More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2066 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2066  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 304 aa  608  1e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  58.8 
 
 		 301 aa  359  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  58.47 
 
 		 301 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  58.8 
 
 		 301 aa  350  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5222  dihydrodipicolinate synthetase  54.11 
 
 		 304 aa  326  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0559955  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3517  dihydrodipicolinate synthetase  62.46 
 
 		 299 aa  324  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.787619 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1046  dihydrodipicolinate synthetase  52.9 
 
 		 304 aa  320  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  52.38 
 
 		 304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  53.69 
 
 		 305 aa  310  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1479  dihydrodipicolinate synthetase  52.35 
 
 		 304 aa  307  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  50.17 
 
 		 303 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5586  dihydrodipicolinate synthetase  50.99 
 
 		 304 aa  301  9e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.285938  normal  0.789314 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  47.8 
 
 		 304 aa  296  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  47.68 
 
 		 304 aa  294  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  47.46 
 
 		 304 aa  293  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  50.33 
 
 		 310 aa  293  3e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  47.12 
 
 		 304 aa  290  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  46.1 
 
 		 304 aa  288  9e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2568  dihydrodipicolinate synthetase  49.15 
 
 		 304 aa  287  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1886  hypothetical protein  45.82 
 
 		 390 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0297  dihydrodipicolinate synthetase  49.83 
 
 		 306 aa  276  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.168579 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1420  dihydrodipicolinate synthetase family protein  45.82 
 
 		 306 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0568  dihydrodipicolinate synthetase  45.82 
 
 		 306 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397945  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2194  dihydrodipicolinate synthetase family protein  45.82 
 
 		 306 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0471  dihydrodipicolinate synthetase  45.82 
 
 		 306 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.230388  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0879  dihydrodipicolinate synthetase family protein  45.82 
 
 		 306 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600236  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1838  dihydrodipicolinate synthetase  43.14 
 
 		 306 aa  276  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1895  dihydrodipicolinate synthetase  45.48 
 
 		 306 aa  275  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4227  dihydrodipicolinate synthetase  45.48 
 
 		 306 aa  275  6e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0531975  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2517  dihydrodipicolinate synthetase  45.48 
 
 		 309 aa  275  6e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4139  dihydrodipicolinate synthetase  45.48 
 
 		 306 aa  275  6e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.405813  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3380  dihydrodipicolinate synthetase  45.15 
 
 		 306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4138  putative dihydrodipicolinate synthetase  45.48 
 
 		 305 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2068  dihydrodipicolinate synthetase family protein  44.82 
 
 		 390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.790569  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  46.28 
 
 		 304 aa  272  5.000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48000  putative dihydrodipicolinate synthetase  45.15 
 
 		 305 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00397266  normal  0.801152 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01439  dihydrodipicolinate synthetase  44.41 
 
 		 302 aa  248  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2503  dihydrodipicolinate synthetase  46.67 
 
 		 304 aa  244  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143344  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1417  putative dihydrodipicolinate synthetase  45.33 
 
 		 300 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000330737  normal  0.0220995 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  39.59 
 
 		 294 aa  189  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0085  dihydrodipicolinate synthetase  38.36 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6005  dihydrodipicolinate synthase family protein  39.1 
 
 		 297 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0175155  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4110  dihydrodipicolinate synthetase  37.82 
 
 		 307 aa  159  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3716  dihydrodipicolinate synthetase  35.09 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5916  dihydrodipicolinate synthetase  39.93 
 
 		 304 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0538194  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4723  dihydrodipicolinate synthetase  37.12 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  33.33 
 
 		 291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6698  putative dihydrodipicolinate synthase  34.26 
 
 		 303 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1759  dihydrodipicolinate synthetase  33.68 
 
 		 291 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0300118  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  31.6 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  32.52 
 
 		 294 aa  139  6e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  31.03 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  29.51 
 
 		 290 aa  136  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  31.77 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  31.23 
 
 		 298 aa  135  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  31.23 
 
 		 298 aa  135  8e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  31.23 
 
 		 298 aa  135  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  31.77 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  30.36 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5264  dihydrodipicolinate synthetase  28.37 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  32.72 
 
 		 295 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  33.09 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  32.31 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  33.46 
 
 		 295 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  30.56 
 
 		 291 aa  132  6e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  28.47 
 
 		 292 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  30.53 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  30.34 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  30.18 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  30.77 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  29.17 
 
 		 290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  30.18 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  30.18 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  33.2 
 
 		 295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 		 298 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  30.71 
 
 		 298 aa  128  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  30.18 
 
 		 298 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  31.91 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  28.47 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4834  dihydrodipicolinate synthetase  29.41 
 
 		 303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  29.97 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  29.31 
 
 		 290 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  28.97 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  29.64 
 
 		 298 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  31.62 
 
 		 294 aa  123  5e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7258  dihydrodipicolinate synthase  29.93 
 
 		 303 aa  122  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  31.4 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  28.72 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  30.74 
 
 		 292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  28.72 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  30.83 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4753  dihydrodipicolinate synthetase  30.56 
 
 		 305 aa  119  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  29.11 
 
 		 293 aa  119  7.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  29.07 
 
 		 295 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  30.2 
 
 		 292 aa  119  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  30.14 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1702  dihydrodipicolinate synthase  31.74 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000467042  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  29.14 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  29.63 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>