More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3080 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3080  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 310 aa  633    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.151038 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1021  dihydrodipicolinate synthetase  86.77 
 
 		 310 aa  548  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2133  dihydrodipicolinate synthase  79.22 
 
 		 309 aa  484  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4925  dihydrodipicolinate synthetase  81.17 
 
 		 308 aa  480  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330502 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4575  dihydrodipicolinate synthetase  73.87 
 
 		 310 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1052  dihydrodipicolinate synthetase  73 
 
 		 305 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6711  dihydrodipicolinate synthetase  68.39 
 
 		 309 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2596  dihydrodipicolinate synthetase  71.76 
 
 		 313 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3006  dihydrodipicolinate synthetase  71.76 
 
 		 313 aa  444  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2707  dihydrodipicolinate synthetase  70.76 
 
 		 316 aa  443  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2247  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  71.01 
 
 		 312 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11858  hitchhiker  0.00000394789 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0453  dihydrodipicolinate synthetase  71 
 
 		 309 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1026  dihydrodipicolinate synthetase  69.35 
 
 		 309 aa  437  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1630  dihydrodipicolinate synthase, putative  70 
 
 		 309 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0633747  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2738  dihydrodipicolinate synthetase  70.55 
 
 		 309 aa  423  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0200643  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0042  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  67.74 
 
 		 309 aa  424  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4923  dihydrodipicolinate synthetase  67.86 
 
 		 309 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5478  dihydrodipicolinate synthetase  67.53 
 
 		 309 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0261225 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3204  dihydrodipicolinate synthetase  67.42 
 
 		 309 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678825  normal  0.148766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4983  dihydrodipicolinate synthetase  67.97 
 
 		 309 aa  418  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3210  dihydrodipicolinate synthetase  70.43 
 
 		 305 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3057  dihydrodipicolinate synthetase  69.1 
 
 		 305 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2837  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  70.33 
 
 		 305 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719911  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5056  dihydrodipicolinate synthetase  69.77 
 
 		 305 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.309505  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5070  dihydrodipicolinate synthetase  70.43 
 
 		 305 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5804  dihydrodipicolinate synthetase  69.77 
 
 		 305 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4375  dihydrodipicolinate synthetase  69.44 
 
 		 305 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6235  dihydrodipicolinate synthetase  67.75 
 
 		 311 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.366894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5216  dihydrodipicolinate synthetase  68.71 
 
 		 309 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6404  dihydrodipicolinate synthetase  67.75 
 
 		 311 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3398  dihydrodipicolinate synthetase  68.4 
 
 		 311 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.832582  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5643  dihydrodipicolinate synthetase  68.71 
 
 		 309 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000370921  normal  0.101795 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6637  dihydrodipicolinate synthetase  67.75 
 
 		 311 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.207106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4586  dihydrodipicolinate synthetase  68.39 
 
 		 309 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115595 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4666  dihydrodipicolinate synthetase  61.26 
 
 		 310 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.966084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3971  dihydrodipicolinate synthetase  58.31 
 
 		 309 aa  357  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2446  putative dihydrodipicolinate synthetase  57.81 
 
 		 303 aa  347  2e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3779  dihydrodipicolinate synthetase  34.66 
 
 		 295 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0609  dihydrodipicolinate synthetase  28 
 
 		 317 aa  122  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.224973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1636  dihydrodipicolinate synthetase  33.45 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3957  dihydrodipicolinate synthetase  32.16 
 
 		 310 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3658  dihydrodipicolinate synthetase  31.8 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3300  dihydrodipicolinate synthetase  32.21 
 
 		 312 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3424  dihydrodipicolinate synthetase  32.04 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2042  dihydrodipicolinate synthetase  31.25 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.632197 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2468  dihydrodipicolinate synthetase  31.35 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0451761  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3101  dihydrodipicolinate synthetase  31.34 
 
 		 308 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.504533 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3456  putative dihydrodipicolinate synthase  30.99 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  32.27 
 
 		 295 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  32.19 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  31.11 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  30.71 
 
 		 293 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  30.13 
 
 		 293 aa  102  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  32.14 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  32.84 
 
 		 295 aa  99.4  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1528  dihydrodipicolinate synthetase  31.25 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3139  dihydrodipicolinate synthetase  30.94 
 
 		 308 aa  96.7  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  27.94 
 
 		 298 aa  96.3  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  28.2 
 
 		 304 aa  95.5  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  27.94 
 
 		 298 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  28 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5002  putative dihydrodipicolinate synthetase  29.39 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  27.53 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  27.53 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  27.53 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3112  dihydrodipicolinate synthetase  29.86 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114447  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3603  dihydrodipicolinate synthetase  29.14 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  27.94 
 
 		 298 aa  93.6  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1536  dihydrodipicolinate synthetase  29.66 
 
 		 306 aa  93.2  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.619521 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  28.19 
 
 		 297 aa  92.4  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  27.53 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  33.88 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25250  dihydrodipicolinate synthase  27.62 
 
 		 341 aa  92  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7578  dihydrodipicolinate synthetase  30.11 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1435  dihydrodipicolinate synthetase  31.71 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  27.52 
 
 		 304 aa  90.9  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1485  dihydrodipicolinate synthetase  32.25 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.177737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  26.72 
 
 		 298 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  26.72 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5807  dihydrodipicolinate synthase  28.93 
 
 		 298 aa  89.7  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1389  dihydrodipicolinate synthase  29.93 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1347  dihydrodipicolinate synthase  30.03 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0665282  decreased coverage  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  29.39 
 
 		 290 aa  88.2  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  28.63 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  26.71 
 
 		 308 aa  87.4  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  26.92 
 
 		 300 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  27.82 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2353  dihydrodipicolinate synthetase  29.14 
 
 		 317 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317457  normal  0.302248 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  31.82 
 
 		 302 aa  85.9  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  26.69 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5442  dihydrodipicolinate synthase  33.12 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4615  dihydrodipicolinate synthase  33.12 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330125  hitchhiker  0.00385635 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.53 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4382  dihydrodipicolinate synthetase  31.84 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0524626 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  24.69 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3541  dihydrodipicolinate synthetase  28.57 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.912153 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>