More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1281 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 298 aa  605  9.999999999999999e-173  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  33.67 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  34.19 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0689  dihydrodipicolinate synthetase  35.97 
 
 		 294 aa  186  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148381  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  34.46 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  32.77 
 
 		 295 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0646  dihydrodipicolinate synthetase  34.3 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  34.91 
 
 		 291 aa  176  6e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3709  dihydrodipicolinate synthetase  34.29 
 
 		 294 aa  176  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.646628  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3538  dihydrodipicolinate synthetase  34.29 
 
 		 294 aa  175  9e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.423247  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  35.17 
 
 		 290 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  34.48 
 
 		 290 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3482  dihydrodipicolinate synthase  34.41 
 
 		 294 aa  169  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000010244  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1762  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 293 aa  169  7e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  31.96 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  32.75 
 
 		 292 aa  168  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  31.6 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  35.27 
 
 		 292 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  35.36 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  31.36 
 
 		 294 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  32.31 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  34.64 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  31.85 
 
 		 298 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  29.31 
 
 		 291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  32.19 
 
 		 298 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  31.85 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  31.85 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  32.07 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  31.85 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  31.63 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  31.85 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  35.87 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  30.82 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  31.31 
 
 		 298 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  31.74 
 
 		 295 aa  159  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  31.56 
 
 		 301 aa  159  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  31.51 
 
 		 298 aa  159  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  31.03 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  31.58 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 		 291 aa  156  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  31.19 
 
 		 297 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  32.76 
 
 		 292 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  30.8 
 
 		 290 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  29.66 
 
 		 294 aa  155  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  34.06 
 
 		 302 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0090  Dihydrodipicolinate synthase  32.19 
 
 		 289 aa  155  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  30.69 
 
 		 292 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  32.13 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32.3 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  30.96 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  30.32 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  30.32 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3342  dihydrodipicolinate synthase  32.09 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3989  dihydrodipicolinate synthetase  34.58 
 
 		 296 aa  152  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_846  dihydrodipicolinate synthase  32.54 
 
 		 297 aa  152  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1160  dihydrodipicolinate synthetase  33.67 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  31.86 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  30.85 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  28.91 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  31.38 
 
 		 292 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  30.17 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0864  dihydrodipicolinate synthase  32.2 
 
 		 297 aa  149  5e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  30.38 
 
 		 292 aa  149  5e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  31.16 
 
 		 291 aa  149  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  32.88 
 
 		 294 aa  149  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  32.99 
 
 		 307 aa  149  6e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  29.05 
 
 		 294 aa  148  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  31.74 
 
 		 295 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  29.47 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3053  dihydrodipicolinate synthetase  33.33 
 
 		 294 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.466068  normal  0.0327331 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  31.74 
 
 		 295 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  31.52 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  28.18 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  30.82 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  31.49 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  29.69 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  30.82 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  29.59 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  30.1 
 
 		 298 aa  146  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32.88 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  32.42 
 
 		 293 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3408  dihydrodipicolinate synthetase  33.33 
 
 		 294 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.169511  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  29.79 
 
 		 289 aa  146  3e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0843  dihydrodipicolinate synthase  34.06 
 
 		 290 aa  146  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0686751  normal  0.56042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0987  dihydrodipicolinate synthase  34.06 
 
 		 290 aa  146  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.193638  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  32.86 
 
 		 290 aa  147  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  29.64 
 
 		 292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  29.64 
 
 		 292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  29.79 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  29.64 
 
 		 292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  29.35 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>