More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1790 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1790  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 290 aa  588  1e-167  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3470  dihydrodipicolinate synthase  54.17 
 
 		 293 aa  328  8e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604806  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09438  dihydrodipicolinate synthase  53.17 
 
 		 292 aa  317  2e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3319  dihydrodipicolinate synthase  48.94 
 
 		 293 aa  281  1e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.343226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6633  dihydrodipicolinate synthase  48.59 
 
 		 292 aa  271  7e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5112  dihydrodipicolinate synthase  48.1 
 
 		 296 aa  270  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129853 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1312  dihydrodipicolinate synthase  45.74 
 
 		 297 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.344915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2538  dihydrodipicolinate synthase  44.48 
 
 		 298 aa  259  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.127413 
 
 
-
 
NC_002950  PG2052  dihydrodipicolinate synthase  46.89 
 
 		 289 aa  244  9.999999999999999e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0341235 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1369  hypothetical protein  43.1 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  43.36 
 
 		 298 aa  236  4e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  41.96 
 
 		 297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  45.79 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  41.32 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  41.52 
 
 		 296 aa  223  4e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  41.87 
 
 		 296 aa  222  6e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  40.34 
 
 		 308 aa  219  5e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  41.26 
 
 		 300 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  41.26 
 
 		 300 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  40.42 
 
 		 292 aa  218  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  40.91 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  42.5 
 
 		 291 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 		 292 aa  217  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  40.48 
 
 		 295 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  41.43 
 
 		 295 aa  216  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 		 301 aa  215  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  39.72 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  38.89 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  41.4 
 
 		 293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  39.86 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  39.51 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  40.07 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  40.07 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  40.07 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  40.07 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  40.07 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  40.07 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  40.07 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  39.86 
 
 		 291 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  39.86 
 
 		 301 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0575  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  41.45 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  41.11 
 
 		 319 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  40.91 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  39.86 
 
 		 290 aa  208  8e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  39.43 
 
 		 290 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  38.81 
 
 		 292 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  38.75 
 
 		 296 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  42.54 
 
 		 297 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  38.89 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  38.95 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  39.24 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  37.54 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  38.46 
 
 		 297 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  39.02 
 
 		 320 aa  201  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  38.89 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  37.68 
 
 		 292 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  39.27 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  38.6 
 
 		 297 aa  200  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  37.06 
 
 		 290 aa  199  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  37.32 
 
 		 293 aa  199  6e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 		 293 aa  199  6e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  37.76 
 
 		 292 aa  199  7e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  38.21 
 
 		 294 aa  199  7e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  37.32 
 
 		 292 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  38.68 
 
 		 292 aa  198  9e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  40.74 
 
 		 293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  37.54 
 
 		 296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  36.68 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  38.11 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  38.46 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  36.68 
 
 		 294 aa  196  3e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  37.99 
 
 		 296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  39.16 
 
 		 295 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  39.5 
 
 		 296 aa  195  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  37.06 
 
 		 294 aa  195  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  39.5 
 
 		 296 aa  195  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  37.28 
 
 		 298 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  37.28 
 
 		 298 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  38.21 
 
 		 297 aa  195  9e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  36.11 
 
 		 293 aa  195  9e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 		 292 aa  195  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  38.57 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  38.57 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  38.57 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  38.57 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  38.57 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  38.57 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  38.57 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  37.72 
 
 		 323 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  39.51 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  38.57 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  37.68 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  37.68 
 
 		 292 aa  193  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  41.07 
 
 		 298 aa  193  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  38.33 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 		 291 aa  193  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>