More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0309 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 293 aa  594  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  97.61 
 
 		 293 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  77.93 
 
 		 293 aa  455  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  70.99 
 
 		 295 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  70.65 
 
 		 295 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  70.83 
 
 		 295 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  69.55 
 
 		 294 aa  379  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  62.28 
 
 		 297 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  61.43 
 
 		 298 aa  359  4e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1958  dihydrodipicolinate synthase, putative  61.77 
 
 		 298 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0279  putative dihydrodipicolinate synthase  61.77 
 
 		 298 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0518166  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1160  DapA_1  61.77 
 
 		 298 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0869  putative dihydrodipicolinate synthase  61.77 
 
 		 298 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0956  putative dihydrodipicolinate synthase  61.77 
 
 		 298 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1006  putative dihydrodipicolinate synthase  61.77 
 
 		 298 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0078  dihydrodipicolinate synthase  61.99 
 
 		 298 aa  346  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00671629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5442  dihydrodipicolinate synthase  61.64 
 
 		 298 aa  342  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  60.96 
 
 		 298 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  60.96 
 
 		 298 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4615  dihydrodipicolinate synthase  60.62 
 
 		 298 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330125  hitchhiker  0.00385635 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0999  putative dihydrodipicolinate synthase  61.09 
 
 		 298 aa  341  8e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4892  dihydrodipicolinate synthase  61.3 
 
 		 298 aa  340  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0566089 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  56.34 
 
 		 290 aa  339  4e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  54.55 
 
 		 296 aa  300  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2860  hypothetical protein  50.34 
 
 		 299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  35.29 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  35.99 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  37.68 
 
 		 298 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  38.01 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  34.95 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  34.95 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  34.6 
 
 		 298 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  34.6 
 
 		 298 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  34.6 
 
 		 298 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  34.6 
 
 		 298 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  33.91 
 
 		 298 aa  175  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  34.88 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  37.98 
 
 		 295 aa  166  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4110  dihydrodipicolinate synthetase  33.1 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  33.21 
 
 		 292 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09730  putative dihydrodipicolinate synthase  32.99 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000547803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  34.31 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  31.18 
 
 		 308 aa  149  7e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  30.24 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4834  dihydrodipicolinate synthetase  33.56 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  35.11 
 
 		 296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5278  dihydrodipicolinate synthetase  32.41 
 
 		 303 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  32.17 
 
 		 305 aa  146  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  29.9 
 
 		 304 aa  145  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  32.22 
 
 		 294 aa  145  6e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  29.64 
 
 		 297 aa  145  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  35.11 
 
 		 296 aa  145  9e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  35.11 
 
 		 296 aa  145  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  34.06 
 
 		 304 aa  145  9e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.42 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6633  dihydrodipicolinate synthase  32.95 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  29.55 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  32.97 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3716  dihydrodipicolinate synthetase  29.17 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  32.97 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  32.28 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  32.97 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  32.75 
 
 		 294 aa  144  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4753  dihydrodipicolinate synthetase  34.42 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  33.46 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  31.45 
 
 		 291 aa  142  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  33.68 
 
 		 301 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  32.13 
 
 		 303 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  32.62 
 
 		 301 aa  142  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  31.27 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  32.06 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  32.62 
 
 		 301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  30.31 
 
 		 300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  30.21 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  32.62 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  32.62 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  30.21 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  28.32 
 
 		 292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  31.94 
 
 		 302 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  29.97 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  29.97 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  29.97 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  29.97 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  29.97 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  30.57 
 
 		 286 aa  139  6e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  32.35 
 
 		 301 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  29.97 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  29.97 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  29.21 
 
 		 304 aa  139  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  31.36 
 
 		 313 aa  139  7e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  30.8 
 
 		 291 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  29.86 
 
 		 290 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  33.09 
 
 		 300 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  30.42 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  32.26 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  32.26 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  31.54 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  29.29 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>