More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5916 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5916  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 304 aa  610  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0538194  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6005  dihydrodipicolinate synthase family protein  70.21 
 
 		 297 aa  417  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0175155  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4723  dihydrodipicolinate synthetase  52.23 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4110  dihydrodipicolinate synthetase  52.41 
 
 		 307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0085  dihydrodipicolinate synthetase  49.83 
 
 		 310 aa  278  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  48.58 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2503  dihydrodipicolinate synthetase  39.44 
 
 		 304 aa  189  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143344  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  41.3 
 
 		 304 aa  189  4e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  36.56 
 
 		 304 aa  186  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  35.84 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  36.56 
 
 		 304 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1838  dihydrodipicolinate synthetase  36.86 
 
 		 306 aa  179  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2068  dihydrodipicolinate synthetase family protein  35.96 
 
 		 390 aa  176  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.790569  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1895  dihydrodipicolinate synthetase  35.07 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4227  dihydrodipicolinate synthetase  35.07 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0531975  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3380  dihydrodipicolinate synthetase  35.07 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4139  dihydrodipicolinate synthetase  35.07 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.405813  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  37.59 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1886  hypothetical protein  35.42 
 
 		 390 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1420  dihydrodipicolinate synthetase family protein  35.42 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0879  dihydrodipicolinate synthetase family protein  35.42 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0471  dihydrodipicolinate synthetase  35.42 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.230388  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2194  dihydrodipicolinate synthetase family protein  35.42 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0568  dihydrodipicolinate synthetase  35.42 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397945  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  35.84 
 
 		 304 aa  170  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2066  dihydrodipicolinate synthetase  39.93 
 
 		 304 aa  168  8e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  36.76 
 
 		 303 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  39.36 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5586  dihydrodipicolinate synthetase  37.05 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.285938  normal  0.789314 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01439  dihydrodipicolinate synthetase  38.11 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  35.82 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2517  dihydrodipicolinate synthetase  34.56 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35455  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  34.41 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  35.11 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4138  putative dihydrodipicolinate synthetase  34.53 
 
 		 305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48000  putative dihydrodipicolinate synthetase  34.53 
 
 		 305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00397266  normal  0.801152 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  35.56 
 
 		 304 aa  159  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1479  dihydrodipicolinate synthetase  34.05 
 
 		 304 aa  155  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  33.09 
 
 		 310 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0297  dihydrodipicolinate synthetase  36.59 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.168579 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1417  putative dihydrodipicolinate synthetase  33.68 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000330737  normal  0.0220995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3517  dihydrodipicolinate synthetase  36.59 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.787619 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  35.16 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5222  dihydrodipicolinate synthetase  33.33 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0559955  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  34.55 
 
 		 293 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1046  dihydrodipicolinate synthetase  33.81 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  35.74 
 
 		 295 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  35.77 
 
 		 295 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  35.87 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  28.1 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  28.1 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  28.1 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  28.73 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  33.94 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2568  dihydrodipicolinate synthetase  33.33 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  28.73 
 
 		 298 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  28.47 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  28.79 
 
 		 298 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  32.99 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  28.36 
 
 		 298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  28.79 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  32.6 
 
 		 290 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  32.88 
 
 		 301 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  34.55 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  28 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  33.94 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  33.71 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  29.83 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  32.07 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  31.48 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  30.53 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  32.73 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  30.45 
 
 		 292 aa  127  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5264  dihydrodipicolinate synthetase  30.18 
 
 		 292 aa  126  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  29.82 
 
 		 294 aa  125  9e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  32.25 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  36.41 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  32.13 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4841  dihydrodipicolinate synthase  30.63 
 
 		 292 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00571792 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  30.8 
 
 		 290 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  33.7 
 
 		 295 aa  124  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  31.77 
 
 		 290 aa  123  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  34.06 
 
 		 295 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  34.06 
 
 		 295 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  32.34 
 
 		 332 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  31.02 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0956  putative dihydrodipicolinate synthase  31.75 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1958  dihydrodipicolinate synthase, putative  31.75 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0869  putative dihydrodipicolinate synthase  31.75 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  33.7 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1160  DapA_1  31.75 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1006  putative dihydrodipicolinate synthase  31.75 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0279  putative dihydrodipicolinate synthase  31.75 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0518166  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0999  putative dihydrodipicolinate synthase  31.75 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  29.41 
 
 		 289 aa  119  6e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  32.51 
 
 		 295 aa  119  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  29.86 
 
 		 291 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09730  putative dihydrodipicolinate synthase  31.48 
 
 		 303 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000547803  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>