More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1449 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  100 
 
 		 304 aa  625  1e-178  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  64.14 
 
 		 304 aa  420  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  59.54 
 
 		 304 aa  395  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  60.2 
 
 		 304 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  61.84 
 
 		 304 aa  393  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  59.87 
 
 		 304 aa  391  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  51.85 
 
 		 304 aa  330  1e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  50.17 
 
 		 303 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4138  putative dihydrodipicolinate synthetase  47.02 
 
 		 305 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48000  putative dihydrodipicolinate synthetase  47.02 
 
 		 305 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00397266  normal  0.801152 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2517  dihydrodipicolinate synthetase  44.52 
 
 		 309 aa  308  9e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1838  dihydrodipicolinate synthetase  44.19 
 
 		 306 aa  306  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1886  hypothetical protein  44.52 
 
 		 390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2068  dihydrodipicolinate synthetase family protein  44.19 
 
 		 390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.790569  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2194  dihydrodipicolinate synthetase family protein  44.52 
 
 		 306 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1420  dihydrodipicolinate synthetase family protein  44.52 
 
 		 306 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0879  dihydrodipicolinate synthetase family protein  44.52 
 
 		 306 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0471  dihydrodipicolinate synthetase  44.52 
 
 		 306 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.230388  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0568  dihydrodipicolinate synthetase  44.52 
 
 		 306 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397945  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3380  dihydrodipicolinate synthetase  43.19 
 
 		 306 aa  298  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1895  dihydrodipicolinate synthetase  43.19 
 
 		 306 aa  298  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4227  dihydrodipicolinate synthetase  43.19 
 
 		 306 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0531975  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4139  dihydrodipicolinate synthetase  43.19 
 
 		 306 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.405813  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2066  dihydrodipicolinate synthetase  47.68 
 
 		 304 aa  294  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  47.06 
 
 		 305 aa  290  2e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0297  dihydrodipicolinate synthetase  47 
 
 		 306 aa  285  7e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.168579 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  46.13 
 
 		 301 aa  276  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2568  dihydrodipicolinate synthetase  47.33 
 
 		 304 aa  276  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  45.12 
 
 		 301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1417  putative dihydrodipicolinate synthetase  49.5 
 
 		 300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000330737  normal  0.0220995 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5222  dihydrodipicolinate synthetase  44.86 
 
 		 304 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0559955  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  45.12 
 
 		 301 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5586  dihydrodipicolinate synthetase  44.52 
 
 		 304 aa  268  8.999999999999999e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.285938  normal  0.789314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1479  dihydrodipicolinate synthetase  44.41 
 
 		 304 aa  268  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  43.43 
 
 		 310 aa  267  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1046  dihydrodipicolinate synthetase  42.81 
 
 		 304 aa  266  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01439  dihydrodipicolinate synthetase  40.2 
 
 		 302 aa  239  5e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2503  dihydrodipicolinate synthetase  41.67 
 
 		 304 aa  229  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143344  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3517  dihydrodipicolinate synthetase  41.58 
 
 		 299 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.787619 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  35.84 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6005  dihydrodipicolinate synthase family protein  34.81 
 
 		 297 aa  171  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0175155  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0085  dihydrodipicolinate synthetase  34.04 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  32.76 
 
 		 298 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  32.76 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  32.65 
 
 		 298 aa  166  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  31.96 
 
 		 298 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  31.62 
 
 		 298 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  32.65 
 
 		 298 aa  165  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  32.65 
 
 		 298 aa  165  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  32.65 
 
 		 298 aa  165  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  32.65 
 
 		 298 aa  165  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  31.6 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  32.06 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4110  dihydrodipicolinate synthetase  32.98 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5916  dihydrodipicolinate synthetase  34.41 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0538194  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  31.34 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4723  dihydrodipicolinate synthetase  31.19 
 
 		 310 aa  152  8.999999999999999e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  31.8 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  31.25 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  31.25 
 
 		 295 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  30.63 
 
 		 298 aa  149  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  30.29 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  29.17 
 
 		 290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  33.2 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  31.97 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  31.76 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  31.71 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4753  dihydrodipicolinate synthetase  30.28 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  31.97 
 
 		 289 aa  143  4e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  31.36 
 
 		 289 aa  142  7e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  35.22 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  28.28 
 
 		 291 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  28.12 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  31.06 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  30.8 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  30.21 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  33.83 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3716  dihydrodipicolinate synthetase  29.01 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  29.17 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  29.24 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  31.62 
 
 		 294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  29.07 
 
 		 294 aa  135  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  29.6 
 
 		 293 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  28.12 
 
 		 292 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  29.07 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  30.45 
 
 		 291 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  31.54 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09730  putative dihydrodipicolinate synthase  30.26 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000547803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  25.61 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2860  hypothetical protein  33.33 
 
 		 299 aa  132  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  30.71 
 
 		 293 aa  132  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  31.21 
 
 		 298 aa  133  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4834  dihydrodipicolinate synthetase  27.97 
 
 		 303 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  29.55 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  29.72 
 
 		 314 aa  132  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  28.78 
 
 		 291 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  28.82 
 
 		 295 aa  132  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  25.96 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  25.96 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  29.15 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>