More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2280 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2280  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 306 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0107583  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  59.93 
 
 		 303 aa  358  7e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 		 298 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  33.9 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  33.82 
 
 		 298 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  33.82 
 
 		 298 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  33.82 
 
 		 298 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  31.53 
 
 		 291 aa  155  8e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  32.42 
 
 		 291 aa  155  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  35.62 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6099  dihydrodipicolinate synthetase  35.1 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  35.29 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  33.21 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0646  dihydrodipicolinate synthetase  32.35 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  33.33 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3520  N-acetylneuraminate lyase  31.8 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0303093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0689  dihydrodipicolinate synthetase  32.6 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148381  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  31.63 
 
 		 296 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  31.6 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3709  dihydrodipicolinate synthetase  32.12 
 
 		 294 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.646628  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3538  dihydrodipicolinate synthetase  32.12 
 
 		 294 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.423247  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03085  N-acetylneuraminate lyase  31.42 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0481  N-acetylneuraminate lyase  31.42 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0481  N-acetylneuraminate lyase  31.42 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.556937 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03036  hypothetical protein  31.42 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4542  N-acetylneuraminate lyase  31.42 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3413  N-acetylneuraminate lyase  31.42 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0759607  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3707  N-acetylneuraminate lyase  31.42 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0487465  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3551  N-acetylneuraminate lyase  31.42 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  32.06 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  30.74 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  30.03 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  31.63 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09012  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02270)  34.18 
 
 		 298 aa  144  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  31.85 
 
 		 291 aa  143  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3989  dihydrodipicolinate synthetase  33.92 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3530  N-acetylneuraminate lyase  31.52 
 
 		 297 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.224809  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  35.16 
 
 		 296 aa  142  9e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  34.69 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  28.81 
 
 		 291 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  29.79 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3602  N-acetylneuraminate lyase  31.16 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3699  N-acetylneuraminate lyase  31.16 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3532  N-acetylneuraminate lyase  31.16 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3637  N-acetylneuraminate lyase  31.16 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3661  N-acetylneuraminate lyase  31.42 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.529009  normal  0.169481 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  31.19 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  34.14 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3408  dihydrodipicolinate synthetase  34.38 
 
 		 294 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.169511  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  31.63 
 
 		 292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  30.82 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 		 332 aa  139  4.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  35.03 
 
 		 296 aa  139  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  30.95 
 
 		 294 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3053  dihydrodipicolinate synthetase  34.72 
 
 		 294 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.466068  normal  0.0327331 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3219  dihydrodipicolinate synthase  37.79 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  31.85 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  34.89 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  35.32 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  32.61 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  37.02 
 
 		 296 aa  136  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  34.69 
 
 		 296 aa  136  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2548  Dihydrodipicolinate synthase  27.76 
 
 		 371 aa  135  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 291 aa  135  7.000000000000001e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  34.15 
 
 		 308 aa  135  9e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  31.29 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  31.41 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  26.94 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  32.27 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  32.11 
 
 		 292 aa  132  5e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  27.49 
 
 		 292 aa  132  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23290  dihydrodipicolinate synthase  35.86 
 
 		 308 aa  132  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0408468 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  33.79 
 
 		 307 aa  132  6e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  34.01 
 
 		 308 aa  132  6e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0090  Dihydrodipicolinate synthase  28.22 
 
 		 289 aa  132  7.999999999999999e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  33.11 
 
 		 297 aa  132  9e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1199  dihydrodipicolinate synthase  35.56 
 
 		 321 aa  132  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  31.52 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  30.38 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  33.88 
 
 		 290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  29.45 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  33.88 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  35.02 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  30.31 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  33.91 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0349  dihydrodipicolinate synthase family protein  31.68 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  28.87 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  31.16 
 
 		 293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0406  dihydrodipicolinate synthase family protein  31.68 
 
 		 305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  29.83 
 
 		 292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  26.8 
 
 		 292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  26.8 
 
 		 292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  26.8 
 
 		 292 aa  129  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  26.8 
 
 		 292 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  26.8 
 
 		 292 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>