More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0646 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0646  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 309 aa  610  9.999999999999999e-175  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  41.84 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  44.77 
 
 		 295 aa  225  7e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  45.65 
 
 		 292 aa  224  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  45.49 
 
 		 291 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1199  dihydrodipicolinate synthase  48.58 
 
 		 321 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  45.17 
 
 		 296 aa  223  4e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  43.8 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2116  dihydrodipicolinate synthase  45.79 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2162  dihydrodipicolinate synthase  45.79 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.3452  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1347  dihydrodipicolinate synthase  45.39 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0665282  decreased coverage  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  41.09 
 
 		 290 aa  215  7e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2103  dihydrodipicolinate synthase  45.45 
 
 		 303 aa  215  8e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  0.145144 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  40.22 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  40.22 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  40.22 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  40.22 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  40.22 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  40.22 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  40.22 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  40.73 
 
 		 296 aa  213  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  45.07 
 
 		 308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  40.22 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  40.22 
 
 		 292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3544  dihydrodipicolinate synthase  47.8 
 
 		 352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.136616  normal  0.330927 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12766  dihydrodipicolinate synthase  45.2 
 
 		 300 aa  211  9e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 		 294 aa  210  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1389  dihydrodipicolinate synthase  45.07 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 		 294 aa  211  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  41.1 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4000  dihydrodipicolinate synthase  50.42 
 
 		 302 aa  208  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  40.55 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  40.55 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  43.15 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  38.83 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0646  dihydrodipicolinate synthase  45.42 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31968 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2387  dihydrodipicolinate synthase  51.27 
 
 		 303 aa  207  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117065 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1080  dihydrodipicolinate synthase  45.73 
 
 		 305 aa  206  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  hitchhiker  0.00385638 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  40.07 
 
 		 292 aa  205  7e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 299 aa  205  8e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0951  dihydrodipicolinate synthase  41.9 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3310  dihydrodipicolinate synthase  47.37 
 
 		 306 aa  203  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0791  dihydrodipicolinate synthase  45.42 
 
 		 325 aa  202  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0269832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7859  dihydrodipicolinate synthase  46.01 
 
 		 308 aa  202  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1454  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 302 aa  202  6e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000582626 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  44.78 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  38.16 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1762  dihydrodipicolinate synthase  44.22 
 
 		 301 aa  199  6e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25250  dihydrodipicolinate synthase  43.1 
 
 		 341 aa  198  7.999999999999999e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1626  dihydrodipicolinate synthase  41.94 
 
 		 296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0389231  hitchhiker  0.0000523491 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0756  dihydrodipicolinate synthase  42.03 
 
 		 296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.706325 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  39.03 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2168  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  36.63 
 
 		 292 aa  195  7e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3944  dihydrodipicolinate synthase  45.95 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2241  dihydrodipicolinate synthase  46.94 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.289873  normal  0.369345 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  38.35 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1459  dihydrodipicolinate synthase  38.06 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.503779 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  40.07 
 
 		 314 aa  193  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  37.83 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  42.32 
 
 		 298 aa  192  8e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  36.68 
 
 		 291 aa  191  9e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0575  dihydrodipicolinate synthase  38.16 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07150  dihydrodipicolinate synthase  46.06 
 
 		 305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.152758  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 		 292 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0864  dihydrodipicolinate synthase  40.88 
 
 		 297 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  34.75 
 
 		 297 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  40.88 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  35.21 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23290  dihydrodipicolinate synthase  43.36 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0408468 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  38.54 
 
 		 294 aa  187  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0678  dihydrodipicolinate synthase  42.31 
 
 		 300 aa  186  6e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  39.3 
 
 		 301 aa  186  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  41.04 
 
 		 292 aa  186  6e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  38.19 
 
 		 294 aa  186  6e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4361  dihydrodipicolinate synthase  42.12 
 
 		 294 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_846  dihydrodipicolinate synthase  40.51 
 
 		 297 aa  185  8e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  39.65 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1452  dihydrodipicolinate synthase  41.58 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  39.65 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  37.92 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  41.42 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  36.94 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  36.77 
 
 		 292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  39.65 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07550  dihydrodipicolinate synthase  38.77 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.02513  normal  0.756847 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  39.65 
 
 		 301 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  39.3 
 
 		 300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  38.98 
 
 		 292 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  38.29 
 
 		 293 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 		 332 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  38.24 
 
 		 290 aa  182  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5807  dihydrodipicolinate synthase  44.37 
 
 		 298 aa  182  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  38.85 
 
 		 300 aa  182  8.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  39.56 
 
 		 290 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  40.32 
 
 		 307 aa  182  9.000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  37.92 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  40.3 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  40.81 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>