More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1396 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 313 aa  634    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  72.13 
 
 		 291 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  69.1 
 
 		 291 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  68.75 
 
 		 291 aa  435  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0530  dihydrodipicolinate synthase  52.38 
 
 		 297 aa  330  2e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.4261 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  56.12 
 
 		 291 aa  329  4e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  55.56 
 
 		 295 aa  310  2e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  56.78 
 
 		 291 aa  308  9e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  51.04 
 
 		 332 aa  295  8e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  48.34 
 
 		 309 aa  293  2e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  47.76 
 
 		 314 aa  293  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  48.61 
 
 		 307 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  47.93 
 
 		 289 aa  280  3e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  48.26 
 
 		 290 aa  279  4e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 292 aa  278  7e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  47.57 
 
 		 290 aa  276  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  47.57 
 
 		 290 aa  277  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 293 aa  276  4e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3171  dihydrodipicolinate synthase  49.3 
 
 		 308 aa  273  3e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.288667 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  48.28 
 
 		 292 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  48.8 
 
 		 291 aa  271  7e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  47.75 
 
 		 292 aa  271  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  45.49 
 
 		 289 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 		 289 aa  267  2e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  44.95 
 
 		 289 aa  267  2e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  49.08 
 
 		 290 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  47.57 
 
 		 290 aa  266  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  46.21 
 
 		 292 aa  266  5e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  47.4 
 
 		 292 aa  264  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  46.18 
 
 		 290 aa  263  4e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  43.75 
 
 		 288 aa  259  6e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  43.4 
 
 		 297 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  46.18 
 
 		 290 aa  256  5e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  45.83 
 
 		 292 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  44.1 
 
 		 296 aa  252  7e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  42.62 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 		 294 aa  246  3e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 		 290 aa  246  4.9999999999999997e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 		 294 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  42.36 
 
 		 294 aa  243  3e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  45.14 
 
 		 292 aa  241  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 292 aa  241  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  42.47 
 
 		 298 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  41.72 
 
 		 293 aa  238  6.999999999999999e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  43.4 
 
 		 295 aa  238  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  45.52 
 
 		 292 aa  236  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  43.77 
 
 		 286 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  41.03 
 
 		 300 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  41.46 
 
 		 291 aa  235  7e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  41.32 
 
 		 293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  45.16 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  45.62 
 
 		 293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  45.32 
 
 		 291 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  43.25 
 
 		 295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  43.4 
 
 		 292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  45.16 
 
 		 299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  45.16 
 
 		 299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  44.24 
 
 		 292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  42.86 
 
 		 291 aa  233  3e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  43.1 
 
 		 291 aa  233  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  41.46 
 
 		 290 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  41.03 
 
 		 291 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  41.98 
 
 		 299 aa  232  7.000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  42.36 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  44.25 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  41.81 
 
 		 294 aa  231  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  41.32 
 
 		 294 aa  230  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 		 296 aa  229  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1864  dihydrodipicolinate synthase  43.93 
 
 		 294 aa  229  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000003415  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  44.8 
 
 		 293 aa  229  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  40.75 
 
 		 296 aa  229  5e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  44.25 
 
 		 294 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1848  dihydrodipicolinate synthase  43.57 
 
 		 294 aa  229  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  43.6 
 
 		 292 aa  229  7e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  40.62 
 
 		 297 aa  228  7e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  43.59 
 
 		 292 aa  228  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  45.16 
 
 		 292 aa  229  7e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  42.45 
 
 		 292 aa  228  9e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  41.81 
 
 		 294 aa  228  9e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  44.01 
 
 		 295 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  42.01 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  44.37 
 
 		 295 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2430  dihydrodipicolinate synthase  45.13 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104748  hitchhiker  0.0000338239 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  40.97 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1702  dihydrodipicolinate synthase  44.29 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000467042  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  42.01 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  41.24 
 
 		 292 aa  227  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  41.79 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 		 294 aa  226  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  41.67 
 
 		 292 aa  227  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  41.73 
 
 		 300 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  41.49 
 
 		 293 aa  226  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0492  dihydrodipicolinate synthase  41.79 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  41.73 
 
 		 300 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  42.09 
 
 		 301 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  42.86 
 
 		 297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  41.73 
 
 		 300 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  42.95 
 
 		 308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  42.34 
 
 		 291 aa  225  6e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  41.07 
 
 		 292 aa  226  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>