More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0090 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0090  Dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
289 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2063  dihydrodipicolinate synthase  46.37 
 
 
303 aa  269  5e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1666  dihydrodipicolinate synthase  31.62 
 
 
301 aa  159  6e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.458011  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0615  dihydrodipicolinate synthase  31.85 
 
 
307 aa  154  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  32.19 
 
 
298 aa  155  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  32.25 
 
 
298 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  31.23 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  31.23 
 
 
298 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  31.23 
 
 
298 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  31.6 
 
 
297 aa  144  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  29.72 
 
 
298 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  29.03 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1047  N-acetylneuraminate lyase  32.59 
 
 
309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3342  dihydrodipicolinate synthase  30.77 
 
 
292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2548  Dihydrodipicolinate synthase  29.56 
 
 
371 aa  140  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1762  dihydrodipicolinate synthase  29.7 
 
 
293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0813  dihydrodipicolinate synthetase  29.97 
 
 
302 aa  138  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 
294 aa  137  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 
294 aa  138  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  30.77 
 
 
296 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  28.03 
 
 
303 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  30.58 
 
 
295 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1729  dihydrodipicolinate synthase  32.38 
 
 
297 aa  137  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0274763  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  28.99 
 
 
295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1620  dihydrodipicolinate synthetase  30.63 
 
 
297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  31.46 
 
 
296 aa  136  5e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3709  dihydrodipicolinate synthetase  29.11 
 
 
294 aa  136  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.646628  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3538  dihydrodipicolinate synthetase  28.57 
 
 
294 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.423247  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 
296 aa  134  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  28.78 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  28.32 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  27.37 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  27.27 
 
 
290 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  29.06 
 
 
314 aa  133  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 
291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  30.31 
 
 
289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  28.47 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  28.32 
 
 
291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  27.01 
 
 
292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  27.01 
 
 
292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  27.01 
 
 
292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  27.01 
 
 
292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  27.01 
 
 
292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  27.01 
 
 
292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  27.01 
 
 
292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  29.97 
 
 
294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  27.01 
 
 
292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1453  putative dihydrodipicolinate synthase  30.71 
 
 
302 aa  130  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  29.07 
 
 
292 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0575  dihydrodipicolinate synthase  29.85 
 
 
296 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  27.96 
 
 
291 aa  130  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  30.1 
 
 
296 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  29.48 
 
 
297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  30.34 
 
 
297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  29.21 
 
 
294 aa  129  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  27.27 
 
 
291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0532  dihydrodipicolinate synthase, putative  30.71 
 
 
302 aa  129  7.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  29.51 
 
 
298 aa  129  7.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 
292 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  26.6 
 
 
332 aa  128  9.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0689  dihydrodipicolinate synthetase  27.08 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148381  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  29.62 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  29.89 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  28.06 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  29.24 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  30.6 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0756  dihydrodipicolinate synthase  30.45 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.706325 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  29.62 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3482  dihydrodipicolinate synthase  28.81 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000010244  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  28.3 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  30.51 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  29.43 
 
 
294 aa  126  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  30.8 
 
 
296 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  30.8 
 
 
296 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.57 
 
 
313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1217  dihydrodipicolinate synthetase  28.83 
 
 
293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  28.07 
 
 
307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  28.37 
 
 
294 aa  125  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  29.48 
 
 
294 aa  125  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  27.74 
 
 
301 aa  125  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  30.1 
 
 
289 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07550  dihydrodipicolinate synthase  28.03 
 
 
300 aa  125  8.000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.02513  normal  0.756847 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  26.22 
 
 
297 aa  125  8.000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  30.34 
 
 
292 aa  125  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  27.4 
 
 
300 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2280  dihydrodipicolinate synthetase  28.22 
 
 
306 aa  124  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0107583  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1735  dihydrodipicolinate synthase  33.18 
 
 
293 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00310784  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  28.92 
 
 
292 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  27.97 
 
 
292 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3408  dihydrodipicolinate synthetase  29.27 
 
 
294 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.169511  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3053  dihydrodipicolinate synthetase  29.27 
 
 
294 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.466068  normal  0.0327331 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  30.31 
 
 
293 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  27.05 
 
 
296 aa  124  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  28.57 
 
 
301 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  27.74 
 
 
300 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  27.34 
 
 
308 aa  123  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  30.32 
 
 
292 aa  124  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0670  dihydrodipicolinate synthase  29.96 
 
 
288 aa  123  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  27.74 
 
 
300 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>