate synthase  55.17 
 
 		 307 aa  305  9.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.289873  normal  0.369345 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2116  dihydrodipicolinate synthase  51.89 
 
 		 303 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2103  dihydrodipicolinate synthase  51.89 
 
 		 303 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  0.145144 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2162  dihydrodipicolinate synthase  51.89 
 
 		 303 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.3452  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5807  dihydrodipicolinate synthase  53.54 
 
 		 298 aa  284  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23290  dihydrodipicolinate synthase  52.13 
 
 		 308 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0408468 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12766  dihydrodipicolinate synthase  50.69 
 
 		 300 aa  281  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2387  dihydrodipicolinate synthase  52.07 
 
 		 303 aa  280  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4000  dihydrodipicolinate synthase  53.1 
 
 		 302 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4273  dihydrodipicolinate synthase  53.42 
 
 		 299 aa  277  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 292 aa  275  7e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1454  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 302 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000582626 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1762  dihydrodipicolinate synthase  52.43 
 
 		 301 aa  273  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2190  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 314 aa  267  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10460  dihydrodipicolinate synthase  50.51 
 
 		 302 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184566  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07150  dihydrodipicolinate synthase  51.53 
 
 		 305 aa  265  1e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.152758  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1452  dihydrodipicolinate synthase  49 
 
 		 302 aa  261  8e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  46.13 
 
 		 290 aa  258  7e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 297 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 		 295 aa  256  3e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  47.2 
 
 		 291 aa  255  6e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  46.64 
 
 		 291 aa  255  7e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  44.17 
 
 		 296 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  44.68 
 
 		 294 aa  246  3e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0756  dihydrodipicolinate synthase  46.37 
 
 		 296 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.706325 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1032  dihydrodipicolinate synthase  47.87 
 
 		 307 aa  246  4.9999999999999997e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  45.8 
 
 		 294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4361  dihydrodipicolinate synthase  47.2 
 
 		 294 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1229  dihydrodipicolinate synthase  46.69 
 
 		 303 aa  239  5e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2315  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 		 298 aa  238  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  43.12 
 
 		 292 aa  237  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 		 292 aa  236  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 		 292 aa  236  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 		 292 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 		 292 aa  236  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 		 292 aa  236  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 		 292 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 		 292 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 		 292 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  43.82 
 
 		 292 aa  236  5.0000000000000005e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 		 294 aa  235  9e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1529  dihydrodipicolinate synthase  46.2 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  43.21 
 
 		 296 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  43.21 
 
 		 296 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1251  dihydrodipicolinate synthase  45.67 
 
 		 302 aa  231  9e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  44.17 
 
 		 292 aa  231  9e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1459  dihydrodipicolinate synthase  41.34 
 
 		 295 aa  231  9e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.503779 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21211  dihydrodipicolinate synthase  45.33 
 
 		 315 aa  228  8e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  41.96 
 
 		 294 aa  228  1e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  41.38 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  42.37 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0864  dihydrodipicolinate synthase  41.05 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17791  dihydrodipicolinate synthetase  48.62 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2466  dihydrodipicolinate synthase  47.28 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579938  normal  0.400267 
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  41.05 
 
 		 297 aa  226  3e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_846  dihydrodipicolinate synthase  41.4 
 
 		 297 aa  225  6e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0065  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 		 302 aa  225  9e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  41.58 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1626  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 		 296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0389231  hitchhiker  0.0000523491 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00721  dihydrodipicolinate synthase  48.5 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28982 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1745  dihydrodipicolinate synthase  41.75 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 289 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18431  dihydrodipicolinate synthase  42.76 
 
 		 302 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0951  dihydrodipicolinate synthase  41.18 
 
 		 301 aa  209  5e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  39.58 
 
 		 289 aa  209  6e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  36.27 
 
 		 295 aa  209  7e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  39.22 
 
 		 289 aa  209  7e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  40.78 
 
 		 292 aa  207  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18431  dihydrodipicolinate synthase  41.18 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18621  dihydrodipicolinate synthase  41.18 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.696996  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  38.83 
 
 		 292 aa  207  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  37.72 
 
 		 290 aa  206  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  38.52 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  39.42 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  37.63 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  36.75 
 
 		 289 aa  204  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  37.63 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  35.82 
 
 		 292 aa  203  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  41.16 
 
 		 290 aa  203  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  37.06 
 
 		 288 aa  202  4e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  37.46 
 
 		 294 aa  202  5e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  38.38 
 
 		 298 aa  202  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  39.46 
 
 		 297 aa  202  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>