More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3989 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3989  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 296 aa  607  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3408  dihydrodipicolinate synthetase  71.43 
 
 		 294 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.169511  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3053  dihydrodipicolinate synthetase  71.78 
 
 		 294 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.466068  normal  0.0327331 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1160  dihydrodipicolinate synthetase  52.63 
 
 		 296 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3538  dihydrodipicolinate synthetase  43.2 
 
 		 294 aa  241  7e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.423247  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3709  dihydrodipicolinate synthetase  43.2 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.646628  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0689  dihydrodipicolinate synthetase  41.18 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148381  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0646  dihydrodipicolinate synthetase  42.16 
 
 		 294 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  38.32 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  37.72 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  37.72 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  37.72 
 
 		 298 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 303 aa  159  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  34.8 
 
 		 298 aa  158  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  31.38 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  34.58 
 
 		 298 aa  152  8e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  31.23 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  30.31 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1626  dihydrodipicolinate synthase  34.74 
 
 		 296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0389231  hitchhiker  0.0000523491 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 290 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  32.28 
 
 		 295 aa  144  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  31.94 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  32.08 
 
 		 290 aa  143  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  34.76 
 
 		 290 aa  143  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  36.25 
 
 		 292 aa  142  8e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  32.12 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  32.41 
 
 		 290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2168  dihydrodipicolinate synthase  32.66 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  33.79 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  32.86 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0864  dihydrodipicolinate synthase  30.61 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  33.09 
 
 		 291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32.76 
 
 		 301 aa  139  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12766  dihydrodipicolinate synthase  37.09 
 
 		 300 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  30.61 
 
 		 297 aa  139  7e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_846  dihydrodipicolinate synthase  30.61 
 
 		 297 aa  139  7e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0670  dihydrodipicolinate synthase  32.63 
 
 		 288 aa  139  7e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  30.25 
 
 		 292 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  30.25 
 
 		 292 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  31.06 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  30.25 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  30.25 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  30.25 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  30.25 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  30.25 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  30.25 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  33.08 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  30.27 
 
 		 291 aa  136  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3342  dihydrodipicolinate synthase  31.97 
 
 		 292 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07550  dihydrodipicolinate synthase  32.86 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.02513  normal  0.756847 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  32.4 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  36.09 
 
 		 292 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1080  dihydrodipicolinate synthase  34.01 
 
 		 305 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  hitchhiker  0.00385638 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  30.95 
 
 		 290 aa  133  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  30.95 
 
 		 290 aa  132  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1762  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 301 aa  132  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4000  dihydrodipicolinate synthase  35.64 
 
 		 302 aa  132  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  29.69 
 
 		 297 aa  132  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3544  dihydrodipicolinate synthase  36.27 
 
 		 352 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.136616  normal  0.330927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  32.64 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2280  dihydrodipicolinate synthetase  33.92 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0107583  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2103  dihydrodipicolinate synthase  35.23 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  0.145144 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  32.35 
 
 		 290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  36 
 
 		 296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25250  dihydrodipicolinate synthase  32.43 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2116  dihydrodipicolinate synthase  35.23 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  30.15 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2241  dihydrodipicolinate synthase  34.39 
 
 		 307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.289873  normal  0.369345 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2162  dihydrodipicolinate synthase  35.23 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.3452  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  31.8 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  28.18 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  29.78 
 
 		 291 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2387  dihydrodipicolinate synthase  36 
 
 		 303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117065 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  29.17 
 
 		 296 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  30.14 
 
 		 296 aa  129  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  33.78 
 
 		 291 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  30.8 
 
 		 294 aa  129  9.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1199  dihydrodipicolinate synthase  32.52 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_002950  PG2052  dihydrodipicolinate synthase  34.36 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0341235 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  29.31 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3310  dihydrodipicolinate synthase  33.78 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  29.89 
 
 		 292 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  32.81 
 
 		 297 aa  126  3e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  29.37 
 
 		 291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  31.39 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  30.6 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0774  dihydrodipicolinate synthase  30.53 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.392848  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  32.14 
 
 		 296 aa  126  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  30.82 
 
 		 295 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  30.98 
 
 		 297 aa  125  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  32.86 
 
 		 291 aa  125  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  32.06 
 
 		 298 aa  125  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  30.21 
 
 		 291 aa  125  7e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0646  dihydrodipicolinate synthase  32.33 
 
 		 323 aa  125  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31968 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  29.68 
 
 		 314 aa  125  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  34.03 
 
 		 308 aa  125  7e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0615  dihydrodipicolinate synthase  31.93 
 
 		 307 aa  125  8.000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  34.01 
 
 		 300 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  30.82 
 
 		 295 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>