More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_09730 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_09730  putative dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 303 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000547803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4110  dihydrodipicolinate synthetase  73.65 
 
 		 297 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1372  dihydrodipicolinate synthetase  71.67 
 
 		 302 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0366991 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5278  dihydrodipicolinate synthetase  68.21 
 
 		 303 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2111  dihydrodipicolinate synthase  73.09 
 
 		 302 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000964541  normal  0.786105 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4834  dihydrodipicolinate synthetase  66.89 
 
 		 303 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7258  dihydrodipicolinate synthase  67.55 
 
 		 303 aa  421  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3063  dihydrodipicolinate synthase, putative  63.25 
 
 		 303 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0586841  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  63.3 
 
 		 301 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4753  dihydrodipicolinate synthetase  59.33 
 
 		 305 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5758  dihydrodipicolinate synthetase  46.44 
 
 		 295 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6866  dihydrodipicolinate synthetase  43.64 
 
 		 295 aa  245  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131306  normal  0.920472 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5264  dihydrodipicolinate synthetase  37.98 
 
 		 292 aa  198  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  37.28 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1217  dihydrodipicolinate synthetase  34.69 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4841  dihydrodipicolinate synthase  37.72 
 
 		 292 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00571792 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  32.3 
 
 		 298 aa  162  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  32.65 
 
 		 298 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  32.3 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  31.96 
 
 		 298 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  32.66 
 
 		 298 aa  159  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  31.83 
 
 		 298 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  31.83 
 
 		 298 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  31.83 
 
 		 298 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  32.88 
 
 		 298 aa  159  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  31.83 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  34.59 
 
 		 294 aa  157  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  31.25 
 
 		 295 aa  156  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  33.33 
 
 		 293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  34.59 
 
 		 293 aa  152  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  32.07 
 
 		 298 aa  152  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  33.1 
 
 		 304 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  32.07 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  32.99 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  33.79 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 		 290 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  32.08 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  27.34 
 
 		 292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  30.91 
 
 		 304 aa  139  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  32.06 
 
 		 294 aa  139  7.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1006  putative dihydrodipicolinate synthase  35.86 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0279  putative dihydrodipicolinate synthase  35.86 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0518166  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1958  dihydrodipicolinate synthase, putative  35.86 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0956  putative dihydrodipicolinate synthase  35.86 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1160  DapA_1  35.86 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  32.53 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0869  putative dihydrodipicolinate synthase  35.86 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  32.08 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0999  putative dihydrodipicolinate synthase  35.86 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  28.33 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0078  dihydrodipicolinate synthase  34.24 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00671629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  28.33 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  34.69 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  28.33 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  30.17 
 
 		 304 aa  136  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  34.69 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  29.86 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  31.27 
 
 		 295 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  30.26 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  34.48 
 
 		 298 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  29.31 
 
 		 291 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  31.85 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4615  dihydrodipicolinate synthase  34.8 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330125  hitchhiker  0.00385635 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  31.84 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  31.47 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  28.32 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  31.53 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  30.55 
 
 		 304 aa  133  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  26.41 
 
 		 295 aa  133  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  28.32 
 
 		 291 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09012  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02270)  29.86 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  29.9 
 
 		 291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  31.85 
 
 		 295 aa  133  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5442  dihydrodipicolinate synthase  34.58 
 
 		 298 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  31.14 
 
 		 295 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  30.14 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  32.04 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  34.31 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  32.64 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  31 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  30.31 
 
 		 303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  30.94 
 
 		 298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3845  dihydrodipicolinate synthetase  32.41 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  28.62 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  30.18 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 		 291 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3957  dihydrodipicolinate synthetase  33.1 
 
 		 299 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0615  dihydrodipicolinate synthase  29.14 
 
 		 307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  29.59 
 
 		 291 aa  129  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  28.42 
 
 		 303 aa  129  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  31.82 
 
 		 302 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 302 aa  129  9.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  32.3 
 
 		 300 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  28.87 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>